More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0773 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  100 
 
 
177 aa  350  5.9999999999999994e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  70.39 
 
 
178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  70.39 
 
 
178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  61.4 
 
 
176 aa  209  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1121  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.421143  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  56.13 
 
 
176 aa  176  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  56.41 
 
 
166 aa  174  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 
166 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  54.19 
 
 
182 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 
166 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 
166 aa  168  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  53.29 
 
 
173 aa  167  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  52.87 
 
 
173 aa  166  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  52.1 
 
 
172 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 
168 aa  164  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1268  ribosomal protein S5  52.53 
 
 
165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  50 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  50.64 
 
 
164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1850  30S ribosomal protein S5  51.66 
 
 
177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.697613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  49.04 
 
 
200 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  52.56 
 
 
166 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  52.26 
 
 
166 aa  160  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  51.3 
 
 
172 aa  160  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  50.61 
 
 
179 aa  160  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  50.63 
 
 
183 aa  160  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  54.3 
 
 
162 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  46.43 
 
 
166 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144419  unclonable  0.00000000000259852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  52.56 
 
 
166 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2615  30S ribosomal protein S5  46.67 
 
 
172 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052569  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3729  30S ribosomal protein S5  46.67 
 
 
172 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00614597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1941  30S ribosomal protein S5  46.67 
 
 
172 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337273  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3759  30S ribosomal protein S5  46.67 
 
 
172 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0375867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3152  30S ribosomal protein S5  46.67 
 
 
172 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3051  30S ribosomal protein S5  46.67 
 
 
172 aa  158  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0155994  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0266  30S ribosomal protein S5  46.67 
 
 
172 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118791  hitchhiker  0.0081122 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  53.5 
 
 
167 aa  158  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  51.28 
 
 
166 aa  158  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3495  30S ribosomal protein S5  46.67 
 
 
172 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  53.59 
 
 
190 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3787  30S ribosomal protein S5  46.67 
 
 
172 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.773313  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2822  30S ribosomal protein S5  46.67 
 
 
172 aa  158  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137287  normal  0.25953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  53.64 
 
 
162 aa  157  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 
180 aa  157  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  52.17 
 
 
210 aa  157  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  51.76 
 
 
197 aa  157  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  52.9 
 
 
166 aa  157  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 
166 aa  157  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 
180 aa  157  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  53.12 
 
 
167 aa  157  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  48.24 
 
 
172 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2216  30S ribosomal protein S5  47.53 
 
 
180 aa  156  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.622812  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  45.16 
 
 
172 aa  156  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 
179 aa  156  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  45.73 
 
 
168 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001725  SSU ribosomal protein S5p (S2e)  45.56 
 
 
167 aa  156  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000199413  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3627  30S ribosomal protein S5  46.06 
 
 
172 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000356902  hitchhiker  0.0000000000160734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3464  30S ribosomal protein S5  45.45 
 
 
172 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267646  normal  0.0371853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  55.41 
 
 
182 aa  155  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0344  30S ribosomal protein S5  45.45 
 
 
172 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.023774  normal  0.0422128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2742  30S ribosomal protein S5  45.45 
 
 
172 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0293  30S ribosomal protein S5  45.45 
 
 
172 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000423701  normal  0.0414454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0284  30S ribosomal protein S5  45.45 
 
 
172 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0365  30S ribosomal protein S5  45.45 
 
 
172 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00747  30S ribosomal protein S5  45.56 
 
 
167 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  43.64 
 
 
172 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  45.73 
 
 
168 aa  155  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0331  30S ribosomal protein S5  45.45 
 
 
172 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109277  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  51.25 
 
 
205 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  52.98 
 
 
162 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  52.26 
 
 
168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  53.64 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  46.2 
 
 
166 aa  154  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2157  30S ribosomal protein S5  44.97 
 
 
167 aa  154  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  52.32 
 
 
162 aa  154  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  46.2 
 
 
166 aa  154  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  52.32 
 
 
162 aa  154  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  48.8 
 
 
167 aa  154  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  45.73 
 
 
168 aa  154  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  49.69 
 
 
168 aa  154  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  46.84 
 
 
167 aa  153  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  46.2 
 
 
166 aa  153  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  46.84 
 
 
167 aa  153  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  46.84 
 
 
167 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  48.72 
 
 
166 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  46.84 
 
 
167 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  46.84 
 
 
167 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3719  30S ribosomal protein S5  50.64 
 
 
173 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  46.84 
 
 
167 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  46.84 
 
 
167 aa  153  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  46.84 
 
 
167 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>