More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2920 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 166 aa  323  9e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  88.02 
 
 		 167 aa  286  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  78.31 
 
 		 166 aa  253  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  75.3 
 
 		 166 aa  249  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  75.76 
 
 		 165 aa  248  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  75.76 
 
 		 165 aa  248  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 		 166 aa  247  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  76.36 
 
 		 168 aa  246  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  75.3 
 
 		 166 aa  246  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  74.7 
 
 		 166 aa  245  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  74.1 
 
 		 166 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 		 167 aa  243  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  74.1 
 
 		 166 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  74.1 
 
 		 166 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  74.1 
 
 		 166 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  74.1 
 
 		 166 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  74.1 
 
 		 166 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  74.1 
 
 		 166 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  74.1 
 
 		 166 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  74.1 
 
 		 166 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  74.1 
 
 		 166 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  75.46 
 
 		 164 aa  242  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  73.49 
 
 		 166 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  70.91 
 
 		 166 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  69.88 
 
 		 166 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  73.01 
 
 		 168 aa  229  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  73.89 
 
 		 173 aa  228  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  70.73 
 
 		 168 aa  228  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  66.47 
 
 		 168 aa  210  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000874802  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  69.54 
 
 		 166 aa  207  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  69.54 
 
 		 166 aa  207  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  68.24 
 
 		 206 aa  207  6e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  68.15 
 
 		 167 aa  207  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  68.87 
 
 		 166 aa  206  8e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 169 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  63.8 
 
 		 169 aa  205  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 169 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  62.8 
 
 		 169 aa  204  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  61.45 
 
 		 179 aa  204  6e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 163 aa  203  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 168 aa  203  8e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  63.69 
 
 		 166 aa  203  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  64.56 
 
 		 162 aa  202  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 180 aa  202  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  65.84 
 
 		 162 aa  201  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  65.84 
 
 		 162 aa  201  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  62.73 
 
 		 169 aa  200  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  62.2 
 
 		 166 aa  200  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 		 179 aa  199  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  63.19 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  62.42 
 
 		 172 aa  198  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  61.15 
 
 		 172 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  61.78 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  61.78 
 
 		 172 aa  196  9e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  63.64 
 
 		 197 aa  196  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  59.24 
 
 		 171 aa  194  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  61.15 
 
 		 172 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  60.51 
 
 		 172 aa  194  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  60.24 
 
 		 173 aa  193  7e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 190 aa  193  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  58.9 
 
 		 175 aa  192  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  62.18 
 
 		 176 aa  193  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  59.88 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  62.11 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  62.03 
 
 		 162 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  60.87 
 
 		 162 aa  191  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  60.39 
 
 		 163 aa  190  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  64.47 
 
 		 210 aa  190  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  63.64 
 
 		 165 aa  190  8e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  57.23 
 
 		 163 aa  189  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  63.29 
 
 		 162 aa  189  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  56.6 
 
 		 163 aa  187  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  57.93 
 
 		 169 aa  186  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  56.41 
 
 		 172 aa  186  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  63.16 
 
 		 202 aa  186  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  63.16 
 
 		 202 aa  186  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  63.29 
 
 		 168 aa  185  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000316  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  62.75 
 
 		 205 aa  184  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  61.94 
 
 		 199 aa  184  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  184  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  61.84 
 
 		 210 aa  183  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  62.5 
 
 		 200 aa  183  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  63.82 
 
 		 205 aa  183  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  62.75 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  60.53 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  55.84 
 
 		 163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  58.17 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2384  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0029509  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  57.58 
 
 		 172 aa  181  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  61.84 
 
 		 236 aa  181  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  62.5 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  61.84 
 
 		 238 aa  180  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1890  30S ribosomal protein S5  67.31 
 
 		 164 aa  180  7e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0075  30S ribosomal protein S5  66.67 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.774512  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  54.88 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0679  30S ribosomal protein S5  63.51 
 
 		 254 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  55.77 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3932  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 172 aa  177  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 215 aa  176  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 215 aa  176  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>