More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0812 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0812  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
503 aa  973    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.114491  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  58.73 
 
 
507 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0744  NADH dehydrogenase (quinone)  60.68 
 
 
504 aa  513  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2662  NADH dehydrogenase (quinone)  60.82 
 
 
503 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  58.01 
 
 
499 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  56.82 
 
 
498 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  56.59 
 
 
497 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  55.73 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.24 
 
 
500 aa  320  3e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0845  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.38 
 
 
698 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  47.48 
 
 
554 aa  312  7.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5152  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  44.56 
 
 
651 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.96 
 
 
566 aa  306  6e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479761  normal  0.594337 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3446  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.98 
 
 
669 aa  292  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181891  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2288  NADH dehydrogenase (quinone)  44.33 
 
 
488 aa  292  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  38.74 
 
 
501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3628  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.77 
 
 
487 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1634  NADH dehydrogenase (quinone)  41.5 
 
 
490 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3285  NADH dehydrogenase (quinone)  41.29 
 
 
496 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0676667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0891  NADH dehydrogenase (quinone)  39.53 
 
 
493 aa  265  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.158004  normal  0.070736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3954  NADH dehydrogenase (quinone)  39.54 
 
 
497 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3667  NADH dehydrogenase (quinone)  40.36 
 
 
496 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1601  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.48 
 
 
499 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  33.18 
 
 
500 aa  243  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.21 
 
 
542 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0328  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  35.71 
 
 
489 aa  231  3e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0677  NADH dehydrogenase (quinone)  32.5 
 
 
496 aa  229  7e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0563  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  38.79 
 
 
475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.05 
 
 
498 aa  193  5e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  33.86 
 
 
1265 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  37.78 
 
 
501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  30.15 
 
 
748 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  33.59 
 
 
1265 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  31.67 
 
 
505 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.75 
 
 
499 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.82 
 
 
513 aa  169  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.01 
 
 
639 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  29.84 
 
 
480 aa  163  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
1264 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  29.22 
 
 
486 aa  159  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2705  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.23 
 
 
659 aa  159  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  36.18 
 
 
651 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  32 
 
 
1253 aa  156  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03270  NADH dehydrogenase subunit L  33.14 
 
 
632 aa  156  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4054  NADH dehydrogenase subunit L  35.88 
 
 
652 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1138  NADH dehydrogenase (quinone)  32.14 
 
 
470 aa  155  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0918  NADH dehydrogenase (quinone)  32.25 
 
 
559 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.7 
 
 
1024 aa  155  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  29.89 
 
 
498 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.04 
 
 
631 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  29.21 
 
 
480 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3774  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.78 
 
 
477 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0888165  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07490  NADH dehydrogenase subunit L  34.23 
 
 
641 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0146936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.55 
 
 
507 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.48 
 
 
969 aa  150  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4988  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.75 
 
 
736 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.91 
 
 
997 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.84 
 
 
967 aa  150  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  33.63 
 
 
636 aa  150  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.82 
 
 
649 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.1 
 
 
656 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6671  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
644 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.421809  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.23 
 
 
502 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.89 
 
 
769 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.82 
 
 
654 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0985  NADH dehydrogenase subunit L  33.04 
 
 
643 aa  147  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.78 
 
 
698 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.82 
 
 
975 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  31.61 
 
 
642 aa  146  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  27.42 
 
 
505 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.91 
 
 
953 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3950  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.53 
 
 
956 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0588976 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  31.5 
 
 
1245 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  34.1 
 
 
638 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.19 
 
 
953 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.18 
 
 
654 aa  144  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  31.34 
 
 
654 aa  143  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0853  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.09 
 
 
545 aa  143  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_802  NADH:quinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)  31.74 
 
 
654 aa  143  9e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6083  NADH dehydrogenase subunit L  34.21 
 
 
662 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0681759 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.33 
 
 
971 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4909  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.76 
 
 
635 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7680  NADH dehydrogenase subunit L  30.79 
 
 
638 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0531  NADH dehydrogenase subunit L  33.05 
 
 
643 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.6 
 
 
962 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26701  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  31.94 
 
 
670 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.61 
 
 
782 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.7 
 
 
952 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.33 
 
 
501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.11 
 
 
683 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.76 
 
 
625 aa  141  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.89 
 
 
654 aa  141  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3868  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.39 
 
 
696 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0278  NADH dehydrogenase subunit L  33.14 
 
 
634 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 
473 aa  141  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  26.9 
 
 
506 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  29.68 
 
 
504 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  28.85 
 
 
498 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.56 
 
 
973 aa  140  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3218  NADH dehydrogenase subunit L  34.83 
 
 
642 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136607  normal  0.0162367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>