More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0426 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0426  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 174 aa  340  4e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.712709  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0595  30S ribosomal protein S5  97.13 
 
 		 174 aa  335  9.999999999999999e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0331863  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0664  30S ribosomal protein S5  70.06 
 
 		 170 aa  250  8.000000000000001e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0314639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1631  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2983  30S ribosomal protein S5  58.71 
 
 		 192 aa  187  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  53.75 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 186 aa  184  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2671  30S ribosomal protein S5  51.5 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1778  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0732859  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  57.79 
 
 		 192 aa  178  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0608  30S ribosomal protein S5  51.23 
 
 		 197 aa  178  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  55.9 
 
 		 195 aa  178  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  57.79 
 
 		 192 aa  178  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  57.79 
 
 		 192 aa  178  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1929  30S ribosomal protein S5  55.92 
 
 		 189 aa  178  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  52.94 
 
 		 189 aa  177  4.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 190 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  55.97 
 
 		 191 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1732  30S ribosomal protein S5  50.62 
 
 		 187 aa  177  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0378  30S ribosomal protein S5  50.62 
 
 		 187 aa  177  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.516384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 187 aa  177  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1925  30S ribosomal protein S5  54.66 
 
 		 191 aa  177  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2312  30S ribosomal protein S5  55.97 
 
 		 191 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.324963  normal  0.444592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 190 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1349  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 189 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000960578  normal  0.199719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 192 aa  175  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 189 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2517  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  54.04 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 189 aa  175  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  56.95 
 
 		 186 aa  174  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  52.8 
 
 		 190 aa  174  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  0.00000059117 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0563  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 189 aa  174  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1381  30S ribosomal protein S5  54.09 
 
 		 191 aa  174  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1371  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 189 aa  174  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.133817 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0776  30S ribosomal protein S5  49.69 
 
 		 188 aa  173  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0981589  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_004310  BR1216  30S ribosomal protein S5  55.35 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1179  30S ribosomal protein S5  54.72 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139582  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3650  30S ribosomal protein S5  53.46 
 
 		 191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  53.33 
 
 		 177 aa  167  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1266  30S ribosomal protein S5  52.8 
 
 		 237 aa  166  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0807868  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2801  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 242 aa  166  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1336  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 239 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0354  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024846  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1837  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.470796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  49.69 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  50.33 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0475  30S ribosomal protein S5  51.83 
 
 		 166 aa  154  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0471  30S ribosomal protein S5  51.28 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107379  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0501  30S ribosomal protein S5  51.28 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000260695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06420  30S ribosomal protein S5  51.28 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0942299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4732  30S ribosomal protein S5  51.28 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000128716  normal  0.628759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0504  30S ribosomal protein S5  51.28 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566357  normal  0.161255 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0411  30S ribosomal protein S5  49.06 
 
 		 168 aa  150  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0386  30S ribosomal protein S5  49.06 
 
 		 168 aa  150  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0854  30S ribosomal protein S5  50.64 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  45.96 
 
 		 167 aa  150  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09020  30S ribosomal protein S5  50.64 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.085618  normal  0.293269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  46.31 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3892  30S ribosomal protein S5  50.64 
 
 		 166 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000919521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  44.12 
 
 		 179 aa  149  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0643  ribosomal protein S5  50.64 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00626233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4531  30S ribosomal protein S5  50.64 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00205716  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2307  30S ribosomal protein S5  51.57 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000194348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  46.5 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  49.69 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  47.65 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  49.68 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  48.73 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  47.13 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  47.24 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144419  unclonable  0.00000000000259852 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0506  30S ribosomal protein S5  48.43 
 
 		 171 aa  147  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0501  30S ribosomal protein S5  48.43 
 
 		 171 aa  147  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000846661  normal  0.0709882 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3507  30S ribosomal protein S5  47.8 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000462246  hitchhiker  0.0000000928534 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0293  30S ribosomal protein S5  47.8 
 
 		 172 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000423701  normal  0.0414454 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0344  30S ribosomal protein S5  47.8 
 
 		 172 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.023774  normal  0.0422128 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  49.04 
 
 		 167 aa  147  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2742  30S ribosomal protein S5  47.8 
 
 		 172 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188185  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  49.04 
 
 		 167 aa  147  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0284  30S ribosomal protein S5  47.8 
 
 		 172 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0365  30S ribosomal protein S5  47.8 
 
 		 172 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  44.59 
 
 		 166 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0067  30S ribosomal protein S5  46.39 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00817055  hitchhiker  0.00000000000110208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2822  30S ribosomal protein S5  48.43 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137287  normal  0.25953 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  49.04 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5062  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956097  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  50.34 
 
 		 174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0345  ribosomal protein S5  46.84 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0283353  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  49.04 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  49.04 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  49.04 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3627  30S ribosomal protein S5  48.43 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000356902  hitchhiker  0.0000000000160734 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0070  30S ribosomal protein S5  45.78 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.068486  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0331  30S ribosomal protein S5  47.8 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109277  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0736  30S ribosomal protein S5  48.48 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000183061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  46.91 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  46.91 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>