More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3530 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
470 aa  913    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  64.79 
 
 
473 aa  568  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  40.92 
 
 
476 aa  327  2.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  35.04 
 
 
502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  37.46 
 
 
501 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  32.24 
 
 
498 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 
486 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  31.83 
 
 
500 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  32.72 
 
 
500 aa  190  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  30.58 
 
 
505 aa  186  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  33.85 
 
 
500 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  32.05 
 
 
505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  32.91 
 
 
609 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3531  NADH dehydrogenase (quinone)  34.09 
 
 
610 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  33.67 
 
 
748 aa  181  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.75 
 
 
523 aa  179  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  31.7 
 
 
500 aa  179  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.62 
 
 
525 aa  178  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  31.83 
 
 
504 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.77 
 
 
492 aa  176  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.16 
 
 
500 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.02 
 
 
501 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1772  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  33.8 
 
 
499 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  34.36 
 
 
511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  31.98 
 
 
531 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 
585 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.9 
 
 
492 aa  172  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.33 
 
 
943 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.77 
 
 
499 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  31.23 
 
 
501 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  33.24 
 
 
1264 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0403  sodium/proton antiporter protein  32.49 
 
 
499 aa  171  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.71 
 
 
801 aa  170  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  33.42 
 
 
1245 aa  170  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3534  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.07 
 
 
532 aa  169  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.73 
 
 
507 aa  169  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.69 
 
 
513 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.57 
 
 
969 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2863  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.81 
 
 
498 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.845476  normal  0.745609 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.05 
 
 
522 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.81 
 
 
488 aa  167  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1606  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.37 
 
 
496 aa  167  5e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.93 
 
 
492 aa  167  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1110  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.94 
 
 
512 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.77 
 
 
769 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0760  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.36 
 
 
496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.29344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.42 
 
 
501 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3455  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.89 
 
 
488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112327  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.96 
 
 
790 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  27.92 
 
 
480 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.49 
 
 
959 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.39 
 
 
966 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  32.91 
 
 
478 aa  164  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.33 
 
 
792 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  30.3 
 
 
479 aa  162  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2223  NADH dehydrogenase (quinone)  34.07 
 
 
496 aa  162  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  30.46 
 
 
504 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  33.33 
 
 
498 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  32.65 
 
 
478 aa  162  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.1 
 
 
799 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.56 
 
 
642 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.98 
 
 
483 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  29.67 
 
 
620 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 
667 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.16 
 
 
1024 aa  160  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  33.53 
 
 
1253 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.75 
 
 
472 aa  160  5e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0286  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  30.77 
 
 
494 aa  160  6e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000250262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0874  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.25 
 
 
786 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1099  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  31.7 
 
 
496 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  34.32 
 
 
672 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  29.37 
 
 
498 aa  159  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  30.67 
 
 
497 aa  159  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4249  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  35.24 
 
 
523 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4311  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  35.24 
 
 
523 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0412601  hitchhiker  0.0081583 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0853  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.32 
 
 
545 aa  159  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  28.57 
 
 
643 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0179  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.44 
 
 
491 aa  159  1e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.490475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1731  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.94 
 
 
505 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.494392  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.75 
 
 
967 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  31.95 
 
 
633 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  31.95 
 
 
633 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  32.25 
 
 
480 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0643  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.16 
 
 
544 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552071  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.15 
 
 
542 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.13 
 
 
624 aa  158  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.42 
 
 
544 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1598  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.06 
 
 
545 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.72 
 
 
504 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  33.53 
 
 
476 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0970  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.49 
 
 
545 aa  157  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0163848  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26950  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  35.19 
 
 
528 aa  156  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49502  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  32.28 
 
 
792 aa  156  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.98 
 
 
645 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.062647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  31.3 
 
 
476 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0851  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.06 
 
 
545 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157945  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33 
 
 
631 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1107  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.74 
 
 
488 aa  155  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.980044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  33.73 
 
 
687 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  28.84 
 
 
480 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>