More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1144 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1144  ribosomal protein S5  100 
 
 		 173 aa  345  2e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000788101  normal  0.0120151 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  65.32 
 
 		 173 aa  226  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  61.85 
 
 		 175 aa  218  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  65.61 
 
 		 179 aa  215  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  61.78 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  56.88 
 
 		 162 aa  184  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  57.96 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  56.25 
 
 		 162 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 		 162 aa  181  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 167 aa  180  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  60.13 
 
 		 205 aa  179  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  55.95 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  56.41 
 
 		 168 aa  177  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  58.06 
 
 		 162 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 166 aa  177  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  54.14 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  54.72 
 
 		 215 aa  175  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  58.82 
 
 		 208 aa  175  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  58.82 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  54.09 
 
 		 168 aa  175  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  56.77 
 
 		 162 aa  175  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  58.82 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  53.5 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  58.17 
 
 		 210 aa  174  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  55.97 
 
 		 222 aa  174  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  53.5 
 
 		 166 aa  173  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  54.72 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  56.69 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  55.97 
 
 		 225 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 167 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  56.97 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  55.97 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  55.62 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  55.9 
 
 		 169 aa  170  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  55.9 
 
 		 169 aa  170  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  53.5 
 
 		 187 aa  169  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  51.19 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  57.52 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  58.17 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  51.83 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  55.28 
 
 		 169 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  55 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  55.92 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  55.92 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  47.31 
 
 		 172 aa  168  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0337  30S ribosomal protein S5  51.25 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00106169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  57.52 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3300  30S ribosomal protein S5  47.9 
 
 		 172 aa  168  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00747  30S ribosomal protein S5  51.83 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2822  30S ribosomal protein S5  48.45 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137287  normal  0.25953 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001725  SSU ribosomal protein S5p (S2e)  51.83 
 
 		 167 aa  167  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000199413  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  167  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  52.83 
 
 		 236 aa  167  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 173 aa  167  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1778  30S ribosomal protein S5  52.17 
 
 		 201 aa  167  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0732859  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 173 aa  167  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0070  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.068486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  53.46 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0067  30S ribosomal protein S5  48.45 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00817055  hitchhiker  0.00000000000110208 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  53.5 
 
 		 223 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1724  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 243 aa  166  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00276041  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  53.5 
 
 		 223 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  51.53 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  53.5 
 
 		 223 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0266  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118791  hitchhiker  0.0081122 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3152  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  54.61 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1941  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3495  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3787  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.773313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2615  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  48.75 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3729  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00614597  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3759  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0375867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0293  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000423701  normal  0.0414454 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3627  30S ribosomal protein S5  48.45 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000356902  hitchhiker  0.0000000000160734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0331  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109277  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  52.2 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2742  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188185  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0284  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0365  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  52.83 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0344  30S ribosomal protein S5  47.83 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.023774  normal  0.0422128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>