More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48411 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48411  predicted protein  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04150  ribosomal protein S2, putative  66.36 
 
 		 256 aa  304  9.000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18532  Cytosolic 80S ribosomal protein S2; Cytosolic 40S small ribosomal subunit protein S2  62.1 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00101869  normal  0.0391039 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03413  ribosomal protein S5 (AFU_orthologue; AFUA_7G01460)  64.22 
 
 		 259 aa  270  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32264  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74777  40S ribosomal protein S2 (S4) (YS5) (RP12) (Omnipotent suppressor protein SUP44)  59.63 
 
 		 252 aa  258  6e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0236  30S ribosomal protein S5P  45.73 
 
 		 202 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0779  30S ribosomal protein S5P  47.18 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1306  30S ribosomal protein S5P  46.15 
 
 		 202 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1758  ribosomal protein S5  45 
 
 		 214 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0769972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0090  30S ribosomal protein S5P  47.37 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00484292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2233  30S ribosomal protein S5P  47.45 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0588103  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0313  30S ribosomal protein S5P  45.13 
 
 		 197 aa  169  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1206  30S ribosomal protein S5P  44.62 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.359791 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1501  ribosomal protein S5  45.79 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000598277  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0101  30S ribosomal protein S5P  46.39 
 
 		 205 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.827506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0021  30S ribosomal protein S5P  46.32 
 
 		 211 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000032462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0462  30S ribosomal protein S5P  47.37 
 
 		 207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.599903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0552  30S ribosomal protein S5P  45.88 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.897256  normal  0.326676 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1708  30S ribosomal protein S5P  45.36 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233488  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0111  30S ribosomal protein S5P  44.5 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0707  30S ribosomal protein S5P  43.52 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0239134  hitchhiker  0.000000000105394 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0584  30S ribosomal protein S5P  44.21 
 
 		 205 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0159  30S ribosomal protein S5P  45.5 
 
 		 229 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0020988  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0230  ribosomal protein S5  41.41 
 
 		 221 aa  155  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0864228  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0664  30S ribosomal protein S5P  44.44 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00751538 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2238  ribosomal protein S5  41.33 
 
 		 218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0399  30S ribosomal protein S5P  43.22 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0467584 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1848  30S ribosomal protein S5P  42.71 
 
 		 210 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1254  30S ribosomal protein S5P  44.44 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0153949  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2312  30S ribosomal protein S5P  43.15 
 
 		 210 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19422  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2429  30S ribosomal protein S5P  40.59 
 
 		 215 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1404  30S ribosomal protein S5P  42.79 
 
 		 221 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0730  30S ribosomal protein S5P  44.97 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  35.8 
 
 		 176 aa  86.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  33.77 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  36.11 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  35.62 
 
 		 180 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  34.46 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  39.31 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  32.91 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  34.81 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  37.16 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  34.46 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  32.89 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  33.78 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  35.81 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  32.03 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  34.69 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  38.36 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  35.95 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  34.69 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  35.06 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  34.69 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  34.87 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  39.04 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  36.3 
 
 		 166 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  36.3 
 
 		 166 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  36.3 
 
 		 166 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  36.3 
 
 		 166 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  36.3 
 
 		 166 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  36.3 
 
 		 166 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  36.3 
 
 		 166 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  36.3 
 
 		 166 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 162 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 172 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  36.3 
 
 		 166 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  32.68 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  35.14 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  34.46 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  35.14 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  32.43 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  35.62 
 
 		 166 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  31.45 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  32.19 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0506  30S ribosomal protein S5  28.99 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  35 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  35.62 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  34.25 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  33.57 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  33.57 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  33.56 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  33.79 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  34.69 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  33.33 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  34.62 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  32.05 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  31.08 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  32.65 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  34.93 
 
 		 173 aa  72  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  34.46 
 
 		 200 aa  72  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  34.46 
 
 		 168 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0282  30S ribosomal protein S5  31.25 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000515856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  33.11 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  33.56 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  34.25 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  35.62 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>