More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1929 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1929  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 189 aa  368  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2983  30S ribosomal protein S5  79.17 
 
 		 192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  74.33 
 
 		 186 aa  257  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0563  30S ribosomal protein S5  72.11 
 
 		 189 aa  248  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  75.6 
 
 		 187 aa  247  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  75.15 
 
 		 195 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  75.15 
 
 		 192 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  75.15 
 
 		 192 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  75.15 
 
 		 192 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  73.81 
 
 		 185 aa  241  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  0.00000059117 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1778  30S ribosomal protein S5  74.55 
 
 		 201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0732859  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  72.16 
 
 		 190 aa  240  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0776  30S ribosomal protein S5  71.6 
 
 		 188 aa  239  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0981589  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1925  30S ribosomal protein S5  72.19 
 
 		 191 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2671  30S ribosomal protein S5  67.03 
 
 		 199 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390109  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0608  30S ribosomal protein S5  71.43 
 
 		 197 aa  238  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  74.52 
 
 		 191 aa  238  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  73.1 
 
 		 190 aa  238  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  73.68 
 
 		 186 aa  238  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1732  30S ribosomal protein S5  75.8 
 
 		 187 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0378  30S ribosomal protein S5  75.8 
 
 		 187 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.516384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1371  30S ribosomal protein S5  75.47 
 
 		 189 aa  234  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.133817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  68.75 
 
 		 189 aa  235  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  68.93 
 
 		 189 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2517  30S ribosomal protein S5  74.52 
 
 		 187 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1381  30S ribosomal protein S5  76.77 
 
 		 191 aa  234  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  68.75 
 
 		 189 aa  234  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  75.16 
 
 		 190 aa  233  9e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3650  30S ribosomal protein S5  77.42 
 
 		 191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1631  30S ribosomal protein S5  67.65 
 
 		 201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  72.39 
 
 		 192 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2312  30S ribosomal protein S5  76.77 
 
 		 191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.324963  normal  0.444592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  68.18 
 
 		 189 aa  231  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1349  30S ribosomal protein S5  68.18 
 
 		 189 aa  231  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000960578  normal  0.199719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  76.13 
 
 		 191 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
NC_004310  BR1216  30S ribosomal protein S5  74.84 
 
 		 186 aa  228  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1179  30S ribosomal protein S5  74.19 
 
 		 186 aa  228  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139582  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  73.25 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1336  30S ribosomal protein S5  68.71 
 
 		 239 aa  222  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2801  30S ribosomal protein S5  71.07 
 
 		 242 aa  219  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1266  30S ribosomal protein S5  71.78 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0807868  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  60.61 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  63.82 
 
 		 163 aa  191  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  58.79 
 
 		 173 aa  188  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0492  30S ribosomal protein S5  55.09 
 
 		 172 aa  187  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.166117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 		 173 aa  187  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 		 173 aa  187  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 		 172 aa  187  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_002978  WD0664  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 		 170 aa  186  1e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0314639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  56.29 
 
 		 172 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  61.18 
 
 		 163 aa  185  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  59.04 
 
 		 166 aa  185  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 		 166 aa  184  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 163 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0595  30S ribosomal protein S5  56.88 
 
 		 174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0331863  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0340  ribosomal protein S5  57.5 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000051388  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  53.98 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 		 166 aa  181  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 		 166 aa  181  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2308  30S ribosomal protein S5  56.36 
 
 		 172 aa  180  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0837042  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2822  30S ribosomal protein S5  55.76 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137287  normal  0.25953 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2307  30S ribosomal protein S5  56.89 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000194348  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 172 aa  180  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  61.39 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0426  30S ribosomal protein S5  53.25 
 
 		 174 aa  180  1e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.712709  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4226  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 		 174 aa  180  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00793595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  59.33 
 
 		 162 aa  180  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  59.62 
 
 		 168 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  60.13 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0293  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000423701  normal  0.0414454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2742  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0344  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.023774  normal  0.0422128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3627  30S ribosomal protein S5  55.76 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000356902  hitchhiker  0.0000000000160734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0284  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0365  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0331  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109277  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3300  30S ribosomal protein S5  52.73 
 
 		 172 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  56.1 
 
 		 167 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0841  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 167 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  60.53 
 
 		 166 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  52.12 
 
 		 172 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  60.53 
 
 		 166 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  56.67 
 
 		 162 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3152  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3729  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00614597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2615  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052569  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3787  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.773313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3759  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0375867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3495  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0266  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118791  hitchhiker  0.0081122 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1941  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>