More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1601 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1601  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  100 
 
 
499 aa  994    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  52.29 
 
 
542 aa  506  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3628  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  54.35 
 
 
487 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  48.88 
 
 
500 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  49.38 
 
 
501 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3667  NADH dehydrogenase (quinone)  47.17 
 
 
496 aa  385  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3285  NADH dehydrogenase (quinone)  46.75 
 
 
496 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0676667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2288  NADH dehydrogenase (quinone)  45.59 
 
 
488 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3954  NADH dehydrogenase (quinone)  46.12 
 
 
497 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5152  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  46.74 
 
 
651 aa  359  7e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1634  NADH dehydrogenase (quinone)  47.77 
 
 
490 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  42.38 
 
 
554 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0891  NADH dehydrogenase (quinone)  46.53 
 
 
493 aa  354  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.158004  normal  0.070736 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0845  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.79 
 
 
698 aa  350  4e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  48.34 
 
 
566 aa  349  6e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479761  normal  0.594337 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3446  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.47 
 
 
669 aa  349  6e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181891  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  44.15 
 
 
499 aa  319  7e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  43.66 
 
 
497 aa  317  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  41.21 
 
 
498 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2662  NADH dehydrogenase (quinone)  40.91 
 
 
503 aa  310  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0677  NADH dehydrogenase (quinone)  40.65 
 
 
496 aa  307  3e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0328  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  38.57 
 
 
489 aa  307  3e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  40.13 
 
 
505 aa  292  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.17 
 
 
507 aa  289  7e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0744  NADH dehydrogenase (quinone)  38.98 
 
 
504 aa  277  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
500 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0812  NADH dehydrogenase (quinone)  39.86 
 
 
503 aa  267  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.114491  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0563  NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase family protein  39.02 
 
 
475 aa  260  4e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.25 
 
 
498 aa  256  9e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  31.57 
 
 
499 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  36.57 
 
 
505 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  34.13 
 
 
501 aa  191  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  34 
 
 
1253 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.59 
 
 
501 aa  184  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  34.91 
 
 
1265 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  32.58 
 
 
1245 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  31 
 
 
1264 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  32.05 
 
 
1265 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0877  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.15 
 
 
648 aa  173  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000848716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  28.4 
 
 
480 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  33.87 
 
 
768 aa  170  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.87 
 
 
492 aa  170  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0850  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.72 
 
 
750 aa  169  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  28.67 
 
 
480 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.49 
 
 
492 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.91 
 
 
790 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.65 
 
 
759 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00014024  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1606  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.45 
 
 
610 aa  165  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.483904  normal  0.915409 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.88 
 
 
788 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1865  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.72 
 
 
758 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.13806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  29.22 
 
 
486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.43 
 
 
770 aa  163  8.000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  29.85 
 
 
620 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.22 
 
 
769 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.67 
 
 
492 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.96 
 
 
653 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  29.84 
 
 
748 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0475  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.74 
 
 
622 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.230809 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1599  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.38 
 
 
762 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85135  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1138  NADH dehydrogenase (quinone)  28.99 
 
 
470 aa  160  7e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.77 
 
 
782 aa  160  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.91 
 
 
642 aa  160  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.06 
 
 
654 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  29.68 
 
 
620 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  30.29 
 
 
654 aa  156  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  29.47 
 
 
620 aa  156  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.29 
 
 
660 aa  156  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.45 
 
 
953 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  28.12 
 
 
650 aa  155  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.79 
 
 
943 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5413  NADH dehydrogenase subunit L  29.85 
 
 
620 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  29.44 
 
 
620 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  28.73 
 
 
620 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  28.73 
 
 
620 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_002936  DET0931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  33.82 
 
 
654 aa  153  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  29.06 
 
 
620 aa  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_802  NADH:quinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)  33.82 
 
 
654 aa  153  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  29.61 
 
 
470 aa  153  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  28.51 
 
 
620 aa  153  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5534  NADH dehydrogenase subunit L  28.51 
 
 
604 aa  153  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32 
 
 
959 aa  152  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.34 
 
 
972 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.39 
 
 
652 aa  152  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0074  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.45 
 
 
765 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.01 
 
 
969 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.58 
 
 
698 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.96 
 
 
628 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2863  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.33 
 
 
498 aa  152  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.845476  normal  0.745609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  30.89 
 
 
792 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1160  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.59 
 
 
671 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0642  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  34.01 
 
 
770 aa  150  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3950  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.11 
 
 
956 aa  150  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0588976 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.13 
 
 
970 aa  150  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.16 
 
 
502 aa  150  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.77 
 
 
624 aa  150  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.78 
 
 
656 aa  149  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.9 
 
 
967 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.87 
 
 
966 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.94 
 
 
952 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3218  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.67 
 
 
767 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>