More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1850 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1850  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 177 aa  352  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.697613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2602  30S ribosomal protein S5  63.09 
 
 		 162 aa  203  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00539846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2890  ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  51.27 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  52.98 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  54.3 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1268  ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  51.97 
 
 		 166 aa  163  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  51.32 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  53.69 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  51.66 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  53.02 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  47.59 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  49.02 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  50 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  54.17 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  52.32 
 
 		 200 aa  158  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  54.17 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  52.03 
 
 		 166 aa  158  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  50.62 
 
 		 173 aa  157  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  47.83 
 
 		 173 aa  157  7e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  53.47 
 
 		 166 aa  157  8e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  51.3 
 
 		 166 aa  157  9e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03154  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03105  hypothetical protein  50.65 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00221736  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  48.47 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  53.02 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  52.67 
 
 		 165 aa  156  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3734  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000123332  decreased coverage  0.00107093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  53.69 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2384  30S ribosomal protein S5  54.6 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0029509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  53.02 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  53.02 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  53.02 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  53.02 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  53.02 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  53.02 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  53.02 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  53.02 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  53.02 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  46.84 
 
 		 168 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  52.35 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  49.67 
 
 		 172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  52.29 
 
 		 208 aa  151  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  46.15 
 
 		 168 aa  151  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0282  30S ribosomal protein S5  46.15 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000515856  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  51.02 
 
 		 176 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1121  30S ribosomal protein S5  46.98 
 
 		 176 aa  150  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.421143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  45.51 
 
 		 168 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  46.45 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  50 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  50.62 
 
 		 168 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  46.45 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  46.45 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  46.45 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0600  30S ribosomal protein S5  48.05 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155795  normal  0.912114 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00747  30S ribosomal protein S5  46.5 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  47.1 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3897  30S ribosomal protein S5  48.05 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777438  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  52.35 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001725  SSU ribosomal protein S5p (S2e)  46.5 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000199413  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0300  30S ribosomal protein S5  48.05 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000391785  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1724  30S ribosomal protein S5  46.43 
 
 		 243 aa  149  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00276041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  51.33 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  50.33 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3932  30S ribosomal protein S5  46.3 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  46.93 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  45.81 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  51.01 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  45.81 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  49.67 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0268  ribosomal protein S5  48.3 
 
 		 233 aa  148  4e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2157  30S ribosomal protein S5  45.86 
 
 		 167 aa  148  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232198  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  49.34 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  50.34 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  50.34 
 
 		 169 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  45.16 
 
 		 167 aa  148  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  45.16 
 
 		 167 aa  148  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  50.34 
 
 		 169 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>