More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4009 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 180 aa  356  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  95.56 
 
 		 180 aa  339  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  79.31 
 
 		 179 aa  274  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  66.27 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  66.87 
 
 		 166 aa  215  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  64.6 
 
 		 173 aa  208  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  66.05 
 
 		 166 aa  206  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  63.58 
 
 		 166 aa  204  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  63.98 
 
 		 169 aa  201  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  63.35 
 
 		 169 aa  200  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  63.35 
 
 		 169 aa  200  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  62.96 
 
 		 168 aa  199  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  63.19 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  63.58 
 
 		 164 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  63.35 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  63.19 
 
 		 166 aa  198  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  63.8 
 
 		 166 aa  198  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  63.19 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  61.35 
 
 		 166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  61.94 
 
 		 190 aa  194  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  63.35 
 
 		 168 aa  194  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  62.2 
 
 		 167 aa  192  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  61.11 
 
 		 166 aa  192  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  60.84 
 
 		 168 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  63.98 
 
 		 163 aa  190  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  61.64 
 
 		 162 aa  187  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  61.64 
 
 		 162 aa  187  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  56.89 
 
 		 168 aa  185  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  55.56 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  55.56 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  60.25 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  61.11 
 
 		 166 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  59.15 
 
 		 167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 		 162 aa  181  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 		 162 aa  180  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 162 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  56.52 
 
 		 169 aa  180  8.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 162 aa  180  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 		 162 aa  180  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  67.35 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  59.64 
 
 		 215 aa  177  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  54.82 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  63.52 
 
 		 210 aa  175  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  54.27 
 
 		 179 aa  174  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  53.37 
 
 		 172 aa  174  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  64.63 
 
 		 225 aa  174  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  60.37 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  60.9 
 
 		 167 aa  174  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  52.15 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  61.78 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  53.09 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  64.63 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  64.63 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  52.76 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 163 aa  171  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 163 aa  171  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  59.64 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 163 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  52.15 
 
 		 172 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  52.17 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  58.28 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  58.28 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  58.28 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  64.63 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  57.62 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  58.28 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  58.28 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  51.92 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  61.64 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  57.4 
 
 		 236 aa  168  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  57.83 
 
 		 208 aa  167  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  52.56 
 
 		 172 aa  167  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  60.14 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 166 aa  167  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  59.29 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  60.65 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  54.12 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0075  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.774512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0736  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000183061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  165  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0468  30S ribosomal protein S5  56.55 
 
 		 172 aa  164  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>