More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2983 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2983  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 192 aa  373  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1929  30S ribosomal protein S5  81.29 
 
 		 189 aa  270  7e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  77.98 
 
 		 186 aa  254  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0563  30S ribosomal protein S5  71.73 
 
 		 189 aa  249  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  69.11 
 
 		 190 aa  247  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  76.69 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  0.00000059117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2671  30S ribosomal protein S5  68.82 
 
 		 199 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390109  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1371  30S ribosomal protein S5  73.84 
 
 		 189 aa  242  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.133817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1631  30S ribosomal protein S5  65.61 
 
 		 201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  71.78 
 
 		 187 aa  240  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  67.54 
 
 		 190 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1925  30S ribosomal protein S5  72.67 
 
 		 191 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0608  30S ribosomal protein S5  71.43 
 
 		 197 aa  238  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  67.91 
 
 		 189 aa  238  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  72.83 
 
 		 192 aa  237  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  72.83 
 
 		 192 aa  237  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  72.25 
 
 		 195 aa  236  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1778  30S ribosomal protein S5  72.46 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0732859  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  68.85 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1381  30S ribosomal protein S5  71.76 
 
 		 191 aa  235  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  72.67 
 
 		 192 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  70.66 
 
 		 189 aa  235  4e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  70.62 
 
 		 191 aa  235  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1349  30S ribosomal protein S5  65.41 
 
 		 189 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000960578  normal  0.199719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  71.34 
 
 		 185 aa  234  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  73.05 
 
 		 192 aa  234  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  65.41 
 
 		 189 aa  233  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  69.77 
 
 		 190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2312  30S ribosomal protein S5  71.18 
 
 		 191 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.324963  normal  0.444592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  66.3 
 
 		 189 aa  231  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  71.18 
 
 		 191 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3650  30S ribosomal protein S5  71.76 
 
 		 191 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1216  30S ribosomal protein S5  71.86 
 
 		 186 aa  229  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0776  30S ribosomal protein S5  68.32 
 
 		 188 aa  229  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0981589  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1179  30S ribosomal protein S5  71.26 
 
 		 186 aa  229  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139582  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1732  30S ribosomal protein S5  71.97 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0378  30S ribosomal protein S5  71.97 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.516384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2517  30S ribosomal protein S5  70.7 
 
 		 187 aa  227  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1336  30S ribosomal protein S5  68.9 
 
 		 239 aa  226  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2801  30S ribosomal protein S5  71.95 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1266  30S ribosomal protein S5  73.17 
 
 		 237 aa  223  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0807868  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  64.9 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0595  30S ribosomal protein S5  58.39 
 
 		 174 aa  194  8.000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0331863  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0664  30S ribosomal protein S5  58.54 
 
 		 170 aa  193  1e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0314639  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0426  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 174 aa  191  6e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.712709  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0340  ribosomal protein S5  55.76 
 
 		 171 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000051388  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  59.04 
 
 		 172 aa  188  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  60.67 
 
 		 162 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 162 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 162 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  57.33 
 
 		 162 aa  185  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  58.23 
 
 		 163 aa  184  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  58.23 
 
 		 163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  57.83 
 
 		 173 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  54.88 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 173 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 173 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  55.35 
 
 		 172 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 		 166 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 		 166 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  57.23 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  57.96 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  56.6 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0492  30S ribosomal protein S5  55.97 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.166117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3300  30S ribosomal protein S5  55.35 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  54.72 
 
 		 172 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3280  30S ribosomal protein S5  55.35 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00328937  hitchhiker  0.0000684502 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0344  30S ribosomal protein S5  55.83 
 
 		 172 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.023774  normal  0.0422128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 164 aa  177  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0293  30S ribosomal protein S5  55.83 
 
 		 172 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000423701  normal  0.0414454 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0067  30S ribosomal protein S5  53.61 
 
 		 169 aa  177  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00817055  hitchhiker  0.00000000000110208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2307  30S ribosomal protein S5  55.76 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000194348  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2742  30S ribosomal protein S5  55.83 
 
 		 172 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188185  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2933  30S ribosomal protein S5  55.35 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000097006 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0284  30S ribosomal protein S5  55.83 
 
 		 172 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0365  30S ribosomal protein S5  55.83 
 
 		 172 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 166 aa  177  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  54.44 
 
 		 197 aa  177  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  55.56 
 
 		 172 aa  177  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 		 166 aa  177  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  58 
 
 		 162 aa  177  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0070  30S ribosomal protein S5  53.01 
 
 		 172 aa  177  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.068486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  58 
 
 		 162 aa  177  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3932  30S ribosomal protein S5  55.42 
 
 		 172 aa  177  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0344  30S ribosomal protein S5  51.4 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0514  30S ribosomal protein S5  51.4 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0137335  unclonable  0.0000000000177209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2308  30S ribosomal protein S5  56.02 
 
 		 172 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0837042  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0411  30S ribosomal protein S5  52.44 
 
 		 168 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0386  30S ribosomal protein S5  52.44 
 
 		 168 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  58.23 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>