More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1971 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1971  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 215 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0360  30S ribosomal protein S5  93.02 
 
 		 214 aa  338  4e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.367224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16621  30S ribosomal protein S5  84.65 
 
 		 209 aa  316  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.655065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1113  30S ribosomal protein S5  81.4 
 
 		 208 aa  310  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.7604  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19871  30S ribosomal protein S5  81.4 
 
 		 208 aa  310  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.282538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23191  30S ribosomal protein S5  96.88 
 
 		 210 aa  305  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17241  30S ribosomal protein S5  90.18 
 
 		 206 aa  290  9e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17331  30S ribosomal protein S5  88.1 
 
 		 206 aa  289  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1634  30S ribosomal protein S5  87.5 
 
 		 207 aa  288  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17491  30S ribosomal protein S5  86.9 
 
 		 206 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2216  30S ribosomal protein S5  79.5 
 
 		 180 aa  255  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.622812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3719  30S ribosomal protein S5  74.12 
 
 		 173 aa  254  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1308  30S ribosomal protein S5  74.12 
 
 		 173 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2575  30S ribosomal protein S5  69.23 
 
 		 174 aa  239  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0233  30S ribosomal protein S5  70 
 
 		 173 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.86106 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0707  30S ribosomal protein S5  69.23 
 
 		 174 aa  237  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0236  30S ribosomal protein S5  69.41 
 
 		 173 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2996  30S ribosomal protein S5  67.46 
 
 		 177 aa  234  9e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.37992  normal  0.0218882 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1144  ribosomal protein S5  51.83 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000788101  normal  0.0120151 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13247  Plastid ribosomal protein S5A small ribosomal subunit  53.8 
 
 		 159 aa  160  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18077  Plastid ribosomal protein S5B small ribosomal subunit  53.8 
 
 		 159 aa  160  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0245755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  53.5 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  54.37 
 
 		 172 aa  158  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 164 aa  156  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  50.63 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  50.91 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  50.96 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  50.3 
 
 		 180 aa  151  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  52.23 
 
 		 168 aa  151  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  51.88 
 
 		 180 aa  151  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  50.96 
 
 		 166 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  49.37 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  47.49 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  51.25 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  52.23 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  51.23 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  48.5 
 
 		 173 aa  150  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  48.75 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 162 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  51.88 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 		 167 aa  149  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  51.88 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  46.43 
 
 		 179 aa  148  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  50.96 
 
 		 202 aa  148  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  51.28 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  48.08 
 
 		 172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  48.08 
 
 		 171 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  45.12 
 
 		 177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  47.31 
 
 		 175 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  50.62 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1724  30S ribosomal protein S5  51.92 
 
 		 243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00276041  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0268  ribosomal protein S5  52.6 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  51.3 
 
 		 162 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  51.3 
 
 		 162 aa  145  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  48.7 
 
 		 162 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  47.59 
 
 		 172 aa  145  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  48.47 
 
 		 166 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  49.43 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  50.65 
 
 		 162 aa  145  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  48.08 
 
 		 172 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  49.04 
 
 		 166 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  47.44 
 
 		 172 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  49.04 
 
 		 183 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  47.44 
 
 		 172 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  49.36 
 
 		 168 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  48.72 
 
 		 179 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  50.64 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 162 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  50.33 
 
 		 166 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 165 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 165 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  50.33 
 
 		 166 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  50.33 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  51.9 
 
 		 167 aa  141  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  45.45 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  45.45 
 
 		 166 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  49.68 
 
 		 200 aa  141  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  45.51 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  48.72 
 
 		 182 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  47.47 
 
 		 174 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  49.68 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  49.68 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3932  30S ribosomal protein S5  44.72 
 
 		 172 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  46.5 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  47.77 
 
 		 173 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>