More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0736 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0736  30S ribosomal protein S5  100 
 
 
166 aa  330  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000183061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  80.72 
 
 
166 aa  277  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144419  unclonable  0.00000000000259852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  81.33 
 
 
166 aa  276  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0854  30S ribosomal protein S5  82.53 
 
 
166 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09020  30S ribosomal protein S5  82.53 
 
 
166 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.085618  normal  0.293269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3892  30S ribosomal protein S5  80.12 
 
 
166 aa  270  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000919521  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06420  30S ribosomal protein S5  80.72 
 
 
166 aa  269  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0942299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0471  30S ribosomal protein S5  79.52 
 
 
166 aa  265  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107379  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4732  30S ribosomal protein S5  79.52 
 
 
166 aa  265  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000128716  normal  0.628759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0501  30S ribosomal protein S5  79.52 
 
 
166 aa  265  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000260695  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0504  30S ribosomal protein S5  79.52 
 
 
166 aa  265  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566357  normal  0.161255 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  77.78 
 
 
170 aa  262  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0643  ribosomal protein S5  77.71 
 
 
166 aa  261  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00626233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4531  30S ribosomal protein S5  77.71 
 
 
166 aa  261  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00205716  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5062  30S ribosomal protein S5  78.79 
 
 
166 aa  261  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956097  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  77.71 
 
 
166 aa  259  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  77.11 
 
 
166 aa  258  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  77.11 
 
 
166 aa  258  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  77.11 
 
 
166 aa  258  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  76.51 
 
 
167 aa  258  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
167 aa  258  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
167 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
167 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
167 aa  258  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
167 aa  258  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
167 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
167 aa  258  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
167 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
167 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
167 aa  258  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
167 aa  258  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3734  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
166 aa  257  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000123332  decreased coverage  0.00107093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3897  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
167 aa  256  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777438  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0600  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
167 aa  256  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155795  normal  0.912114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0300  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
167 aa  256  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000391785  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03154  30S ribosomal protein S5  75.9 
 
 
167 aa  255  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03105  hypothetical protein  75.9 
 
 
167 aa  255  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00221736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4527  30S ribosomal protein S5  75.9 
 
 
167 aa  254  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000233492  hitchhiker  0.000167424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  78.98 
 
 
166 aa  254  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  75.61 
 
 
167 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  74.1 
 
 
166 aa  249  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3507  30S ribosomal protein S5  73.46 
 
 
167 aa  246  8e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000462246  hitchhiker  0.0000000928534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0443  30S ribosomal protein S5  75.64 
 
 
165 aa  246  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000313397  hitchhiker  0.000112579 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0506  30S ribosomal protein S5  73.01 
 
 
171 aa  242  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0501  30S ribosomal protein S5  73.01 
 
 
171 aa  242  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000846661  normal  0.0709882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  72.22 
 
 
168 aa  241  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0618  ribosomal protein S5  72.39 
 
 
169 aa  239  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001725  SSU ribosomal protein S5p (S2e)  72.78 
 
 
167 aa  238  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000199413  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00747  30S ribosomal protein S5  72.78 
 
 
167 aa  238  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  70.37 
 
 
168 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2307  30S ribosomal protein S5  75.64 
 
 
170 aa  237  5.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000194348  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  70.19 
 
 
167 aa  236  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  70.19 
 
 
167 aa  236  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  70.19 
 
 
167 aa  236  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0337  30S ribosomal protein S5  70.12 
 
 
166 aa  236  9e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00106169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  70.19 
 
 
167 aa  236  9e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  70.19 
 
 
167 aa  236  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  70.19 
 
 
167 aa  236  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0345  ribosomal protein S5  69.75 
 
 
167 aa  236  1e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0283353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  69.57 
 
 
167 aa  236  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  69.75 
 
 
168 aa  235  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  70.81 
 
 
167 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2157  30S ribosomal protein S5  72.15 
 
 
167 aa  233  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  68.94 
 
 
167 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000035229  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  68.94 
 
 
167 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  68.94 
 
 
167 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  68.94 
 
 
167 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000121956  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  71.97 
 
 
167 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2355  30S ribosomal protein S5  73.72 
 
 
169 aa  228  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2307  30S ribosomal protein S5  73.72 
 
 
167 aa  227  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0475  30S ribosomal protein S5  69.88 
 
 
166 aa  225  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0312  ribosomal protein S5  71.15 
 
 
169 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00213866  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0841  30S ribosomal protein S5  69.46 
 
 
167 aa  224  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2152  ribosomal protein S5  72.08 
 
 
168 aa  222  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.352454 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0340  ribosomal protein S5  66.26 
 
 
171 aa  221  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000051388  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0411  30S ribosomal protein S5  65.66 
 
 
168 aa  217  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0386  30S ribosomal protein S5  65.66 
 
 
168 aa  217  6e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0354  30S ribosomal protein S5  66.45 
 
 
168 aa  215  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024846  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1837  30S ribosomal protein S5  66.45 
 
 
168 aa  215  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.470796  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  62.96 
 
 
172 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0773  30S ribosomal protein S5  68.42 
 
 
180 aa  213  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.554764  normal  0.012841 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0450  30S ribosomal protein S5  67.11 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.948242  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3300  30S ribosomal protein S5  62.96 
 
 
172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0511  30S ribosomal protein S5  66.45 
 
 
179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.478223  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2822  30S ribosomal protein S5  62.96 
 
 
172 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137287  normal  0.25953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3627  30S ribosomal protein S5  62.96 
 
 
172 aa  210  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000356902  hitchhiker  0.0000000000160734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0331  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
172 aa  210  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109277  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0344  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
172 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.023774  normal  0.0422128 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0067  30S ribosomal protein S5  61.96 
 
 
169 aa  209  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00817055  hitchhiker  0.00000000000110208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2742  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
172 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0293  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
172 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000423701  normal  0.0414454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0284  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
172 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0365  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
172 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3729  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
172 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00614597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2615  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
172 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3759  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
172 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0375867  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3051  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
172 aa  208  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0155994  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0070  30S ribosomal protein S5  61.35 
 
 
172 aa  208  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.068486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1941  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
172 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337273  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0266  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
172 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118791  hitchhiker  0.0081122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>