More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4360 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4360  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 171 aa  340  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000388544  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5770  ribosomal protein S5  85.47 
 
 		 172 aa  269  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal  0.931759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  74.42 
 
 		 172 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3145  30S ribosomal protein S5  79.17 
 
 		 172 aa  237  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00134617  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  65.82 
 
 		 173 aa  213  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  65.12 
 
 		 172 aa  210  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  62.66 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  62.66 
 
 		 174 aa  206  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1921  30S ribosomal protein S5  60.84 
 
 		 172 aa  204  6e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0180  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 		 171 aa  201  3e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  64.71 
 
 		 173 aa  201  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  64.15 
 
 		 164 aa  199  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  59.88 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  61.45 
 
 		 166 aa  198  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  58.93 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  60.12 
 
 		 172 aa  197  7.999999999999999e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  64.05 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  59.52 
 
 		 172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  57.74 
 
 		 172 aa  193  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  59.76 
 
 		 171 aa  193  9e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  61.04 
 
 		 162 aa  193  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  62.42 
 
 		 169 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  62.42 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  62.42 
 
 		 169 aa  191  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  58.08 
 
 		 172 aa  191  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  60 
 
 		 182 aa  191  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  58.75 
 
 		 166 aa  190  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  60.53 
 
 		 205 aa  190  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  61.84 
 
 		 200 aa  190  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  59.74 
 
 		 162 aa  190  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  61.04 
 
 		 162 aa  189  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  61.18 
 
 		 205 aa  189  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  58.23 
 
 		 168 aa  188  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  58.33 
 
 		 166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  60.53 
 
 		 210 aa  187  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  60.53 
 
 		 202 aa  187  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  60.53 
 
 		 200 aa  187  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  60.53 
 
 		 202 aa  187  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  63.23 
 
 		 166 aa  187  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  58.23 
 
 		 199 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  57.96 
 
 		 163 aa  187  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  60.26 
 
 		 166 aa  187  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 166 aa  184  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  59.09 
 
 		 162 aa  184  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  60.13 
 
 		 168 aa  184  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  55 
 
 		 236 aa  184  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  59.09 
 
 		 162 aa  184  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 238 aa  183  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  58.55 
 
 		 210 aa  183  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  57.06 
 
 		 166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  62.18 
 
 		 168 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  57.23 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  55.97 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  58.97 
 
 		 167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  56.05 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  57.69 
 
 		 166 aa  181  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 163 aa  180  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  55.77 
 
 		 163 aa  180  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 175 aa  179  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  57.96 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  58.97 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  58.97 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 220 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 225 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  58.28 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  53.8 
 
 		 166 aa  177  9e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  58.67 
 
 		 179 aa  175  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  57.24 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  58.97 
 
 		 197 aa  175  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  53.12 
 
 		 215 aa  175  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 208 aa  174  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  49.69 
 
 		 168 aa  174  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  174  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  48.73 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000121956  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  48.73 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  48.73 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 		 163 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  48.73 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000035229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>