More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2260 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  100 
 
 
166 aa  327  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  100 
 
 
166 aa  327  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  98.19 
 
 
166 aa  322  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  76.97 
 
 
166 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  76.97 
 
 
166 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  76.97 
 
 
166 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  76.97 
 
 
166 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  76.97 
 
 
166 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  76.97 
 
 
166 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  76.97 
 
 
166 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  76.97 
 
 
166 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  76.97 
 
 
166 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  76.36 
 
 
166 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  75.15 
 
 
166 aa  245  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  72.73 
 
 
166 aa  240  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  73.33 
 
 
166 aa  241  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  67.88 
 
 
166 aa  217  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  65.45 
 
 
166 aa  214  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  67.68 
 
 
166 aa  211  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  66.06 
 
 
166 aa  210  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  68.59 
 
 
167 aa  209  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  65.45 
 
 
166 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  66.67 
 
 
164 aa  206  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  63.19 
 
 
165 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  63.19 
 
 
165 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  62.87 
 
 
167 aa  205  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  64.02 
 
 
168 aa  204  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2384  30S ribosomal protein S5  69.75 
 
 
168 aa  202  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0029509  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 
169 aa  200  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  60.84 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  63.52 
 
 
206 aa  198  3e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  60.37 
 
 
166 aa  197  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  60.48 
 
 
173 aa  197  7.999999999999999e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  63.23 
 
 
210 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  63.87 
 
 
210 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  67.1 
 
 
168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 
163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 
163 aa  194  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  63.92 
 
 
199 aa  193  9e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  56.88 
 
 
172 aa  193  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  63.64 
 
 
165 aa  193  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  60.9 
 
 
189 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  60.49 
 
 
186 aa  192  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  61.29 
 
 
172 aa  192  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  60.84 
 
 
167 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  64.94 
 
 
205 aa  192  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  58.58 
 
 
173 aa  191  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  58.23 
 
 
163 aa  191  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 
163 aa  191  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  57.23 
 
 
166 aa  191  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  59.28 
 
 
168 aa  191  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  61.01 
 
 
205 aa  191  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  58.58 
 
 
175 aa  191  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 
163 aa  191  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 
202 aa  190  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0075  30S ribosomal protein S5  70.32 
 
 
164 aa  190  8e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.774512  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  65.16 
 
 
168 aa  190  8e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000316  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  61.94 
 
 
200 aa  190  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 
202 aa  190  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  63.23 
 
 
200 aa  189  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 
166 aa  189  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  61.01 
 
 
165 aa  189  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  65.79 
 
 
197 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  61.88 
 
 
236 aa  188  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  56.1 
 
 
166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  64.47 
 
 
208 aa  188  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  55.76 
 
 
166 aa  188  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144419  unclonable  0.00000000000259852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  58.71 
 
 
172 aa  188  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  59.62 
 
 
189 aa  187  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  56.1 
 
 
166 aa  187  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0776  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 
188 aa  187  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0981589  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  56.1 
 
 
166 aa  187  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3734  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
166 aa  187  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000123332  decreased coverage  0.00107093 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  58.71 
 
 
171 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  58.06 
 
 
172 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  59.15 
 
 
169 aa  187  7e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0307  30S ribosomal protein S5  59.76 
 
 
174 aa  187  7e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  57.14 
 
 
179 aa  187  8e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  58.97 
 
 
186 aa  186  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  57.96 
 
 
163 aa  186  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  62.66 
 
 
238 aa  186  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  55.49 
 
 
167 aa  186  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
167 aa  186  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
167 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
167 aa  186  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
167 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
167 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
167 aa  186  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
167 aa  186  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
167 aa  186  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
167 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
167 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
166 aa  186  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 
167 aa  186  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  57.42 
 
 
172 aa  186  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  58.71 
 
 
172 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  58.86 
 
 
187 aa  185  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  58.71 
 
 
172 aa  186  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  61.33 
 
 
185 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 
191 aa  184  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>