More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1121 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1121  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 176 aa  342  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.421143  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  77.84 
 
 		 176 aa  288  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  69.28 
 
 		 178 aa  228  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  69.28 
 
 		 178 aa  228  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  58.06 
 
 		 176 aa  182  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  54.42 
 
 		 166 aa  171  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  53.74 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 166 aa  167  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  51.68 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  49.68 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  53.06 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  53.06 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  53.06 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  53.06 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  53.06 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  53.06 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  53.06 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2996  30S ribosomal protein S5  48.82 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.37992  normal  0.0218882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  53.06 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  53.06 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  46.75 
 
 		 172 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  44.64 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  47.24 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  49.03 
 
 		 167 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  47.65 
 
 		 206 aa  158  3e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  48.75 
 
 		 168 aa  158  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  49.03 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  49.68 
 
 		 167 aa  158  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  49.66 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3734  30S ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 166 aa  157  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000123332  decreased coverage  0.00107093 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 167 aa  157  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  50.67 
 
 		 168 aa  157  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 166 aa  157  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  46.95 
 
 		 210 aa  156  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  50.66 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  49.36 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  47.59 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  47.56 
 
 		 205 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  50.34 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  44.24 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  48.95 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  50.98 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  48.63 
 
 		 166 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3719  30S ribosomal protein S5  47.5 
 
 		 173 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  50.98 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  48.78 
 
 		 200 aa  155  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  50.98 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0707  30S ribosomal protein S5  49.38 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  43.64 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  46.06 
 
 		 168 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  44.1 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  48.63 
 
 		 166 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  48.08 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  47.74 
 
 		 172 aa  156  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03154  30S ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  48.48 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03105  hypothetical protein  51.63 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00221736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  155  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2575  30S ribosomal protein S5  49.38 
 
 		 174 aa  154  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2890  ribosomal protein S5  51.02 
 
 		 163 aa  155  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2602  30S ribosomal protein S5  49.67 
 
 		 162 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00539846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  45.4 
 
 		 179 aa  154  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  51.3 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  51.3 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001725  SSU ribosomal protein S5p (S2e)  50 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000199413  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  46.71 
 
 		 172 aa  154  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1308  30S ribosomal protein S5  49.67 
 
 		 173 aa  154  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 166 aa  154  6e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00747  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  49.35 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  53.06 
 
 		 168 aa  154  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000035229  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000121956  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  46.71 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1268  ribosomal protein S5  48.39 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  47.65 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>