More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0943 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
723 aa  1421    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.62 
 
 
669 aa  425  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  41.58 
 
 
669 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  39.09 
 
 
667 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  38.04 
 
 
668 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  38.42 
 
 
662 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  40.13 
 
 
669 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  40 
 
 
666 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.59 
 
 
666 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  38.17 
 
 
654 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  37.91 
 
 
673 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  35.2 
 
 
661 aa  362  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  37.95 
 
 
577 aa  362  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  37.03 
 
 
666 aa  360  6e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  39.51 
 
 
663 aa  349  9e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2601  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.39 
 
 
660 aa  348  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.67 
 
 
661 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  39.79 
 
 
672 aa  347  6e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  36.14 
 
 
683 aa  346  8.999999999999999e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  35.2 
 
 
672 aa  346  8.999999999999999e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  35.36 
 
 
672 aa  345  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  35.2 
 
 
672 aa  345  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  35.03 
 
 
672 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  35.36 
 
 
672 aa  345  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  35.03 
 
 
672 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  38.08 
 
 
673 aa  345  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.72 
 
 
659 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.66 
 
 
659 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  36.68 
 
 
679 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  40 
 
 
671 aa  333  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  35.74 
 
 
644 aa  330  6e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  35.29 
 
 
646 aa  330  8e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  36.18 
 
 
644 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  41.24 
 
 
662 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  34.66 
 
 
665 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  34.55 
 
 
748 aa  324  4e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.54 
 
 
688 aa  321  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  36.18 
 
 
617 aa  317  5e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  35.18 
 
 
649 aa  316  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  34.34 
 
 
637 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  34.21 
 
 
643 aa  308  3e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  35.12 
 
 
655 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  34.62 
 
 
655 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3796  NADH dehydrogenase (quinone)  38.52 
 
 
654 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273036  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  36.96 
 
 
687 aa  303  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3713  NADH dehydrogenase (quinone)  38.7 
 
 
654 aa  300  7e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.117424  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  42.79 
 
 
654 aa  300  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  37.28 
 
 
737 aa  299  1e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  38.9 
 
 
672 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  36.64 
 
 
672 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  31.83 
 
 
669 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  35.61 
 
 
633 aa  283  1e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  41.48 
 
 
665 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3276  NADH dehydrogenase (quinone)  33.03 
 
 
671 aa  281  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  32.85 
 
 
674 aa  281  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  37.37 
 
 
666 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  39.39 
 
 
666 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  33 
 
 
682 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  34.3 
 
 
669 aa  273  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  31.15 
 
 
650 aa  270  8.999999999999999e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  31.52 
 
 
674 aa  266  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  31.23 
 
 
669 aa  266  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0166  hydrogenase 4 subunit B  33.95 
 
 
681 aa  264  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970512  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4703  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.45 
 
 
662 aa  264  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  30.58 
 
 
668 aa  261  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  31.4 
 
 
668 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  31.4 
 
 
668 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  30.56 
 
 
674 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  30.09 
 
 
669 aa  256  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  32.08 
 
 
674 aa  249  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  31.26 
 
 
640 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.83 
 
 
646 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  32.3 
 
 
671 aa  241  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3780  NADH dehydrogenase (quinone)  34.88 
 
 
670 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0116247  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3054  formate hydrogenlyase subunit 3  35.78 
 
 
608 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.920212  normal  0.22505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4469  NADH dehydrogenase (quinone)  33.09 
 
 
664 aa  236  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2985  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.52 
 
 
674 aa  234  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0690807  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02573  NADH dehydrogenase subunit N  32.65 
 
 
608 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.621394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0966  NADH dehydrogenase (quinone)  32.65 
 
 
608 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2859  formate hydrogenlyase subunit 3  32.65 
 
 
608 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3011  formate hydrogenlyase subunit 3  32.65 
 
 
608 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2848  formate hydrogenlyase subunit 3  32.65 
 
 
608 aa  228  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.264273 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0989  formate hydrogenlyase subunit 3  32.65 
 
 
608 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.180245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3974  formate hydrogenlyase subunit 3  32.46 
 
 
608 aa  226  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3038  formate hydrogenlyase subunit 3  35.78 
 
 
608 aa  224  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419635 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3196  formate hydrogenlyase subunit 3  29.22 
 
 
608 aa  224  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3161  formate hydrogenlyase subunit 3  36.01 
 
 
608 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1807  hydrogenase 4 subunit B  31.09 
 
 
660 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370569  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2149  hydrogenase 4 subunit B  31.09 
 
 
660 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.33721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3003  formate hydrogenlyase subunit 3  35.78 
 
 
608 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2972  formate hydrogenlyase subunit 3  35.78 
 
 
608 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2432  NADH dehydrogenase (quinone)  31.15 
 
 
622 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  33.11 
 
 
500 aa  206  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  31.17 
 
 
633 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  31.17 
 
 
633 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.57 
 
 
522 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1217  NADH dehydrogenase subunit M  32.57 
 
 
614 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  32.8 
 
 
505 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  30.24 
 
 
1264 aa  190  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  31.44 
 
 
1253 aa  190  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>