More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0111 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0111  30S ribosomal protein S5P  100 
 
 		 214 aa  440  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1758  ribosomal protein S5  78.5 
 
 		 214 aa  356  9.999999999999999e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0769972  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0707  30S ribosomal protein S5P  63.18 
 
 		 205 aa  270  1e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0239134  hitchhiker  0.000000000105394 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1306  30S ribosomal protein S5P  60.61 
 
 		 202 aa  261  4e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0236  30S ribosomal protein S5P  61.81 
 
 		 202 aa  260  8.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0779  30S ribosomal protein S5P  57.58 
 
 		 202 aa  256  2e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0313  30S ribosomal protein S5P  58.85 
 
 		 197 aa  254  6e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1206  30S ribosomal protein S5P  57.07 
 
 		 202 aa  250  9.000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.359791 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1501  ribosomal protein S5  54.21 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000598277  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0584  30S ribosomal protein S5P  52.88 
 
 		 205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1708  30S ribosomal protein S5P  50.79 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233488  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1254  30S ribosomal protein S5P  50.25 
 
 		 229 aa  208  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0153949  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1404  30S ribosomal protein S5P  47.8 
 
 		 221 aa  207  7e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0664  30S ribosomal protein S5P  50.25 
 
 		 229 aa  207  8e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00751538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0462  30S ribosomal protein S5P  50.79 
 
 		 207 aa  207  9e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.599903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0159  30S ribosomal protein S5P  49.24 
 
 		 229 aa  206  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0020988  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0021  30S ribosomal protein S5P  47.98 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000032462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2233  30S ribosomal protein S5P  50 
 
 		 205 aa  204  8e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0588103  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0552  30S ribosomal protein S5P  48.95 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.897256  normal  0.326676 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1848  30S ribosomal protein S5P  45.64 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0090  30S ribosomal protein S5P  46.46 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00484292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0730  30S ribosomal protein S5P  49.24 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0101  30S ribosomal protein S5P  49.21 
 
 		 205 aa  192  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.827506 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2312  30S ribosomal protein S5P  45.13 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19422  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0399  30S ribosomal protein S5P  46.84 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0467584 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04150  ribosomal protein S2, putative  46 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74777  40S ribosomal protein S2 (S4) (YS5) (RP12) (Omnipotent suppressor protein SUP44)  47.52 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518676  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03413  ribosomal protein S5 (AFU_orthologue; AFUA_7G01460)  46.08 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32264  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2238  ribosomal protein S5  43.69 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2429  30S ribosomal protein S5P  42.05 
 
 		 215 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0230  ribosomal protein S5  42.21 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0864228  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18532  Cytosolic 80S ribosomal protein S2; Cytosolic 40S small ribosomal subunit protein S2  43.35 
 
 		 273 aa  170  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00101869  normal  0.0391039 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48411  predicted protein  44.5 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  34.97 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  36.91 
 
 		 176 aa  89  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  32.92 
 
 		 172 aa  87.8  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  34.16 
 
 		 172 aa  86.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  36.73 
 
 		 172 aa  85.5  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  36.55 
 
 		 166 aa  85.5  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  31.93 
 
 		 179 aa  85.5  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 168 aa  85.5  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3719  30S ribosomal protein S5  33.55 
 
 		 173 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  35.58 
 
 		 167 aa  84.7  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  35.86 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  35.86 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  35.86 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  35.86 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  35.86 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  35.86 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  35.86 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  35.86 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  34.87 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  34.52 
 
 		 165 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  34.52 
 
 		 165 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2996  30S ribosomal protein S5  32.91 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.37992  normal  0.0218882 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  34.67 
 
 		 165 aa  84.3  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  35.86 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  31.68 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  32.3 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0707  30S ribosomal protein S5  33.58 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2575  30S ribosomal protein S5  32.89 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  31.68 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1308  30S ribosomal protein S5  32.24 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0360  30S ribosomal protein S5  34.07 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.367224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  36.55 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0344  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23191  30S ribosomal protein S5  34.85 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  35.33 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0514  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0137335  unclonable  0.0000000000177209 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  35.46 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1113  30S ribosomal protein S5  35.07 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.7604  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19871  30S ribosomal protein S5  34.31 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.282538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  33.94 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1971  30S ribosomal protein S5  34.07 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  35.92 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  31.1 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0236  30S ribosomal protein S5  31.79 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  32.43 
 
 		 172 aa  81.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  34.46 
 
 		 169 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17241  30S ribosomal protein S5  34.85 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  29.52 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  31.76 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  34.16 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1144  ribosomal protein S5  32.72 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000788101  normal  0.0120151 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16621  30S ribosomal protein S5  33.82 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.655065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  32.32 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2216  30S ribosomal protein S5  31.97 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.622812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  35.61 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  32.14 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1121  30S ribosomal protein S5  31.14 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.421143  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  33.95 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  31.76 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0233  30S ribosomal protein S5  31.79 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.86106 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  30.49 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  35.03 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  35.03 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  32.93 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1634  30S ribosomal protein S5  34.09 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4226  30S ribosomal protein S5  33.54 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00793595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>