More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2671 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2671  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  74.86 
 
 		 186 aa  274  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0563  30S ribosomal protein S5  72 
 
 		 189 aa  257  9e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1778  30S ribosomal protein S5  73.14 
 
 		 201 aa  257  9e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0732859  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  68.42 
 
 		 190 aa  256  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  70.27 
 
 		 190 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  75.93 
 
 		 185 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  0.00000059117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1631  30S ribosomal protein S5  64.95 
 
 		 201 aa  252  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  72.41 
 
 		 186 aa  250  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  73.1 
 
 		 192 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  73.1 
 
 		 192 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  75.78 
 
 		 192 aa  247  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1371  30S ribosomal protein S5  72.09 
 
 		 189 aa  247  7e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.133817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  69.19 
 
 		 189 aa  246  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2983  30S ribosomal protein S5  76.25 
 
 		 192 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0608  30S ribosomal protein S5  72.67 
 
 		 197 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  72.35 
 
 		 195 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  70.35 
 
 		 190 aa  244  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  69.06 
 
 		 189 aa  244  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  68.16 
 
 		 189 aa  243  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  67.76 
 
 		 189 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1381  30S ribosomal protein S5  70.41 
 
 		 191 aa  242  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1349  30S ribosomal protein S5  67.76 
 
 		 189 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000960578  normal  0.199719 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  70.91 
 
 		 187 aa  241  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  72.29 
 
 		 185 aa  240  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1925  30S ribosomal protein S5  73.29 
 
 		 191 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2312  30S ribosomal protein S5  73.29 
 
 		 191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.324963  normal  0.444592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1336  30S ribosomal protein S5  70.3 
 
 		 239 aa  238  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_004310  BR1216  30S ribosomal protein S5  74.21 
 
 		 186 aa  237  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1179  30S ribosomal protein S5  73.58 
 
 		 186 aa  237  9e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139582  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3650  30S ribosomal protein S5  73.29 
 
 		 191 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  72.67 
 
 		 191 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2801  30S ribosomal protein S5  74.38 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  71.6 
 
 		 191 aa  235  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  73.58 
 
 		 192 aa  235  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1929  30S ribosomal protein S5  73.55 
 
 		 189 aa  232  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1266  30S ribosomal protein S5  71.95 
 
 		 237 aa  229  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0807868  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0776  30S ribosomal protein S5  68.07 
 
 		 188 aa  228  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0981589  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1732  30S ribosomal protein S5  67.88 
 
 		 187 aa  228  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0378  30S ribosomal protein S5  67.88 
 
 		 187 aa  228  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.516384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2517  30S ribosomal protein S5  67.27 
 
 		 187 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  64.94 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  57.58 
 
 		 173 aa  201  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  57.58 
 
 		 173 aa  201  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2308  30S ribosomal protein S5  59.01 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0837042  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  56.36 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3321  30S ribosomal protein S5  56.14 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  58.08 
 
 		 173 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0293  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 172 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000423701  normal  0.0414454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2742  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 172 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0344  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 172 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.023774  normal  0.0422128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0284  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 172 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0365  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 172 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 162 aa  192  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3464  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 		 172 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267646  normal  0.0371853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 162 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2822  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 172 aa  191  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137287  normal  0.25953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3627  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 172 aa  191  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000356902  hitchhiker  0.0000000000160734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  57.06 
 
 		 172 aa  190  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2615  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 		 172 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3759  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 		 172 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0375867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3495  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 		 172 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3787  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 		 172 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.773313  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0492  30S ribosomal protein S5  55.83 
 
 		 172 aa  190  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.166117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0331  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 		 172 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109277  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3729  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 		 172 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00614597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1941  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 		 172 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337273  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0266  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 		 172 aa  190  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118791  hitchhiker  0.0081122 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3152  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 		 172 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0854  30S ribosomal protein S5  59.88 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3051  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 		 172 aa  189  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0155994  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  58.39 
 
 		 172 aa  189  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09020  30S ribosomal protein S5  59.88 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.085618  normal  0.293269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 		 172 aa  188  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3300  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 		 172 aa  188  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  54.88 
 
 		 172 aa  186  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2933  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 		 172 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000097006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3280  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 		 172 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00328937  hitchhiker  0.0000684502 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0340  ribosomal protein S5  58.97 
 
 		 171 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000051388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 162 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  54.88 
 
 		 164 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0067  30S ribosomal protein S5  54.88 
 
 		 169 aa  184  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00817055  hitchhiker  0.00000000000110208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0070  30S ribosomal protein S5  54.27 
 
 		 172 aa  184  8e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.068486  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0471  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107379  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4732  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000128716  normal  0.628759 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3932  30S ribosomal protein S5  56.44 
 
 		 172 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0504  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566357  normal  0.161255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0501  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000260695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0595  30S ribosomal protein S5  55 
 
 		 174 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0331863  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06420  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 166 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0942299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0643  ribosomal protein S5  55.42 
 
 		 166 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00626233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4531  30S ribosomal protein S5  55.42 
 
 		 166 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00205716  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5053  30S ribosomal protein S5  56.77 
 
 		 172 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106855  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  54.97 
 
 		 170 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 162 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3892  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 166 aa  181  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000919521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 163 aa  180  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0664  30S ribosomal protein S5  54.27 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0314639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  56.52 
 
 		 168 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0426  30S ribosomal protein S5  51.18 
 
 		 174 aa  180  1e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.712709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>