More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0715 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  100 
 
 
189 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  84.66 
 
 
186 aa  318  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1216  30S ribosomal protein S5  89.82 
 
 
186 aa  307  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1179  30S ribosomal protein S5  89.22 
 
 
186 aa  307  6.999999999999999e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139582  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  88.1 
 
 
185 aa  302  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  82.87 
 
 
189 aa  300  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  81.77 
 
 
189 aa  300  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1349  30S ribosomal protein S5  82.32 
 
 
189 aa  299  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000960578  normal  0.199719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  80.66 
 
 
189 aa  294  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  77.9 
 
 
186 aa  276  9e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  81.33 
 
 
190 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0563  30S ribosomal protein S5  83.13 
 
 
189 aa  273  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  84.38 
 
 
185 aa  273  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  0.00000059117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  83.23 
 
 
195 aa  273  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  83.23 
 
 
192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  83.23 
 
 
192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  83.23 
 
 
192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1381  30S ribosomal protein S5  83.02 
 
 
191 aa  271  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1925  30S ribosomal protein S5  81.99 
 
 
191 aa  272  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  80.72 
 
 
190 aa  270  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  81.88 
 
 
190 aa  270  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1371  30S ribosomal protein S5  82.5 
 
 
189 aa  270  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.133817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2312  30S ribosomal protein S5  82.39 
 
 
191 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.324963  normal  0.444592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  80.62 
 
 
192 aa  266  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3650  30S ribosomal protein S5  83.02 
 
 
191 aa  265  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  81.76 
 
 
191 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1778  30S ribosomal protein S5  73.17 
 
 
201 aa  246  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0732859  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  73.08 
 
 
191 aa  241  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1631  30S ribosomal protein S5  68.75 
 
 
201 aa  241  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2671  30S ribosomal protein S5  68 
 
 
199 aa  239  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390109  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0776  30S ribosomal protein S5  72.44 
 
 
188 aa  239  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0981589  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1732  30S ribosomal protein S5  73.72 
 
 
187 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0378  30S ribosomal protein S5  73.72 
 
 
187 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.516384  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  70 
 
 
187 aa  238  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2517  30S ribosomal protein S5  73.08 
 
 
187 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2983  30S ribosomal protein S5  72.5 
 
 
192 aa  232  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0608  30S ribosomal protein S5  68.12 
 
 
197 aa  232  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424866  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1929  30S ribosomal protein S5  74.19 
 
 
189 aa  229  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2801  30S ribosomal protein S5  71.34 
 
 
242 aa  220  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1336  30S ribosomal protein S5  69.33 
 
 
239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1266  30S ribosomal protein S5  69.94 
 
 
237 aa  215  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0807868  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  57.22 
 
 
177 aa  205  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  61.9 
 
 
172 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0514  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
176 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0137335  unclonable  0.0000000000177209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0344  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
176 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0293  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  190  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000423701  normal  0.0414454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3464  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  191  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267646  normal  0.0371853 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0344  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.023774  normal  0.0422128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2742  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188185  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0284  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  190  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117552  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3932  30S ribosomal protein S5  62.84 
 
 
172 aa  191  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0365  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3152  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1941  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2615  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3759  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0375867  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0266  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118791  hitchhiker  0.0081122 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3787  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.773313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3729  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00614597  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2822  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137287  normal  0.25953 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3495  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  63.27 
 
 
173 aa  188  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3051  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  188  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0155994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3627  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
172 aa  188  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000356902  hitchhiker  0.0000000000160734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0331  30S ribosomal protein S5  61.9 
 
 
172 aa  187  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109277  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  57.23 
 
 
162 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  61.22 
 
 
173 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  61.22 
 
 
173 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 
162 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  63.27 
 
 
172 aa  185  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  60.67 
 
 
163 aa  185  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0336  30S ribosomal protein S5  53.37 
 
 
175 aa  184  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000198476  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 
162 aa  184  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0354  30S ribosomal protein S5  61.9 
 
 
168 aa  184  8e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024846  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1837  30S ribosomal protein S5  61.9 
 
 
168 aa  184  8e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.470796  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0067  30S ribosomal protein S5  61.9 
 
 
169 aa  184  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00817055  hitchhiker  0.00000000000110208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0070  30S ribosomal protein S5  61.22 
 
 
172 aa  184  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.068486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 
162 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  59.18 
 
 
172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06420  30S ribosomal protein S5  57.76 
 
 
166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0942299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5062  30S ribosomal protein S5  54.44 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956097  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0501  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 
166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000260695  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0471  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 
166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107379  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0504  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 
166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566357  normal  0.161255 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0411  30S ribosomal protein S5  57.23 
 
 
168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0386  30S ribosomal protein S5  57.23 
 
 
168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  59.18 
 
 
172 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3300  30S ribosomal protein S5  59.86 
 
 
172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3892  30S ribosomal protein S5  56.52 
 
 
166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000919521  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4732  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 
166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000128716  normal  0.628759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 
166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0595  30S ribosomal protein S5  58.97 
 
 
174 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0331863  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2307  30S ribosomal protein S5  58.97 
 
 
170 aa  181  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000194348  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  58.23 
 
 
170 aa  181  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0854  30S ribosomal protein S5  56.52 
 
 
166 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09020  30S ribosomal protein S5  56.52 
 
 
166 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.085618  normal  0.293269 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  59.86 
 
 
172 aa  180  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3507  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 
167 aa  180  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000462246  hitchhiker  0.0000000928534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3280  30S ribosomal protein S5  57.82 
 
 
172 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00328937  hitchhiker  0.0000684502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>