More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1921 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1921  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 172 aa  342  1e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  66.27 
 
 		 172 aa  223  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  64.88 
 
 		 172 aa  221  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  67.3 
 
 		 173 aa  219  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  67.92 
 
 		 174 aa  218  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  66.04 
 
 		 174 aa  215  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 172 aa  184  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3145  30S ribosomal protein S5  64.6 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00134617  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0180  30S ribosomal protein S5  56.63 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4360  30S ribosomal protein S5  60.84 
 
 		 171 aa  181  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000388544  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5770  ribosomal protein S5  61.05 
 
 		 172 aa  181  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal  0.931759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  54.97 
 
 		 172 aa  180  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  59.35 
 
 		 166 aa  180  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  55.97 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  56.77 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  55.35 
 
 		 172 aa  175  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 162 aa  174  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 163 aa  174  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  55.35 
 
 		 172 aa  174  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  55.29 
 
 		 197 aa  174  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 173 aa  174  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 166 aa  174  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 166 aa  174  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  54.09 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0300  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000391785  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0600  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155795  normal  0.912114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3897  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  51.28 
 
 		 163 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03154  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03105  hypothetical protein  53.85 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00221736  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  51.88 
 
 		 166 aa  171  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  55.97 
 
 		 166 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  54.09 
 
 		 164 aa  171  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 162 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  58.44 
 
 		 169 aa  170  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4527  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 		 167 aa  170  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000233492  hitchhiker  0.000167424 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0511  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.478223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  54.72 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  52.56 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  51.2 
 
 		 167 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  54.14 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3932  30S ribosomal protein S5  48.1 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  52.94 
 
 		 169 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  52.23 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  54.72 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3734  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000123332  decreased coverage  0.00107093 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  50.97 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  54.14 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4226  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 174 aa  168  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00793595  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  57.79 
 
 		 169 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  57.79 
 
 		 169 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  51.9 
 
 		 172 aa  168  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  53.8 
 
 		 168 aa  167  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  55.7 
 
 		 168 aa  167  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0450  30S ribosomal protein S5  53.75 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.948242  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 168 aa  167  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  52.56 
 
 		 163 aa  167  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  51.9 
 
 		 173 aa  167  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  51.57 
 
 		 172 aa  167  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 166 aa  167  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 166 aa  167  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 166 aa  167  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 166 aa  167  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 166 aa  167  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 166 aa  167  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 166 aa  167  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 166 aa  167  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 166 aa  167  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3729  30S ribosomal protein S5  48.54 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00614597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3787  30S ribosomal protein S5  48.54 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.773313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2615  30S ribosomal protein S5  48.54 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3152  30S ribosomal protein S5  48.54 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3759  30S ribosomal protein S5  48.54 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0375867  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3464  30S ribosomal protein S5  49.12 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267646  normal  0.0371853 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1941  30S ribosomal protein S5  48.54 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337273  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 190 aa  166  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 168 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0293  30S ribosomal protein S5  49.12 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000423701  normal  0.0414454 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0773  30S ribosomal protein S5  52.1 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.554764  normal  0.012841 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0284  30S ribosomal protein S5  49.12 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0365  30S ribosomal protein S5  49.12 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0344  30S ribosomal protein S5  49.12 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.023774  normal  0.0422128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>