More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3888 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  100 
 
 		 205 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  84.8 
 
 		 200 aa  284  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  85.63 
 
 		 202 aa  283  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  87.43 
 
 		 210 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  83.63 
 
 		 202 aa  282  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  85.63 
 
 		 210 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  80 
 
 		 236 aa  279  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  80.5 
 
 		 200 aa  278  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  80.57 
 
 		 238 aa  277  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  84.52 
 
 		 205 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  82.25 
 
 		 199 aa  275  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  77.33 
 
 		 222 aa  272  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  79.64 
 
 		 220 aa  271  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2642  ribosomal protein S5  88.24 
 
 		 214 aa  271  7e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  81.55 
 
 		 208 aa  270  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  77.78 
 
 		 223 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  77.78 
 
 		 223 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  77.78 
 
 		 223 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  80.86 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0604  ribosomal protein S5  82.12 
 
 		 218 aa  265  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.221884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  78.53 
 
 		 225 aa  264  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0644  ribosomal protein S5  85.71 
 
 		 218 aa  264  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.883982  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4298  30S ribosomal protein S5  80.87 
 
 		 204 aa  262  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3906  30S ribosomal protein S5  80.87 
 
 		 204 aa  261  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23630  SSU ribosomal protein S5P  86.67 
 
 		 227 aa  261  4e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  77.38 
 
 		 215 aa  261  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4490  ribosomal protein S5  83.33 
 
 		 204 aa  260  8.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0705  ribosomal protein S5  87.27 
 
 		 218 aa  260  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29570  SSU ribosomal protein S5P  86.75 
 
 		 223 aa  259  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.219662  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1140  ribosomal protein S5  83.33 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.5558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04150  30S ribosomal protein S5  85.63 
 
 		 209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6597  30S ribosomal protein S5  84.43 
 
 		 201 aa  251  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3126  ribosomal protein S5  83.44 
 
 		 226 aa  245  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20700  SSU ribosomal protein S5P  86.36 
 
 		 232 aa  244  4.9999999999999997e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.950879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1724  30S ribosomal protein S5  71.78 
 
 		 243 aa  239  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00276041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0948  ribosomal protein S5  84.18 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.10743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17000  SSU ribosomal protein S5P  77.38 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000450138  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0268  ribosomal protein S5  68.02 
 
 		 233 aa  234  6e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  67.72 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  65.58 
 
 		 182 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  69.08 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  63.29 
 
 		 164 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  66.45 
 
 		 167 aa  191  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  62.89 
 
 		 166 aa  191  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  62.75 
 
 		 173 aa  190  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  59.2 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  65.36 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  62.66 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  65.79 
 
 		 166 aa  188  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  65.33 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  65.33 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  65.33 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  61.44 
 
 		 175 aa  185  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  62.26 
 
 		 168 aa  185  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 167 aa  184  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 168 aa  184  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  53.65 
 
 		 189 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  64.05 
 
 		 167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  63.52 
 
 		 166 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  53.65 
 
 		 189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  62.75 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  63.82 
 
 		 166 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 167 aa  182  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 168 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000121956  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001725  SSU ribosomal protein S5p (S2e)  58.17 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000199413  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000035229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  60.51 
 
 		 173 aa  181  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 168 aa  181  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00747  30S ribosomal protein S5  58.17 
 
 		 167 aa  181  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 		 167 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 		 167 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 		 167 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 		 167 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 167 aa  180  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 167 aa  180  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 167 aa  180  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  63.82 
 
 		 166 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  63.82 
 
 		 166 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  63.82 
 
 		 166 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  63.82 
 
 		 166 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  63.82 
 
 		 166 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  63.82 
 
 		 166 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  63.82 
 
 		 166 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  63.82 
 
 		 166 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  52.6 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  63.82 
 
 		 166 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2157  30S ribosomal protein S5  58.17 
 
 		 167 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  63.16 
 
 		 166 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 166 aa  178  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 166 aa  178  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 167 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 167 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 167 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 167 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 167 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 167 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 167 aa  178  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>