More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0859 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  100 
 
 		 182 aa  359  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  65.84 
 
 		 210 aa  205  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  63.8 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  65 
 
 		 208 aa  198  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  63.92 
 
 		 205 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  61.78 
 
 		 223 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  61.78 
 
 		 223 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  61.78 
 
 		 223 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  62.5 
 
 		 202 aa  194  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  62.5 
 
 		 202 aa  194  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  62.5 
 
 		 210 aa  194  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  57.23 
 
 		 172 aa  194  8.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 225 aa  193  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 220 aa  193  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  63.75 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  63.12 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  59.74 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  58.44 
 
 		 172 aa  191  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  63.23 
 
 		 200 aa  191  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 236 aa  190  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  61.39 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  57.79 
 
 		 172 aa  190  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  57.79 
 
 		 172 aa  190  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  59.15 
 
 		 164 aa  188  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  58.06 
 
 		 172 aa  187  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  58.02 
 
 		 173 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  55.84 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0180  30S ribosomal protein S5  61.49 
 
 		 171 aa  185  3e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  61.44 
 
 		 215 aa  184  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  55.84 
 
 		 172 aa  184  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1724  30S ribosomal protein S5  58.97 
 
 		 243 aa  184  7e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00276041  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  56.49 
 
 		 171 aa  183  9e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  58.06 
 
 		 174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  58.23 
 
 		 215 aa  181  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  54.09 
 
 		 165 aa  180  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  58.06 
 
 		 173 aa  180  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  60.78 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0268  ribosomal protein S5  56.49 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  57.42 
 
 		 174 aa  179  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0604  ribosomal protein S5  63.75 
 
 		 218 aa  178  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.221884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  62.25 
 
 		 162 aa  178  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1921  30S ribosomal protein S5  56.77 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0948  ribosomal protein S5  64.2 
 
 		 212 aa  177  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.10743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 168 aa  177  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 162 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  61.59 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  62.09 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 		 163 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  52.78 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  61.44 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  52.94 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  54.72 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4490  ribosomal protein S5  62.11 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 168 aa  174  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  56.38 
 
 		 178 aa  174  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  53.12 
 
 		 167 aa  174  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  56.38 
 
 		 178 aa  174  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 168 aa  174  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  53.12 
 
 		 167 aa  174  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  53.12 
 
 		 167 aa  174  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  53.12 
 
 		 167 aa  174  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  52.35 
 
 		 175 aa  174  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  52.5 
 
 		 167 aa  174  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  53.75 
 
 		 167 aa  174  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  54.22 
 
 		 189 aa  174  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2642  ribosomal protein S5  63.75 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  53.94 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  53.14 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  51.88 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  51.19 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  51.88 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  53.75 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  57.62 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0644  ribosomal protein S5  63.29 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.883982  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  51.76 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  50.85 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  56.1 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  51.88 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29570  SSU ribosomal protein S5P  62.5 
 
 		 223 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.219662  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  55.76 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04150  30S ribosomal protein S5  63.98 
 
 		 209 aa  171  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  51.92 
 
 		 166 aa  171  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 		 166 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  49.44 
 
 		 190 aa  171  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3126  ribosomal protein S5  63.52 
 
 		 226 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  58.17 
 
 		 166 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  51.88 
 
 		 167 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000121956  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  51.88 
 
 		 167 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 163 aa  171  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  51.88 
 
 		 167 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  51.88 
 
 		 167 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000035229  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  57.96 
 
 		 167 aa  170  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  59.09 
 
 		 168 aa  170  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  51.45 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>