More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0236 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0236  30S ribosomal protein S5P  100 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0779  30S ribosomal protein S5P  69.27 
 
 		 202 aa  285  4e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1306  30S ribosomal protein S5P  69.79 
 
 		 202 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0707  30S ribosomal protein S5P  69.95 
 
 		 205 aa  281  4.0000000000000003e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0239134  hitchhiker  0.000000000105394 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0313  30S ribosomal protein S5P  68.75 
 
 		 197 aa  278  3e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1206  30S ribosomal protein S5P  67.71 
 
 		 202 aa  277  1e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.359791 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1758  ribosomal protein S5  61.31 
 
 		 214 aa  265  5e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0769972  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0111  30S ribosomal protein S5P  61.81 
 
 		 214 aa  260  8e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1501  ribosomal protein S5  58.42 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000598277  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1254  30S ribosomal protein S5P  56.99 
 
 		 229 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0153949  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1708  30S ribosomal protein S5P  55.9 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233488  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0159  30S ribosomal protein S5P  56.99 
 
 		 229 aa  232  3e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0020988  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0664  30S ribosomal protein S5P  56.99 
 
 		 229 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00751538 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2233  30S ribosomal protein S5P  57.37 
 
 		 205 aa  227  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0588103  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0584  30S ribosomal protein S5P  58.95 
 
 		 205 aa  226  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0462  30S ribosomal protein S5P  56.84 
 
 		 207 aa  226  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.599903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0552  30S ribosomal protein S5P  56.32 
 
 		 205 aa  224  6e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.897256  normal  0.326676 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1404  30S ribosomal protein S5P  52.02 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0090  30S ribosomal protein S5P  52.55 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00484292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0021  30S ribosomal protein S5P  53.57 
 
 		 211 aa  220  9e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000032462  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0101  30S ribosomal protein S5P  55.56 
 
 		 205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.827506 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2312  30S ribosomal protein S5P  49.75 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19422  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1848  30S ribosomal protein S5P  48.76 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0730  30S ribosomal protein S5P  56.99 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0399  30S ribosomal protein S5P  50.53 
 
 		 238 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0467584 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2238  ribosomal protein S5  51.28 
 
 		 218 aa  211  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0230  ribosomal protein S5  50.77 
 
 		 221 aa  208  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0864228  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2429  30S ribosomal protein S5P  49.23 
 
 		 215 aa  202  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04150  ribosomal protein S2, putative  49.25 
 
 		 256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18532  Cytosolic 80S ribosomal protein S2; Cytosolic 40S small ribosomal subunit protein S2  47.74 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00101869  normal  0.0391039 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48411  predicted protein  45.73 
 
 		 264 aa  182  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74777  40S ribosomal protein S2 (S4) (YS5) (RP12) (Omnipotent suppressor protein SUP44)  45.96 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518676  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03413  ribosomal protein S5 (AFU_orthologue; AFUA_7G01460)  44.22 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32264  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  40 
 
 		 176 aa  95.1  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  36.31 
 
 		 173 aa  89  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8413  predicted protein  33.1 
 
 		 148 aa  85.9  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255193 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  36.18 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  36.18 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  34.44 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  32.54 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  31.51 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  33.56 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  39.19 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  30.2 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  30.92 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  35.37 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  35.26 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3932  30S ribosomal protein S5  28.67 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4226  30S ribosomal protein S5  30.82 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00793595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  35.37 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  30.2 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  36.05 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  30.2 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  30.2 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  29.53 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  28.66 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2308  30S ribosomal protein S5  30.14 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0837042  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  35.17 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  30.37 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0282  30S ribosomal protein S5  32.89 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000515856  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  32.72 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  34.25 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  31.51 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  31.01 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  33.79 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  33.1 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  30.52 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  33.79 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0492  30S ribosomal protein S5  30.2 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.166117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5053  30S ribosomal protein S5  28.19 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106855  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  29.87 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  30.77 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  33.56 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  29.63 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  30.38 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  30.77 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  29.45 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  28.83 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  33.78 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1121  30S ribosomal protein S5  33.81 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.421143  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  31.08 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  33.1 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3495  30S ribosomal protein S5  28.67 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2615  30S ribosomal protein S5  28.67 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052569  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3729  30S ribosomal protein S5  28.67 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00614597  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3759  30S ribosomal protein S5  28.67 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0375867  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3787  30S ribosomal protein S5  28.67 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.773313  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0344  30S ribosomal protein S5  28 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3051  30S ribosomal protein S5  28.67 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0155994  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0266  30S ribosomal protein S5  28.67 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118791  hitchhiker  0.0081122 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  31.08 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2822  30S ribosomal protein S5  28.67 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137287  normal  0.25953 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1941  30S ribosomal protein S5  28.67 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  30.77 
 
 		 167 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3152  30S ribosomal protein S5  28.67 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3627  30S ribosomal protein S5  28.67 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000356902  hitchhiker  0.0000000000160734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>