More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1243 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  100 
 
 
169 aa  333  5.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  60.12 
 
 
168 aa  194  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 
163 aa  192  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  63.31 
 
 
169 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  60.74 
 
 
166 aa  192  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 
166 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  63.31 
 
 
169 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  62.72 
 
 
169 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 
162 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  61.35 
 
 
166 aa  191  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  58.79 
 
 
168 aa  190  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  58.54 
 
 
166 aa  190  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  58.9 
 
 
166 aa  189  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  58.23 
 
 
162 aa  189  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 
166 aa  189  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  58.02 
 
 
166 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  56.44 
 
 
164 aa  187  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  61.11 
 
 
168 aa  187  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  59.38 
 
 
162 aa  186  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  57.93 
 
 
166 aa  186  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  57.93 
 
 
166 aa  186  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 
166 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  57.06 
 
 
167 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  55.83 
 
 
173 aa  186  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  58.18 
 
 
167 aa  184  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  57.93 
 
 
166 aa  184  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  58.6 
 
 
174 aa  183  9e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 
169 aa  183  9e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  55 
 
 
162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  56.36 
 
 
168 aa  180  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  56.88 
 
 
162 aa  179  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  56.88 
 
 
162 aa  179  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  55 
 
 
163 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  53.37 
 
 
165 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  53.37 
 
 
165 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  56.71 
 
 
172 aa  179  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  54.44 
 
 
171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  54.88 
 
 
172 aa  178  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  55.62 
 
 
163 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  60.65 
 
 
166 aa  177  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 
162 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  59.48 
 
 
165 aa  176  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  53.75 
 
 
163 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  57.69 
 
 
172 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  53.66 
 
 
172 aa  175  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  51.5 
 
 
172 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  52.1 
 
 
172 aa  175  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 
163 aa  174  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  53.75 
 
 
163 aa  174  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  53.46 
 
 
172 aa  174  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 
173 aa  173  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  52.1 
 
 
172 aa  173  9e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4226  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 
174 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00793595  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  54.14 
 
 
174 aa  170  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  55.21 
 
 
197 aa  170  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0180  30S ribosomal protein S5  55.03 
 
 
171 aa  169  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_002950  PG1921  30S ribosomal protein S5  52.94 
 
 
172 aa  169  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0443  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 
165 aa  168  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000313397  hitchhiker  0.000112579 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  56.49 
 
 
167 aa  168  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  55.84 
 
 
192 aa  167  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  55.19 
 
 
186 aa  167  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  55.19 
 
 
191 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  57.42 
 
 
176 aa  166  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 
173 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  56.29 
 
 
166 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1925  30S ribosomal protein S5  55.84 
 
 
191 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2312  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 
191 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.324963  normal  0.444592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0492  30S ribosomal protein S5  49.7 
 
 
172 aa  165  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.166117  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  56.29 
 
 
166 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  53.01 
 
 
180 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  50.3 
 
 
170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  49.7 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3650  30S ribosomal protein S5  55.19 
 
 
191 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  54.84 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 
190 aa  165  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  55.19 
 
 
190 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 
190 aa  164  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  51.92 
 
 
168 aa  164  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  56.05 
 
 
179 aa  164  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 
195 aa  164  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  56.69 
 
 
173 aa  164  5e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06420  30S ribosomal protein S5  50.3 
 
 
166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0942299  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 
173 aa  164  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 
173 aa  164  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 
192 aa  163  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 
192 aa  163  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 
192 aa  163  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  47.95 
 
 
172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1631  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 
201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1381  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 
191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0677  30S ribosomal protein S5  59.6 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.780274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>