More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1000 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2662  NADH dehydrogenase (quinone)  74.55 
 
 
503 aa  698    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
507 aa  981    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  60.83 
 
 
499 aa  580  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  61.63 
 
 
498 aa  551  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  61.26 
 
 
497 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0744  NADH dehydrogenase (quinone)  62.42 
 
 
504 aa  536  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0812  NADH dehydrogenase (quinone)  59.63 
 
 
503 aa  510  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.114491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  57.23 
 
 
505 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  49.09 
 
 
554 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0845  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  48.76 
 
 
698 aa  342  1e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  45.56 
 
 
501 aa  330  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3628  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.68 
 
 
487 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2288  NADH dehydrogenase (quinone)  43.81 
 
 
488 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.56 
 
 
500 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.9 
 
 
566 aa  312  6.999999999999999e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479761  normal  0.594337 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3954  NADH dehydrogenase (quinone)  43.22 
 
 
497 aa  296  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5152  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.42 
 
 
651 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.99 
 
 
542 aa  294  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3285  NADH dehydrogenase (quinone)  46.63 
 
 
496 aa  294  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0676667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3667  NADH dehydrogenase (quinone)  45.65 
 
 
496 aa  293  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0891  NADH dehydrogenase (quinone)  43.49 
 
 
493 aa  292  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.158004  normal  0.070736 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3446  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.12 
 
 
669 aa  284  3.0000000000000004e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181891  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1601  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.7 
 
 
499 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1634  NADH dehydrogenase (quinone)  45.62 
 
 
490 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181583  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  36.09 
 
 
500 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0328  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  34.51 
 
 
489 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0677  NADH dehydrogenase (quinone)  36.57 
 
 
496 aa  242  1e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0563  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  38.37 
 
 
475 aa  229  7e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.92 
 
 
498 aa  222  9.999999999999999e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  34.66 
 
 
1264 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  31.59 
 
 
499 aa  181  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  31.5 
 
 
748 aa  180  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  36.65 
 
 
505 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  34.71 
 
 
501 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  30.1 
 
 
486 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  29.91 
 
 
480 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  30.79 
 
 
480 aa  171  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  32.39 
 
 
1265 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  34.69 
 
 
531 aa  167  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  31.52 
 
 
1265 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.2 
 
 
513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  31.18 
 
 
1253 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.82 
 
 
501 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  35.31 
 
 
1245 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.93 
 
 
1024 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4573  hydrogenase 4 subunit D  33.96 
 
 
479 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.88 
 
 
625 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3774  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.22 
 
 
477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0888165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.71 
 
 
631 aa  156  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7680  NADH dehydrogenase subunit L  30.91 
 
 
638 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.25 
 
 
649 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.76 
 
 
790 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.96 
 
 
969 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  29.22 
 
 
609 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.74 
 
 
967 aa  153  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.97 
 
 
943 aa  153  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.45 
 
 
997 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2709  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.76 
 
 
786 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.3 
 
 
953 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.33 
 
 
983 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.94 
 
 
782 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2710  hydrogenase 4 subunit D  30.46 
 
 
479 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0918  NADH dehydrogenase (quinone)  30.88 
 
 
559 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  27.96 
 
 
501 aa  149  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0207  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.17 
 
 
652 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306376  normal  0.261941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.25 
 
 
769 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.12 
 
 
656 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1283  hydrogenase 4 subunit D  29.03 
 
 
479 aa  148  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0280034  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2090  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.04 
 
 
770 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  28.97 
 
 
506 aa  148  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2187  hydrogenase 4 subunit D  31.29 
 
 
480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.562518 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.37 
 
 
507 aa  147  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.87 
 
 
971 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0278  NADH dehydrogenase subunit L  33.24 
 
 
634 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.01 
 
 
966 aa  147  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  28.48 
 
 
498 aa  147  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0531  NADH dehydrogenase subunit L  32.15 
 
 
643 aa  147  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.52 
 
 
768 aa  147  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.52 
 
 
768 aa  146  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  32.02 
 
 
642 aa  146  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.13 
 
 
980 aa  146  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  28.43 
 
 
505 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  28.37 
 
 
476 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.38 
 
 
952 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.42 
 
 
973 aa  145  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  33.41 
 
 
793 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.43 
 
 
639 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.69 
 
 
959 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.42 
 
 
624 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  33.05 
 
 
673 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  27.23 
 
 
473 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
651 aa  144  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  29.27 
 
 
633 aa  144  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1536  NADH dehydrogenase subunit L  31.63 
 
 
626 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.8 
 
 
949 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0870  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.92 
 
 
775 aa  144  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.867337 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  32.66 
 
 
672 aa  143  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.72 
 
 
801 aa  143  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3950  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.87 
 
 
956 aa  143  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0588976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.33 
 
 
984 aa  143  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>