More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1404 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1404  30S ribosomal protein S5P  100 
 
 
221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1254  30S ribosomal protein S5P  85.84 
 
 
229 aa  394  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0153949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0159  30S ribosomal protein S5P  84.93 
 
 
229 aa  391  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0020988  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0664  30S ribosomal protein S5P  85.84 
 
 
229 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00751538 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0730  30S ribosomal protein S5P  84.47 
 
 
225 aa  368  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0090  30S ribosomal protein S5P  57.92 
 
 
208 aa  250  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00484292  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0552  30S ribosomal protein S5P  55.88 
 
 
205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.897256  normal  0.326676 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1501  ribosomal protein S5  57.65 
 
 
217 aa  241  5e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000598277  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0462  30S ribosomal protein S5P  58.33 
 
 
207 aa  240  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.599903  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1708  30S ribosomal protein S5P  53.85 
 
 
203 aa  239  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233488  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0584  30S ribosomal protein S5P  59.28 
 
 
205 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2233  30S ribosomal protein S5P  55.84 
 
 
205 aa  238  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0588103  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0779  30S ribosomal protein S5P  56.92 
 
 
202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0313  30S ribosomal protein S5P  56.02 
 
 
197 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0021  30S ribosomal protein S5P  55.15 
 
 
211 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000032462  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1306  30S ribosomal protein S5P  54.36 
 
 
202 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1206  30S ribosomal protein S5P  53.85 
 
 
202 aa  229  4e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.359791 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1848  30S ribosomal protein S5P  55.26 
 
 
210 aa  228  5e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0101  30S ribosomal protein S5P  53.3 
 
 
205 aa  226  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.827506 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2312  30S ribosomal protein S5P  54.74 
 
 
210 aa  224  6e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19422  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0236  30S ribosomal protein S5P  52.02 
 
 
202 aa  223  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0707  30S ribosomal protein S5P  51.04 
 
 
205 aa  220  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0239134  hitchhiker  0.000000000105394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1758  ribosomal protein S5  48.78 
 
 
214 aa  215  5e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0769972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2238  ribosomal protein S5  52.33 
 
 
218 aa  209  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0230  ribosomal protein S5  51.3 
 
 
221 aa  208  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0864228  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0111  30S ribosomal protein S5P  47.8 
 
 
214 aa  207  7e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2429  30S ribosomal protein S5P  47.6 
 
 
215 aa  206  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0399  30S ribosomal protein S5P  46.81 
 
 
238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0467584 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74777  40S ribosomal protein S2 (S4) (YS5) (RP12) (Omnipotent suppressor protein SUP44)  44.15 
 
 
252 aa  151  5.9999999999999996e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518676  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03413  ribosomal protein S5 (AFU_orthologue; AFUA_7G01460)  43.59 
 
 
259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32264  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18532  Cytosolic 80S ribosomal protein S2; Cytosolic 40S small ribosomal subunit protein S2  39.79 
 
 
273 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00101869  normal  0.0391039 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48411  predicted protein  42.79 
 
 
264 aa  146  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04150  ribosomal protein S2, putative  40.93 
 
 
256 aa  143  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  45.7 
 
 
165 aa  107  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  42.5 
 
 
176 aa  106  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  46.31 
 
 
166 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  46.31 
 
 
166 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  37.33 
 
 
172 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  43.23 
 
 
166 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  43.62 
 
 
168 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  37.2 
 
 
172 aa  101  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  44.3 
 
 
166 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  40.52 
 
 
234 aa  100  2e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  44.3 
 
 
166 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  42.38 
 
 
167 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  43.62 
 
 
166 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  43.62 
 
 
166 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  43.62 
 
 
166 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  43.62 
 
 
166 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  43.62 
 
 
166 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  43.62 
 
 
166 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  43.62 
 
 
166 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  43.62 
 
 
166 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  43.62 
 
 
166 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  40.65 
 
 
165 aa  99.4  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  40.65 
 
 
165 aa  99.4  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  43.62 
 
 
164 aa  98.2  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2602  30S ribosomal protein S5  40 
 
 
162 aa  98.2  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00539846  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  42.47 
 
 
203 aa  98.2  9e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2890  ribosomal protein S5  39.33 
 
 
163 aa  97.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  38.93 
 
 
177 aa  97.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0274  30S ribosomal protein S5  40.94 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.129476  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1858  30S ribosomal protein S5  39.6 
 
 
147 aa  96.3  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2064  30S ribosomal protein S5  39.6 
 
 
147 aa  96.3  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  41.45 
 
 
166 aa  96.3  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  41.67 
 
 
173 aa  96.3  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1687  30S ribosomal protein S5  39.6 
 
 
147 aa  96.3  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  40 
 
 
180 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  43.05 
 
 
167 aa  95.5  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  42.65 
 
 
178 aa  95.5  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  38.26 
 
 
158 aa  95.5  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  40.65 
 
 
166 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  42.65 
 
 
178 aa  95.5  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  41.4 
 
 
168 aa  95.1  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  39.6 
 
 
176 aa  94.7  9e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  40.94 
 
 
147 aa  94.4  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  39.6 
 
 
147 aa  94.4  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  38.51 
 
 
169 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  40.27 
 
 
180 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  40.82 
 
 
172 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  39.6 
 
 
162 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  40.13 
 
 
169 aa  92.8  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  39.22 
 
 
173 aa  93.2  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1850  30S ribosomal protein S5  38.93 
 
 
177 aa  92.8  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.697613 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0101  30S ribosomal protein S5  40.27 
 
 
146 aa  92.8  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  38.71 
 
 
162 aa  92  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  38.71 
 
 
162 aa  92  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  38.67 
 
 
206 aa  91.7  8e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  38.26 
 
 
162 aa  91.7  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1121  30S ribosomal protein S5  35.81 
 
 
176 aa  91.3  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.421143  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  42.58 
 
 
166 aa  91.7  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  38.26 
 
 
162 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  36.99 
 
 
173 aa  91.3  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  43.06 
 
 
166 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0282  30S ribosomal protein S5  36.91 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000515856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  43.06 
 
 
166 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  36.91 
 
 
174 aa  90.1  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3932  30S ribosomal protein S5  34.57 
 
 
172 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0492  30S ribosomal protein S5  39.74 
 
 
172 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.166117  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  38.46 
 
 
169 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>