More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0619 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 172 aa  340  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  70.24 
 
 		 174 aa  241  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  70.24 
 
 		 173 aa  239  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  69.05 
 
 		 174 aa  238  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3145  30S ribosomal protein S5  75 
 
 		 172 aa  234  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00134617  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  65.12 
 
 		 172 aa  224  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4360  30S ribosomal protein S5  74.42 
 
 		 171 aa  223  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000388544  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_002950  PG1921  30S ribosomal protein S5  66.27 
 
 		 172 aa  223  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5770  ribosomal protein S5  72.67 
 
 		 172 aa  221  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal  0.931759 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0180  30S ribosomal protein S5  67.47 
 
 		 171 aa  209  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  59.41 
 
 		 172 aa  203  9e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  58.24 
 
 		 172 aa  202  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  57.65 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  57.06 
 
 		 172 aa  200  8e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 		 172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  56.47 
 
 		 172 aa  197  7.999999999999999e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  61.39 
 
 		 163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  60.25 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  63.87 
 
 		 168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 		 162 aa  195  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  56.52 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 162 aa  193  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  61.39 
 
 		 162 aa  192  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  61.39 
 
 		 162 aa  192  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  65.16 
 
 		 169 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  65.16 
 
 		 169 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  64.52 
 
 		 169 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  60.65 
 
 		 182 aa  192  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  59.15 
 
 		 171 aa  191  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  60.76 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  56.97 
 
 		 166 aa  187  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  57.58 
 
 		 166 aa  184  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 166 aa  184  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  57.5 
 
 		 162 aa  184  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  55.35 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  55.83 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  56.25 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  54.72 
 
 		 163 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  60.65 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 166 aa  181  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 166 aa  181  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  56.36 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  53.94 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 165 aa  177  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 165 aa  177  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 		 210 aa  177  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  56.1 
 
 		 168 aa  178  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  55.21 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  54.72 
 
 		 163 aa  177  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  53.8 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 200 aa  175  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  57.5 
 
 		 205 aa  175  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  56.25 
 
 		 168 aa  174  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 236 aa  174  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 167 aa  175  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 168 aa  174  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 168 aa  174  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 238 aa  174  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  58.75 
 
 		 208 aa  174  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  58.13 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 202 aa  173  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000121956  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000035229  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  54.88 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 200 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  58.6 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  53.05 
 
 		 165 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 167 aa  171  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  57.24 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>