More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1136 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
476 aa  948    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  43.39 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  41.34 
 
 
470 aa  326  5e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  33.87 
 
 
486 aa  209  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  33.08 
 
 
501 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  33.92 
 
 
531 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1772  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  29.73 
 
 
499 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.61 
 
 
522 aa  187  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.51 
 
 
953 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.45 
 
 
499 aa  186  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  33.51 
 
 
620 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.95 
 
 
523 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  30.6 
 
 
1264 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0890  NADH dehydrogenase subunit M  31.72 
 
 
613 aa  185  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.514114  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  33.42 
 
 
1245 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0403  sodium/proton antiporter protein  29.48 
 
 
499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1606  NADH dehydrogenase subunit M  31.59 
 
 
626 aa  183  6e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3402  F420H2 dehydrogenase subunit M  32.25 
 
 
495 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00767556  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.64 
 
 
605 aa  182  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  34.86 
 
 
674 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  29.47 
 
 
498 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.51 
 
 
525 aa  181  4e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  31.81 
 
 
609 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  31.33 
 
 
500 aa  179  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1217  NADH dehydrogenase subunit M  31.29 
 
 
614 aa  179  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  27.92 
 
 
500 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1059  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  32.28 
 
 
502 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0286  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  32.16 
 
 
494 aa  178  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000250262 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3811  NADH dehydrogenase subunit L  31.94 
 
 
620 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  31.23 
 
 
585 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.1 
 
 
511 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0748  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  30.08 
 
 
500 aa  176  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00127358  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.89 
 
 
492 aa  176  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  29.4 
 
 
500 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  33.25 
 
 
620 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  32.98 
 
 
620 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  30.09 
 
 
620 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  32.98 
 
 
620 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  32.98 
 
 
620 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5534  NADH dehydrogenase subunit L  32.98 
 
 
604 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1863  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.12 
 
 
513 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.91 
 
 
492 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5413  NADH dehydrogenase subunit L  32.98 
 
 
620 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  29.87 
 
 
620 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.02 
 
 
492 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.24 
 
 
483 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.89 
 
 
500 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.62 
 
 
513 aa  172  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  29.4 
 
 
504 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  30.45 
 
 
1265 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  27.01 
 
 
500 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.5 
 
 
801 aa  170  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.46 
 
 
542 aa  170  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  30.15 
 
 
1253 aa  170  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  29.71 
 
 
1265 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  31.22 
 
 
502 aa  168  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  32.3 
 
 
481 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5090  NADH dehydrogenase subunit L  32.19 
 
 
620 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  29.89 
 
 
511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00934682  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  32.67 
 
 
511 aa  167  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.12 
 
 
959 aa  167  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2925  NADH dehydrogenase (quinone)  31.06 
 
 
505 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0483803  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2223  NADH dehydrogenase (quinone)  32.6 
 
 
496 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0349  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  28.81 
 
 
506 aa  166  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224429  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2863  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.68 
 
 
498 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.845476  normal  0.745609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.13 
 
 
501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0179  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.85 
 
 
491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.490475  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.33 
 
 
656 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.94 
 
 
472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1288  F420H2 dehydrogenase subunit M  31.27 
 
 
495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000089529  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0700  NADH dehydrogenase (quinone)  29.55 
 
 
484 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.452975  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.2 
 
 
509 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4249  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  28.83 
 
 
523 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4311  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  28.83 
 
 
523 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0412601  hitchhiker  0.0081583 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10561  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  29.83 
 
 
523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  28 
 
 
498 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1099  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  30.87 
 
 
496 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.35 
 
 
476 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2998  NADH dehydrogenase subunit N  33.04 
 
 
481 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.55 
 
 
511 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0971  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  28.72 
 
 
511 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162781  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3447  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.86 
 
 
541 aa  162  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3293  NADH dehydrogenase subunit L  29.92 
 
 
617 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1935  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  28.81 
 
 
472 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.758736  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  33.43 
 
 
478 aa  162  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3405  NADH dehydrogenase subunit L  30.12 
 
 
617 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1620  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.12 
 
 
503 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  33.43 
 
 
478 aa  161  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.54 
 
 
962 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3667  NADH dehydrogenase (quinone)  29.05 
 
 
496 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  29.36 
 
 
501 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4474  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  31.54 
 
 
500 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220844  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0937  hydrogenase subunit F  28.88 
 
 
482 aa  160  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  29.57 
 
 
478 aa  160  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  29.16 
 
 
748 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  28.12 
 
 
511 aa  160  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.714815  normal  0.834911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  30.22 
 
 
501 aa  160  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3394  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  28.53 
 
 
485 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  28.77 
 
 
480 aa  159  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1936  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.25 
 
 
493 aa  159  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.118656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>