More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0230 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0230  ribosomal protein S5  100 
 
 
221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0864228  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2238  ribosomal protein S5  88.58 
 
 
218 aa  393  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2429  30S ribosomal protein S5P  76.96 
 
 
215 aa  319  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2312  30S ribosomal protein S5P  73.6 
 
 
210 aa  301  5.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19422  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1848  30S ribosomal protein S5P  72.06 
 
 
210 aa  301  7.000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2233  30S ribosomal protein S5P  59.6 
 
 
205 aa  245  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0588103  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0090  30S ribosomal protein S5P  58.59 
 
 
208 aa  245  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00484292  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1708  30S ribosomal protein S5P  55.22 
 
 
203 aa  241  5e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233488  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0584  30S ribosomal protein S5P  60.1 
 
 
205 aa  241  7e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0462  30S ribosomal protein S5P  59.59 
 
 
207 aa  239  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.599903  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0552  30S ribosomal protein S5P  57.07 
 
 
205 aa  236  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.897256  normal  0.326676 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0021  30S ribosomal protein S5P  56.5 
 
 
211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000032462  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1501  ribosomal protein S5  51.64 
 
 
217 aa  226  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000598277  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0101  30S ribosomal protein S5P  55.56 
 
 
205 aa  224  7e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.827506 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0159  30S ribosomal protein S5P  52.76 
 
 
229 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0020988  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0664  30S ribosomal protein S5P  52.76 
 
 
229 aa  222  4e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00751538 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1254  30S ribosomal protein S5P  52.76 
 
 
229 aa  222  4e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0153949  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0779  30S ribosomal protein S5P  55.61 
 
 
202 aa  216  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1306  30S ribosomal protein S5P  53.57 
 
 
202 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0313  30S ribosomal protein S5P  54.21 
 
 
197 aa  209  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1404  30S ribosomal protein S5P  51.3 
 
 
221 aa  208  5e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0236  30S ribosomal protein S5P  50.77 
 
 
202 aa  208  5e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1206  30S ribosomal protein S5P  51.24 
 
 
202 aa  207  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.359791 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0730  30S ribosomal protein S5P  51.76 
 
 
225 aa  202  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0707  30S ribosomal protein S5P  50 
 
 
205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0239134  hitchhiker  0.000000000105394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1758  ribosomal protein S5  45.64 
 
 
214 aa  186  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0769972  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0111  30S ribosomal protein S5P  42.21 
 
 
214 aa  170  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0399  30S ribosomal protein S5P  41.94 
 
 
238 aa  168  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0467584 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04150  ribosomal protein S2, putative  41.5 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18532  Cytosolic 80S ribosomal protein S2; Cytosolic 40S small ribosomal subunit protein S2  40.91 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00101869  normal  0.0391039 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74777  40S ribosomal protein S2 (S4) (YS5) (RP12) (Omnipotent suppressor protein SUP44)  45 
 
 
252 aa  160  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518676  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48411  predicted protein  41.41 
 
 
264 aa  155  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03413  ribosomal protein S5 (AFU_orthologue; AFUA_7G01460)  43.65 
 
 
259 aa  150  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32264  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  37.11 
 
 
166 aa  95.9  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  37.58 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  37.11 
 
 
166 aa  95.1  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  36.84 
 
 
165 aa  95.1  7e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  39.16 
 
 
166 aa  95.1  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  36.48 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  36.48 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  36.48 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  36.48 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  36.48 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  36.48 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  36.48 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  36.48 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  36.48 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  37.66 
 
 
176 aa  93.2  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  38.46 
 
 
166 aa  93.2  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  38.46 
 
 
166 aa  93.2  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  35.76 
 
 
166 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  38.71 
 
 
177 aa  92.4  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  36.73 
 
 
176 aa  92.4  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  41.13 
 
 
178 aa  91.7  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  41.13 
 
 
178 aa  91.7  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  34.12 
 
 
169 aa  90.9  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1121  30S ribosomal protein S5  32.69 
 
 
176 aa  89.7  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.421143  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  37.58 
 
 
168 aa  89.4  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  33.79 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  35.29 
 
 
172 aa  89.4  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  36.24 
 
 
172 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  36.91 
 
 
172 aa  89  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  34.59 
 
 
180 aa  89  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  36.77 
 
 
168 aa  88.6  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  34.64 
 
 
172 aa  88.2  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  36.55 
 
 
174 aa  87.8  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  34.44 
 
 
166 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  34.59 
 
 
180 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  36.91 
 
 
172 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  38.71 
 
 
197 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  38.31 
 
 
169 aa  86.3  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 
172 aa  86.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  34.84 
 
 
162 aa  85.9  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2615  30S ribosomal protein S5  34 
 
 
172 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2933  30S ribosomal protein S5  31.33 
 
 
172 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000097006 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3759  30S ribosomal protein S5  34 
 
 
172 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0375867  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3280  30S ribosomal protein S5  31.33 
 
 
172 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00328937  hitchhiker  0.0000684502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3051  30S ribosomal protein S5  34 
 
 
172 aa  85.9  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0155994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3787  30S ribosomal protein S5  34 
 
 
172 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.773313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1941  30S ribosomal protein S5  34 
 
 
172 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337273  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  35.67 
 
 
173 aa  85.9  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0266  30S ribosomal protein S5  34 
 
 
172 aa  85.9  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118791  hitchhiker  0.0081122 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3729  30S ribosomal protein S5  34 
 
 
172 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00614597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3495  30S ribosomal protein S5  34 
 
 
172 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3152  30S ribosomal protein S5  34 
 
 
172 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2822  30S ribosomal protein S5  34 
 
 
172 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137287  normal  0.25953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  32.67 
 
 
173 aa  85.9  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3627  30S ribosomal protein S5  34 
 
 
172 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000356902  hitchhiker  0.0000000000160734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  32.67 
 
 
173 aa  85.9  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0331  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 
172 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109277  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  34.18 
 
 
172 aa  85.1  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  34.9 
 
 
171 aa  85.1  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5053  30S ribosomal protein S5  31.82 
 
 
172 aa  85.1  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106855  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  32 
 
 
172 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  31.33 
 
 
172 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3464  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 
172 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0267646  normal  0.0371853 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0344  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 
172 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.023774  normal  0.0422128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0284  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 
172 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117552  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0293  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 
172 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000423701  normal  0.0414454 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0365  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 
172 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0361301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>