More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2384 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2384  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 168 aa  324  4.0000000000000003e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0029509  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  73.21 
 
 		 169 aa  243  8e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  74.85 
 
 		 166 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  74.85 
 
 		 166 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  74.23 
 
 		 166 aa  240  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  73.62 
 
 		 166 aa  236  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  73.62 
 
 		 166 aa  236  9e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  73.62 
 
 		 166 aa  236  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  73.62 
 
 		 166 aa  236  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  73.62 
 
 		 166 aa  236  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  73.62 
 
 		 166 aa  236  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  73.62 
 
 		 166 aa  236  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  73.62 
 
 		 166 aa  236  9e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  73.62 
 
 		 166 aa  236  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  73.01 
 
 		 166 aa  235  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0075  30S ribosomal protein S5  86.54 
 
 		 164 aa  232  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.774512  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1890  30S ribosomal protein S5  86.54 
 
 		 164 aa  229  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  71.25 
 
 		 165 aa  224  4e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  74.07 
 
 		 168 aa  216  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000316  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  69.68 
 
 		 167 aa  214  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  70.67 
 
 		 166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  70.67 
 
 		 166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  70.67 
 
 		 166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  67.28 
 
 		 164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  63.41 
 
 		 168 aa  209  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0307  30S ribosomal protein S5  66.06 
 
 		 174 aa  208  4e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  65.62 
 
 		 166 aa  207  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 		 166 aa  207  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  66.06 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  66.05 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  62.82 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 165 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 165 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  64.94 
 
 		 173 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  61.96 
 
 		 167 aa  194  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  61.78 
 
 		 163 aa  194  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  62.96 
 
 		 166 aa  194  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  63.58 
 
 		 168 aa  193  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  61.88 
 
 		 166 aa  193  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  55.69 
 
 		 172 aa  193  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  63.06 
 
 		 163 aa  191  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  62.82 
 
 		 163 aa  191  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  58.64 
 
 		 169 aa  189  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  61.96 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  61.21 
 
 		 197 aa  187  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  61.69 
 
 		 163 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  63.87 
 
 		 169 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  63.87 
 
 		 169 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  60.87 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  63.87 
 
 		 169 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  56.55 
 
 		 175 aa  186  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  56.29 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  59.04 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 166 aa  185  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  61.29 
 
 		 168 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0618  ribosomal protein S5  53.89 
 
 		 169 aa  180  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  55.62 
 
 		 166 aa  180  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  62.67 
 
 		 162 aa  180  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  57.93 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  60.65 
 
 		 162 aa  178  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 166 aa  177  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  60.65 
 
 		 162 aa  178  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  58.9 
 
 		 208 aa  177  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  63.27 
 
 		 162 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 202 aa  177  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 202 aa  177  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  53.37 
 
 		 165 aa  177  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  58.93 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  57.33 
 
 		 163 aa  176  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0736  30S ribosomal protein S5  55.9 
 
 		 166 aa  177  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000183061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  55.49 
 
 		 169 aa  176  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3734  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000123332  decreased coverage  0.00107093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0608  30S ribosomal protein S5  58.33 
 
 		 197 aa  175  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  53.75 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  55.09 
 
 		 179 aa  175  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  53.75 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  57.06 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 186 aa  174  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0506  30S ribosomal protein S5  56.8 
 
 		 171 aa  174  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144419  unclonable  0.00000000000259852 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0501  30S ribosomal protein S5  56.8 
 
 		 171 aa  174  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000846661  normal  0.0709882 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03154  30S ribosomal protein S5  53.75 
 
 		 167 aa  174  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  51.55 
 
 		 234 aa  174  6e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>