More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3145 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3145  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 172 aa  337  7e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00134617  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  75 
 
 		 172 aa  262  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4360  30S ribosomal protein S5  78.7 
 
 		 171 aa  243  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000388544  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5770  ribosomal protein S5  76.51 
 
 		 172 aa  235  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal  0.931759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  66.86 
 
 		 172 aa  223  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  63.1 
 
 		 174 aa  218  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  63.69 
 
 		 173 aa  218  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  62.5 
 
 		 174 aa  216  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  63.98 
 
 		 173 aa  209  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0180  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 		 171 aa  208  3e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_002950  PG1921  30S ribosomal protein S5  64.6 
 
 		 172 aa  207  5e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 172 aa  201  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  58.48 
 
 		 172 aa  200  8e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  57.65 
 
 		 172 aa  197  7.999999999999999e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  60.25 
 
 		 162 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  58.24 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  60.65 
 
 		 182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  57.06 
 
 		 172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  60.49 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  61.94 
 
 		 168 aa  194  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  58.79 
 
 		 171 aa  194  6e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  62.03 
 
 		 166 aa  194  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  60.51 
 
 		 162 aa  191  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  60.51 
 
 		 162 aa  191  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  59.88 
 
 		 166 aa  191  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  61.94 
 
 		 169 aa  191  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  57.83 
 
 		 162 aa  191  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  59.26 
 
 		 164 aa  190  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  62.42 
 
 		 173 aa  189  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  57.93 
 
 		 168 aa  189  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 		 162 aa  189  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  58.18 
 
 		 162 aa  187  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  55.76 
 
 		 166 aa  187  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  58.06 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  56.97 
 
 		 166 aa  184  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  57.23 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  56.77 
 
 		 163 aa  184  7e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 166 aa  183  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  59.15 
 
 		 168 aa  183  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  59.15 
 
 		 167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  53.46 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  58.6 
 
 		 175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  54.6 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  55.76 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  60 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  57.42 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  54.72 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 210 aa  180  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 166 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 163 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  60.53 
 
 		 205 aa  180  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  58.86 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 200 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  58.55 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  56.44 
 
 		 168 aa  177  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  57.69 
 
 		 167 aa  177  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  56.71 
 
 		 197 aa  177  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  59.87 
 
 		 200 aa  176  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 168 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000035229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  58.55 
 
 		 210 aa  175  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000121956  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  59.73 
 
 		 161 aa  175  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  59.73 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  56.05 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 202 aa  174  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 202 aa  174  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  174  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 167 aa  174  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 167 aa  174  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 166 aa  174  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>