More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1708 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1708  30S ribosomal protein S5P  100 
 
 
203 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0021  30S ribosomal protein S5P  73.37 
 
 
211 aa  310  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000032462  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0090  30S ribosomal protein S5P  72.49 
 
 
208 aa  298  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00484292  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0584  30S ribosomal protein S5P  64.65 
 
 
205 aa  280  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0462  30S ribosomal protein S5P  63.18 
 
 
207 aa  276  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.599903  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0552  30S ribosomal protein S5P  61 
 
 
205 aa  271  6e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.897256  normal  0.326676 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2233  30S ribosomal protein S5P  61.11 
 
 
205 aa  270  9e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0588103  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1848  30S ribosomal protein S5P  63.21 
 
 
210 aa  269  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0101  30S ribosomal protein S5P  61.62 
 
 
205 aa  267  7e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.827506 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2312  30S ribosomal protein S5P  62.69 
 
 
210 aa  266  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1501  ribosomal protein S5  60.31 
 
 
217 aa  262  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000598277  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2429  30S ribosomal protein S5P  56.7 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2238  ribosomal protein S5  56.57 
 
 
218 aa  242  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0230  ribosomal protein S5  55.22 
 
 
221 aa  241  3.9999999999999997e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0864228  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1254  30S ribosomal protein S5P  53.54 
 
 
229 aa  239  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0153949  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0664  30S ribosomal protein S5P  53.54 
 
 
229 aa  239  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00751538 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1404  30S ribosomal protein S5P  53.85 
 
 
221 aa  239  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0159  30S ribosomal protein S5P  53.03 
 
 
229 aa  239  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0020988  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0779  30S ribosomal protein S5P  57.14 
 
 
202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0236  30S ribosomal protein S5P  55.9 
 
 
202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1306  30S ribosomal protein S5P  57.14 
 
 
202 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0313  30S ribosomal protein S5P  55.03 
 
 
197 aa  228  6e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1206  30S ribosomal protein S5P  53.89 
 
 
202 aa  226  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.359791 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0730  30S ribosomal protein S5P  52.53 
 
 
225 aa  222  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0707  30S ribosomal protein S5P  52.36 
 
 
205 aa  216  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0239134  hitchhiker  0.000000000105394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1758  ribosomal protein S5  50.26 
 
 
214 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0769972  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0111  30S ribosomal protein S5P  50.79 
 
 
214 aa  210  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0399  30S ribosomal protein S5P  48.17 
 
 
238 aa  191  8e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0467584 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04150  ribosomal protein S2, putative  46.27 
 
 
256 aa  185  5e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74777  40S ribosomal protein S2 (S4) (YS5) (RP12) (Omnipotent suppressor protein SUP44)  47.67 
 
 
252 aa  169  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518676  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18532  Cytosolic 80S ribosomal protein S2; Cytosolic 40S small ribosomal subunit protein S2  44.56 
 
 
273 aa  166  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00101869  normal  0.0391039 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48411  predicted protein  45.36 
 
 
264 aa  165  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03413  ribosomal protein S5 (AFU_orthologue; AFUA_7G01460)  43.52 
 
 
259 aa  164  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32264  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  38.26 
 
 
176 aa  101  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  38.62 
 
 
180 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  37.41 
 
 
165 aa  99  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  37.41 
 
 
165 aa  99  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  38.62 
 
 
180 aa  99  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  37.41 
 
 
165 aa  99  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  37.24 
 
 
177 aa  97.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  32 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  33.85 
 
 
234 aa  96.7  2e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  35.86 
 
 
172 aa  95.9  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  33.95 
 
 
173 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  36.55 
 
 
166 aa  95.1  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 
166 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 
166 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 
166 aa  94.7  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 
166 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 
166 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 
166 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 
166 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 
166 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 
166 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 
168 aa  94.7  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 
166 aa  94.7  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  34.76 
 
 
174 aa  94  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0274  30S ribosomal protein S5  36.48 
 
 
194 aa  94.4  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.129476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  36.55 
 
 
166 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  32 
 
 
172 aa  94  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  36.55 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  34.48 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  36.99 
 
 
168 aa  92.8  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  36.31 
 
 
173 aa  92.4  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  35.86 
 
 
158 aa  92.4  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0282  30S ribosomal protein S5  36.73 
 
 
189 aa  91.7  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000515856  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 
147 aa  91.7  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2064  30S ribosomal protein S5  37.93 
 
 
147 aa  91.3  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1858  30S ribosomal protein S5  37.93 
 
 
147 aa  91.3  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1687  30S ribosomal protein S5  37.93 
 
 
147 aa  91.3  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  35.67 
 
 
173 aa  91.3  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  34.48 
 
 
147 aa  90.5  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  35.37 
 
 
174 aa  90.9  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  34.48 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  33.56 
 
 
162 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  34.42 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  35.17 
 
 
162 aa  89.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1951  ribosomal protein S5  37.24 
 
 
147 aa  89.4  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  33.79 
 
 
162 aa  89.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  34.48 
 
 
162 aa  89.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  36.36 
 
 
166 aa  89  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  37.67 
 
 
169 aa  89  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  40 
 
 
166 aa  89.4  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  37.93 
 
 
169 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1921  30S ribosomal protein S5  36.55 
 
 
172 aa  88.2  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  36.3 
 
 
179 aa  87.8  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  34.48 
 
 
164 aa  87.8  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  34.46 
 
 
175 aa  87  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  34.42 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  34.48 
 
 
163 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  37.24 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  37.24 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  33.11 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  34.48 
 
 
172 aa  87  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  31.13 
 
 
173 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  31.13 
 
 
173 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  35.66 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1381  30S ribosomal protein S5  33.11 
 
 
191 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1308  30S ribosomal protein S5  31.94 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  33.11 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>