More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4834 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 585 aa  1125    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.14 
 
 		 522 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.92 
 
 		 525 aa  233  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.27 
 
 		 523 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.27 
 
 		 513 aa  223  9e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1673  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.57 
 
 		 604 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  29.63 
 
 		 500 aa  198  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  35.46 
 
 		 531 aa  196  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  31.86 
 
 		 748 aa  190  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  30.37 
 
 		 498 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  28.77 
 
 		 506 aa  183  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.16 
 
 		 499 aa  183  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  34 
 
 		 662 aa  183  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  31.72 
 
 		 683 aa  181  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  34.75 
 
 		 674 aa  180  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  32.28 
 
 		 748 aa  179  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  31.49 
 
 		 672 aa  178  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  31.23 
 
 		 476 aa  178  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  32.03 
 
 		 501 aa  178  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  31.63 
 
 		 609 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  35.52 
 
 		 669 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 		 470 aa  174  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  29.13 
 
 		 486 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  30.3 
 
 		 500 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.62 
 
 		 545 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0681  NADH dehydrogenase (quinone)  35.92 
 
 		 584 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.389184 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  34.09 
 
 		 501 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  31.76 
 
 		 673 aa  171  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1741  NADH dehydrogenase subunit M  29.31 
 
 		 604 aa  169  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.56797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.12 
 
 		 953 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  29.03 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  32.2 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  29.11 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  29.35 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  36.24 
 
 		 654 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.09 
 
 		 952 aa  168  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  31.03 
 
 		 1265 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  32.39 
 
 		 723 aa  167  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3229  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.99 
 
 		 488 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  32.64 
 
 		 1264 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.07 
 
 		 969 aa  166  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  31.19 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3531  NADH dehydrogenase (quinone)  33.69 
 
 		 610 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  35.19 
 
 		 671 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1010  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.65 
 
 		 978 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246067  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.17 
 
 		 562 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  34.03 
 
 		 669 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.52 
 
 		 539 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2437  NADH dehydrogenase (quinone)  30.37 
 
 		 530 aa  163  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.366515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  30.32 
 
 		 504 aa  163  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.32 
 
 		 538 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  34.81 
 
 		 672 aa  163  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  31.11 
 
 		 505 aa  163  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.45 
 
 		 661 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  40.06 
 
 		 654 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  34.81 
 
 		 672 aa  163  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.01 
 
 		 1004 aa  163  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3455  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.73 
 
 		 488 aa  163  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112327  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  37.25 
 
 		 667 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  30.81 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  34.49 
 
 		 672 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.55 
 
 		 543 aa  162  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.52 
 
 		 801 aa  162  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.6 
 
 		 790 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  35.58 
 
 		 577 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  30.77 
 
 		 644 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  34.49 
 
 		 672 aa  161  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  34.49 
 
 		 672 aa  161  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5103  NADH dehydrogenase (quinone)  30.73 
 
 		 584 aa  161  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  34.49 
 
 		 672 aa  161  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.73 
 
 		 688 aa  161  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.6 
 
 		 966 aa  161  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.31 
 
 		 472 aa  161  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.14 
 
 		 666 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  31.08 
 
 		 502 aa  160  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  31.76 
 
 		 649 aa  160  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  29.3 
 
 		 500 aa  160  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.8 
 
 		 622 aa  160  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.93 
 
 		 628 aa  160  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1217  NADH dehydrogenase subunit M  26.62 
 
 		 614 aa  159  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.16 
 
 		 930 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  29.86 
 
 		 655 aa  159  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.04 
 
 		 499 aa  159  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  33.17 
 
 		 679 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.68 
 
 		 980 aa  158  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25180  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  29.71 
 
 		 526 aa  159  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0648794  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.2 
 
 		 967 aa  159  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  30.5 
 
 		 674 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1781  hydrogenase subunit F  30.42 
 
 		 482 aa  159  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.89 
 
 		 501 aa  158  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.18 
 
 		 975 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.03 
 
 		 769 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  29.06 
 
 		 511 aa  157  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3531  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.67 
 
 		 827 aa  157  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247044  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  31 
 
 		 655 aa  157  7e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.12 
 
 		 959 aa  157  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.5 
 
 		 666 aa  156  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.25 
 
 		 501 aa  156  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1160  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.99 
 
 		 495 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  29.08 
 
 		 504 aa  156  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>