More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0643 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 162 aa  323  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  93.21 
 
 		 162 aa  301  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  84.57 
 
 		 162 aa  281  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  83.33 
 
 		 162 aa  275  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  83.33 
 
 		 162 aa  275  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  80.25 
 
 		 162 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  79.63 
 
 		 162 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  72.33 
 
 		 163 aa  233  7e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  75.64 
 
 		 168 aa  229  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  74.36 
 
 		 169 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  74.36 
 
 		 169 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  73.72 
 
 		 169 aa  221  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  66.67 
 
 		 166 aa  216  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  66.04 
 
 		 173 aa  214  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  68.15 
 
 		 164 aa  214  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  65.41 
 
 		 166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  66.67 
 
 		 166 aa  210  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  66.67 
 
 		 166 aa  208  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  64.15 
 
 		 166 aa  207  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  64.15 
 
 		 166 aa  207  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  61.88 
 
 		 165 aa  207  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  63.46 
 
 		 163 aa  206  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  64.15 
 
 		 166 aa  206  9e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  64.78 
 
 		 166 aa  205  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  63.46 
 
 		 163 aa  204  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  62.18 
 
 		 163 aa  204  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  63.52 
 
 		 168 aa  203  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  61.15 
 
 		 163 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  63.69 
 
 		 172 aa  200  7e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  62.42 
 
 		 172 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  62.42 
 
 		 172 aa  198  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 166 aa  197  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  61.15 
 
 		 172 aa  197  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  66.24 
 
 		 166 aa  196  7.999999999999999e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  61.29 
 
 		 172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  60.51 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  61.94 
 
 		 171 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 		 172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  60.51 
 
 		 172 aa  194  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  63.12 
 
 		 167 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  59.62 
 
 		 163 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  62.67 
 
 		 167 aa  194  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 166 aa  193  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  61.25 
 
 		 168 aa  193  9e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  61.84 
 
 		 173 aa  192  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2671  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 199 aa  191  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  62.03 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  60.93 
 
 		 175 aa  191  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  60.93 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  0.00000059117 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  61.64 
 
 		 168 aa  190  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 182 aa  189  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  62.03 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  62.03 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  57.76 
 
 		 174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  55.28 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  64.47 
 
 		 197 aa  187  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  60.13 
 
 		 190 aa  187  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2983  30S ribosomal protein S5  61.07 
 
 		 192 aa  187  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  57.23 
 
 		 189 aa  187  7e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 		 174 aa  186  9e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  58.13 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  60.93 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1371  30S ribosomal protein S5  58.17 
 
 		 189 aa  184  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.133817 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  63.16 
 
 		 210 aa  184  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 		 173 aa  184  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  61.88 
 
 		 180 aa  184  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0180  30S ribosomal protein S5  65.19 
 
 		 171 aa  183  7e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  58.39 
 
 		 167 aa  184  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  60 
 
 		 186 aa  182  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  60.25 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  56.49 
 
 		 190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0563  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1381  30S ribosomal protein S5  58 
 
 		 191 aa  181  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  55.97 
 
 		 189 aa  181  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  64.86 
 
 		 208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  58.94 
 
 		 192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  58.94 
 
 		 192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  58.94 
 
 		 192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 		 180 aa  180  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  58 
 
 		 191 aa  180  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1925  30S ribosomal protein S5  57.62 
 
 		 191 aa  180  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  58 
 
 		 192 aa  180  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3650  30S ribosomal protein S5  58.67 
 
 		 191 aa  180  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  58.23 
 
 		 169 aa  180  8.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000874802  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2312  30S ribosomal protein S5  57.33 
 
 		 191 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.324963  normal  0.444592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1349  30S ribosomal protein S5  55.97 
 
 		 189 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000960578  normal  0.199719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  55.97 
 
 		 189 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  61.84 
 
 		 200 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  55.56 
 
 		 190 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>