More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0415 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  100 
 
 		 183 aa  357  6e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  61.73 
 
 		 215 aa  192  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  59.26 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  56.74 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 210 aa  191  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  59.2 
 
 		 205 aa  191  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 225 aa  191  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  59.51 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  58.9 
 
 		 223 aa  190  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  58.9 
 
 		 223 aa  190  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  58.9 
 
 		 223 aa  190  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  58.39 
 
 		 210 aa  189  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  59.88 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  58.71 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  60 
 
 		 197 aa  188  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  58.54 
 
 		 166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  58.9 
 
 		 238 aa  187  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 202 aa  187  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  58.02 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  59.49 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  56.6 
 
 		 175 aa  184  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  56.44 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  57.69 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  57.76 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  56.77 
 
 		 166 aa  180  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  55.97 
 
 		 173 aa  174  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 172 aa  174  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 166 aa  174  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4490  ribosomal protein S5  59.26 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3734  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000123332  decreased coverage  0.00107093 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  60.65 
 
 		 169 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2642  ribosomal protein S5  60 
 
 		 214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29570  SSU ribosomal protein S5P  59.38 
 
 		 223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.219662  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1724  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 243 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00276041  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 166 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3126  ribosomal protein S5  60.13 
 
 		 226 aa  171  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  54.09 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 166 aa  171  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  171  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 166 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 166 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 166 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  58.94 
 
 		 172 aa  170  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0644  ribosomal protein S5  60 
 
 		 218 aa  171  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.883982  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17000  SSU ribosomal protein S5P  58.02 
 
 		 249 aa  170  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000450138  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  54.88 
 
 		 163 aa  170  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0268  ribosomal protein S5  52.76 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03154  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03105  hypothetical protein  54.84 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00221736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  52.2 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0705  ribosomal protein S5  58.02 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0340  ribosomal protein S5  54.72 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000051388  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  53.95 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 167 aa  168  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0600  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 167 aa  168  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155795  normal  0.912114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3897  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 167 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777438  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0300  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 167 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000391785  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0604  ribosomal protein S5  56.25 
 
 		 218 aa  167  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.221884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4527  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 167 aa  167  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000233492  hitchhiker  0.000167424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  53.05 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 168 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23630  SSU ribosomal protein S5P  60.62 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  49.68 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6597  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  52.23 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144419  unclonable  0.00000000000259852 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04150  30S ribosomal protein S5  59.38 
 
 		 209 aa  165  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 166 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>