More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0243 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  60 
 
 
166 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
166 aa  181  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
166 aa  181  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
166 aa  181  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
166 aa  181  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
166 aa  181  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
166 aa  181  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
166 aa  181  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
166 aa  181  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
166 aa  181  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  59.35 
 
 
166 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  58.06 
 
 
166 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  56.77 
 
 
166 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  54.66 
 
 
166 aa  171  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  55 
 
 
167 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  55.48 
 
 
164 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 
165 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 
165 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 
168 aa  168  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  49.41 
 
 
172 aa  168  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  49.72 
 
 
206 aa  168  6e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  54.97 
 
 
166 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  48.24 
 
 
173 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  48.24 
 
 
173 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 
166 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  54.3 
 
 
166 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  54.3 
 
 
166 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4226  30S ribosomal protein S5  51.28 
 
 
174 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00793595  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  50 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  49.37 
 
 
191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0608  30S ribosomal protein S5  50 
 
 
197 aa  165  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424866  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  55.13 
 
 
166 aa  165  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0563  30S ribosomal protein S5  50 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  49.69 
 
 
173 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0776  30S ribosomal protein S5  50 
 
 
188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0981589  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  50.61 
 
 
169 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  54.04 
 
 
168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  47.65 
 
 
172 aa  161  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 
172 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2308  30S ribosomal protein S5  45.88 
 
 
172 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0837042  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  46.47 
 
 
172 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  50.31 
 
 
168 aa  159  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000874802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3300  30S ribosomal protein S5  45.29 
 
 
172 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  54.19 
 
 
234 aa  160  2e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2517  30S ribosomal protein S5  48.73 
 
 
187 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  53.85 
 
 
168 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3321  30S ribosomal protein S5  51.28 
 
 
174 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  44.71 
 
 
172 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0506  30S ribosomal protein S5  49.37 
 
 
171 aa  158  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0501  30S ribosomal protein S5  49.37 
 
 
171 aa  158  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000846661  normal  0.0709882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2933  30S ribosomal protein S5  45.29 
 
 
172 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000097006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3280  30S ribosomal protein S5  45.29 
 
 
172 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00328937  hitchhiker  0.0000684502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1371  30S ribosomal protein S5  50.97 
 
 
189 aa  158  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.133817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  50.67 
 
 
192 aa  157  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1732  30S ribosomal protein S5  48.1 
 
 
187 aa  157  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726866  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  50.67 
 
 
192 aa  157  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0492  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 
172 aa  157  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.166117  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0378  30S ribosomal protein S5  48.1 
 
 
187 aa  157  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.516384  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  47.53 
 
 
186 aa  157  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1859  30S ribosomal protein S5  49.68 
 
 
189 aa  157  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  50.67 
 
 
192 aa  157  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  49.68 
 
 
186 aa  157  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  50.67 
 
 
195 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  49.04 
 
 
190 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1925  30S ribosomal protein S5  50.67 
 
 
191 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0344  30S ribosomal protein S5  47.85 
 
 
176 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0514  30S ribosomal protein S5  47.85 
 
 
176 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0137335  unclonable  0.0000000000177209 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  52.53 
 
 
173 aa  155  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1349  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 
189 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000960578  normal  0.199719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  47.53 
 
 
190 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2152  ribosomal protein S5  47.17 
 
 
168 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.352454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 
189 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 
189 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5053  30S ribosomal protein S5  47.2 
 
 
172 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  50.68 
 
 
192 aa  154  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0067  30S ribosomal protein S5  45.73 
 
 
169 aa  154  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00817055  hitchhiker  0.00000000000110208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  50.97 
 
 
166 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3152  30S ribosomal protein S5  44.12 
 
 
172 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2615  30S ribosomal protein S5  44.12 
 
 
172 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052569  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3495  30S ribosomal protein S5  44.12 
 
 
172 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0336  30S ribosomal protein S5  47.2 
 
 
175 aa  154  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000198476  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3759  30S ribosomal protein S5  44.12 
 
 
172 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0375867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1941  30S ribosomal protein S5  44.12 
 
 
172 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337273  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3787  30S ribosomal protein S5  44.12 
 
 
172 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.773313  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0266  30S ribosomal protein S5  44.12 
 
 
172 aa  154  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118791  hitchhiker  0.0081122 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3729  30S ribosomal protein S5  44.12 
 
 
172 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00614597  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0070  30S ribosomal protein S5  45.12 
 
 
172 aa  154  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.068486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3051  30S ribosomal protein S5  44.12 
 
 
172 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0155994  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1144  ribosomal protein S5  47.31 
 
 
173 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000788101  normal  0.0120151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  48.39 
 
 
185 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  0.00000059117 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 
176 aa  153  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2822  30S ribosomal protein S5  43.53 
 
 
172 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137287  normal  0.25953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  46.58 
 
 
166 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  47.77 
 
 
190 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  45.96 
 
 
166 aa  153  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  46.11 
 
 
173 aa  153  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  50.93 
 
 
166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  46.58 
 
 
166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3627  30S ribosomal protein S5  43.53 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000356902  hitchhiker  0.0000000000160734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>