More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1634 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1634  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 207 aa  407  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17331  30S ribosomal protein S5  96.14 
 
 		 206 aa  357  6e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17491  30S ribosomal protein S5  95.17 
 
 		 206 aa  353  1e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17241  30S ribosomal protein S5  91.79 
 
 		 206 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16621  30S ribosomal protein S5  78.57 
 
 		 209 aa  312  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.655065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1113  30S ribosomal protein S5  78.67 
 
 		 208 aa  292  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.7604  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19871  30S ribosomal protein S5  91.88 
 
 		 208 aa  292  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.282538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0360  30S ribosomal protein S5  91.36 
 
 		 214 aa  291  4e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.367224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23191  30S ribosomal protein S5  90 
 
 		 210 aa  287  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1971  30S ribosomal protein S5  90.57 
 
 		 215 aa  285  4e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2216  30S ribosomal protein S5  76.4 
 
 		 180 aa  246  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.622812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1308  30S ribosomal protein S5  73.53 
 
 		 173 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3719  30S ribosomal protein S5  70 
 
 		 173 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0236  30S ribosomal protein S5  67.65 
 
 		 173 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0233  30S ribosomal protein S5  67.65 
 
 		 173 aa  231  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.86106 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2575  30S ribosomal protein S5  67.46 
 
 		 174 aa  229  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0707  30S ribosomal protein S5  67.46 
 
 		 174 aa  228  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2996  30S ribosomal protein S5  64.37 
 
 		 177 aa  227  8e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.37992  normal  0.0218882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  53.94 
 
 		 166 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18077  Plastid ribosomal protein S5B small ribosomal subunit  54.72 
 
 		 159 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0245755 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13247  Plastid ribosomal protein S5A small ribosomal subunit  54.72 
 
 		 159 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1144  ribosomal protein S5  50 
 
 		 173 aa  163  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000788101  normal  0.0120151 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  50.3 
 
 		 166 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  51.88 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  52.2 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  47.9 
 
 		 173 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  49.37 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  51.9 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 162 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 166 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 166 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 166 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 166 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 166 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 166 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  50.94 
 
 		 180 aa  151  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 166 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 166 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 166 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  49.68 
 
 		 166 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  49.68 
 
 		 166 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 164 aa  150  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  52.94 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  51.92 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  49.4 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  51.28 
 
 		 168 aa  149  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 162 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  50 
 
 		 166 aa  148  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 162 aa  148  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 162 aa  148  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  45.66 
 
 		 173 aa  147  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  49.69 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  51.63 
 
 		 197 aa  147  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  47.34 
 
 		 166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  47.34 
 
 		 166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  49.04 
 
 		 172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  48.21 
 
 		 166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  48.05 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  47.77 
 
 		 175 aa  146  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  50.68 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  50.68 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  50.62 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  46.5 
 
 		 172 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  44.64 
 
 		 179 aa  145  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 174 aa  145  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  48.45 
 
 		 190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  46.91 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  46.5 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  49.68 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  49.68 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  47.77 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  48.08 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  48.75 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  49.35 
 
 		 162 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1778  30S ribosomal protein S5  47.5 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0732859  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  45.86 
 
 		 172 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 222 aa  141  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  45.28 
 
 		 172 aa  141  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  45.28 
 
 		 172 aa  140  9e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  48.08 
 
 		 183 aa  140  9e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 225 aa  140  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  48.12 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  46.88 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  48.72 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  48.39 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  50 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  50.63 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  44.59 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  49.04 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1921  30S ribosomal protein S5  46.54 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  47.77 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  50.66 
 
 		 169 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  47.77 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0268  ribosomal protein S5  51.3 
 
 		 233 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  51.32 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>