More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1164 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 174 aa  346  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  86.78 
 
 		 174 aa  305  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  87.86 
 
 		 173 aa  305  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  69.05 
 
 		 172 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_002950  PG1921  30S ribosomal protein S5  67.92 
 
 		 172 aa  218  3e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  61.59 
 
 		 172 aa  204  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0180  30S ribosomal protein S5  60.84 
 
 		 171 aa  193  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  58.23 
 
 		 162 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 		 166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  57.76 
 
 		 162 aa  188  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5770  ribosomal protein S5  63.16 
 
 		 172 aa  187  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal  0.931759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  55.9 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  57.06 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  55.76 
 
 		 166 aa  185  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3145  30S ribosomal protein S5  62.5 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00134617  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 		 166 aa  185  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  55.83 
 
 		 172 aa  184  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  58.13 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  55.83 
 
 		 172 aa  184  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  58.02 
 
 		 165 aa  184  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  58.02 
 
 		 165 aa  184  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  55.06 
 
 		 162 aa  184  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  55.83 
 
 		 172 aa  184  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  58.6 
 
 		 169 aa  183  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  64 
 
 		 168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  59.12 
 
 		 168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  54.17 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 162 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  54.76 
 
 		 171 aa  181  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 167 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  64 
 
 		 169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  54.6 
 
 		 172 aa  181  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4360  30S ribosomal protein S5  62.66 
 
 		 171 aa  181  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000388544  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 167 aa  180  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 168 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 168 aa  180  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 162 aa  180  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 162 aa  180  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  52.15 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  57.42 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 166 aa  178  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  56.29 
 
 		 167 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 		 166 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000121956  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000035229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03154  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 167 aa  177  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2307  30S ribosomal protein S5  54.6 
 
 		 170 aa  177  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000194348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03105  hypothetical protein  55.13 
 
 		 167 aa  177  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00221736  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  55.56 
 
 		 164 aa  177  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3734  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 166 aa  177  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000123332  decreased coverage  0.00107093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  61.29 
 
 		 166 aa  177  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  56.77 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3507  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000462246  hitchhiker  0.0000000928534 
 
 
-
 
NC_002936  DET0491  30S ribosomal protein S5  56.44 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0937948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2157  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4527  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 167 aa  175  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000233492  hitchhiker  0.000167424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  52.73 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>