More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1280 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  67.41 
 
 
498 aa  642    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
499 aa  984    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  65.52 
 
 
497 aa  625  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2662  NADH dehydrogenase (quinone)  64.59 
 
 
503 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  60.83 
 
 
507 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0744  NADH dehydrogenase (quinone)  60.36 
 
 
504 aa  547  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  56.01 
 
 
505 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0812  NADH dehydrogenase (quinone)  58.33 
 
 
503 aa  482  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.114491  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  49.2 
 
 
554 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0845  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.78 
 
 
698 aa  345  8e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.42 
 
 
500 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2288  NADH dehydrogenase (quinone)  44.76 
 
 
488 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  48.01 
 
 
566 aa  336  7e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479761  normal  0.594337 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3628  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.45 
 
 
487 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5152  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.7 
 
 
651 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  46.35 
 
 
501 aa  325  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1634  NADH dehydrogenase (quinone)  44.04 
 
 
490 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1601  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.24 
 
 
499 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3446  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.84 
 
 
669 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181891  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0891  NADH dehydrogenase (quinone)  42.07 
 
 
493 aa  306  7e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.158004  normal  0.070736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3285  NADH dehydrogenase (quinone)  45.1 
 
 
496 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0676667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3667  NADH dehydrogenase (quinone)  44.65 
 
 
496 aa  296  6e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.58 
 
 
542 aa  296  8e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3954  NADH dehydrogenase (quinone)  43.6 
 
 
497 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  36.97 
 
 
500 aa  295  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_002978  WD0816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.28 
 
 
498 aa  262  8e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0677  NADH dehydrogenase (quinone)  39.95 
 
 
496 aa  260  3e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0328  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  39.59 
 
 
489 aa  258  2e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0563  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  41.53 
 
 
475 aa  243  6e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  34.71 
 
 
501 aa  206  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.26 
 
 
499 aa  203  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  34.41 
 
 
1253 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  35.08 
 
 
1265 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  34.47 
 
 
1264 aa  190  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  29.81 
 
 
748 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.43 
 
 
501 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  30.39 
 
 
1265 aa  176  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.18 
 
 
502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  29.95 
 
 
486 aa  172  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.32 
 
 
1024 aa  171  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.51 
 
 
698 aa  170  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3950  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.92 
 
 
956 aa  170  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0588976 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.94 
 
 
967 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  28.71 
 
 
480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  32.91 
 
 
505 aa  167  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3909  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.9 
 
 
975 aa  166  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.51 
 
 
513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.1 
 
 
782 aa  163  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.14 
 
 
492 aa  163  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  30.81 
 
 
1245 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.25 
 
 
971 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.88 
 
 
959 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  33.14 
 
 
672 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  33.43 
 
 
672 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.74 
 
 
983 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.52 
 
 
507 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  33.43 
 
 
672 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  33.14 
 
 
672 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.16 
 
 
973 aa  160  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  33.14 
 
 
672 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  33.14 
 
 
672 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.48 
 
 
992 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.88 
 
 
492 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.18 
 
 
984 aa  160  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.1 
 
 
932 aa  160  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1058  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.84 
 
 
652 aa  159  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  28.31 
 
 
480 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.25 
 
 
981 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.97 
 
 
969 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.04 
 
 
642 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.58 
 
 
970 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.5 
 
 
1006 aa  158  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222898  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.97 
 
 
984 aa  158  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3774  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.61 
 
 
477 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0888165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.51 
 
 
997 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  32.02 
 
 
792 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.41 
 
 
933 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.58 
 
 
972 aa  157  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1283  hydrogenase 4 subunit D  30.93 
 
 
479 aa  156  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0280034  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.52 
 
 
943 aa  156  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1846  NADH dehydrogenase (quinone)  31.54 
 
 
534 aa  156  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.42 
 
 
656 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  29.68 
 
 
473 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.33 
 
 
492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4616  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.53 
 
 
979 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.641343  decreased coverage  0.000524948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.53 
 
 
979 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25200  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  32.6 
 
 
981 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1138  NADH dehydrogenase (quinone)  28.86 
 
 
470 aa  154  4e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.17 
 
 
790 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2096  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.87 
 
 
726 aa  154  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2710  hydrogenase 4 subunit D  31.71 
 
 
479 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.61 
 
 
639 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0284  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  32.28 
 
 
517 aa  153  7e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.38 
 
 
966 aa  153  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  33.72 
 
 
633 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0350  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.14 
 
 
982 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0475  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.98 
 
 
622 aa  153  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.230809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.76 
 
 
980 aa  152  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  33.43 
 
 
671 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.84 
 
 
930 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.963541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>