More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0998 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  100 
 
 
176 aa  333  9e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  62.18 
 
 
166 aa  193  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  56.63 
 
 
166 aa  184  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  57.83 
 
 
166 aa  184  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  57.23 
 
 
166 aa  184  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  59.01 
 
 
176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  58.79 
 
 
173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1121  30S ribosomal protein S5  58.06 
 
 
176 aa  182  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.421143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 
168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  61.54 
 
 
167 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  54.82 
 
 
166 aa  178  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  58.97 
 
 
167 aa  177  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  54.04 
 
 
172 aa  177  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 
177 aa  176  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  58.06 
 
 
164 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  57.69 
 
 
165 aa  175  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  57.69 
 
 
165 aa  175  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  54.22 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  54.22 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  54.22 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  54.22 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  54.22 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  54.22 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  55.77 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  54.22 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  54.22 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  54.22 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  53.61 
 
 
166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  53.61 
 
 
197 aa  171  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  54.66 
 
 
173 aa  169  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  57.59 
 
 
167 aa  170  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 
178 aa  169  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 
178 aa  169  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  56.41 
 
 
166 aa  168  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  55.7 
 
 
190 aa  168  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  55.19 
 
 
168 aa  167  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 
172 aa  167  7e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 
166 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 
172 aa  166  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 
172 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 
172 aa  165  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 
169 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 
169 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 
171 aa  166  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2216  30S ribosomal protein S5  54.04 
 
 
180 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.622812  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  55.77 
 
 
166 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  57.42 
 
 
169 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 
169 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 
179 aa  163  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 
180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 
172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  55.06 
 
 
162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  54 
 
 
166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  54 
 
 
166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2996  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.37992  normal  0.0218882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1308  30S ribosomal protein S5  56.49 
 
 
173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  54 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  52.38 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  54.73 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  52.56 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  51.55 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  51.55 
 
 
179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  58.5 
 
 
200 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 
168 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3719  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 
173 aa  160  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  56.76 
 
 
162 aa  160  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 
172 aa  160  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0707  30S ribosomal protein S5  55.84 
 
 
174 aa  160  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952409  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  52.12 
 
 
168 aa  160  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  56.38 
 
 
182 aa  160  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  58.62 
 
 
182 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 
180 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1268  ribosomal protein S5  52.56 
 
 
165 aa  160  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  56.08 
 
 
162 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2575  30S ribosomal protein S5  55.19 
 
 
174 aa  159  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  56.08 
 
 
162 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  50 
 
 
183 aa  158  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  54.25 
 
 
165 aa  158  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  50.63 
 
 
163 aa  159  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  50.63 
 
 
163 aa  158  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  52.53 
 
 
162 aa  157  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  52.6 
 
 
169 aa  157  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  50.65 
 
 
166 aa  157  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  50.97 
 
 
172 aa  157  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2602  30S ribosomal protein S5  52.38 
 
 
162 aa  157  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00539846  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  53.29 
 
 
163 aa  157  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  52.56 
 
 
170 aa  156  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  49.37 
 
 
163 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0233  30S ribosomal protein S5  55.19 
 
 
173 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.86106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0236  30S ribosomal protein S5  55.63 
 
 
173 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2890  ribosomal protein S5  53.06 
 
 
163 aa  156  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  49.37 
 
 
163 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 
162 aa  155  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  53.55 
 
 
172 aa  154  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  53.29 
 
 
161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 
174 aa  154  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  53.01 
 
 
205 aa  154  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2152  ribosomal protein S5  51.3 
 
 
168 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.352454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>