More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0700 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0700  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 484 aa  956    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.452975  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1304  NADH dehydrogenase (quinone)  47.26 
 
 		 480 aa  428  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4285  NADH dehydrogenase (quinone)  43.16 
 
 		 499 aa  362  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.14859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.92 
 
 		 495 aa  356  5e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2188  hydrogenase 4 subunit F  39.41 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0176  hydrogenase 4 subunit F  39.6 
 
 		 486 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6068  hydrogenase 4 subunit F  37.81 
 
 		 486 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  hitchhiker  0.00325517 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  37.2 
 
 		 521 aa  309  9e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0919  hydrogenase 4 subunit F  39.12 
 
 		 487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0326  hydrogenase 4 subunit F  40.62 
 
 		 486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  36.76 
 
 		 526 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  36.76 
 
 		 526 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4668  hydrogenase 4 subunit F  38.44 
 
 		 484 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.423781  normal  0.195535 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  36.54 
 
 		 526 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  36.54 
 
 		 526 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  36.54 
 
 		 526 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3289  hydrogenase 4 subunit F  39.85 
 
 		 484 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612532  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1264  hydrogenase 4 subunit F  39.23 
 
 		 463 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  36.98 
 
 		 526 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1139  hydrogenase 4 subunit F  37.92 
 
 		 488 aa  302  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0485021  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0108  hydrogenase 4 subunit F  39.57 
 
 		 486 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1614  hydrogenase 4 subunit F  39.57 
 
 		 486 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1529  hydrogenase 4 subunit F  39.57 
 
 		 486 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0794  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.62 
 
 		 489 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2858  hydrogenase 4 subunit F  36.76 
 
 		 517 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1281  hydrogenase 4 subunit F  40.78 
 
 		 538 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834276  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1810  hydrogenase 4 subunit F  37.66 
 
 		 484 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2152  hydrogenase 4 subunit F  37.66 
 
 		 484 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2712  hydrogenase 4 subunit F  37.73 
 
 		 553 aa  289  9e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0185  NADH dehydrogenase (quinone)  38.28 
 
 		 491 aa  287  4e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2463  NADH dehydrogenase (quinone)  37.47 
 
 		 493 aa  286  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.873938  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1911  hypothetical protein  36.68 
 
 		 493 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.262508  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1038  hydrogenase-4 component F  36.34 
 
 		 491 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000418597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0169  hydrogenase 4 subunit F  36.24 
 
 		 486 aa  283  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2477  hydrogenase 4 subunit F  35.46 
 
 		 481 aa  283  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.638656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1263  hydrogenase 4 subunit F  35.7 
 
 		 483 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336263 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0128  hydrogenase-4 component F  35.98 
 
 		 491 aa  282  9e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223921  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0932  hydrogenase 4 subunit F  35.63 
 
 		 483 aa  279  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  36.36 
 
 		 512 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3852  hydrogenase 4 subunit F  35.7 
 
 		 483 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1399  hydrogenase 4 subunit F  35.42 
 
 		 482 aa  269  7e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00980  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  34.24 
 
 		 533 aa  266  4e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.558351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0940  NADH dehydrogenase (quinone)  33.19 
 
 		 470 aa  263  4e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0548909  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0605  NADH dehydrogenase (quinone)  35.08 
 
 		 506 aa  263  8e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.62 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1865  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.63 
 
 		 489 aa  257  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0742  NAD-dependent dehydrogenase subunit  37.73 
 
 		 478 aa  256  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0889  NADH dehydrogenase (quinone)  34.49 
 
 		 477 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4466  NADH dehydrogenase (quinone)  34.88 
 
 		 428 aa  249  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0775  NADH dehydrogenase (quinone)  37.73 
 
 		 497 aa  249  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.485892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2988  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.88 
 
 		 537 aa  247  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0307877  hitchhiker  0.00569852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0339  NADH dehydrogenase (quinone)  32.94 
 
 		 477 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.466096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2598  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.08 
 
 		 478 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3216  Hydrogenase 4 membrane component (E)  37.27 
 
 		 483 aa  239  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.492531  normal  0.0423716 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3431  hypothetical protein  37.27 
 
 		 483 aa  239  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.677661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3189  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.88 
 
 		 477 aa  239  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1072  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.58 
 
 		 477 aa  239  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.41725e-34 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  33.7 
 
 		 531 aa  232  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0729  NADH dehydrogenase (quinone)  36.19 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0359188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2555  NADH dehydrogenase (quinone)  35.76 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3799  NADH dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.495272  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10087  hydrogenase hycQ  36.89 
 
 		 488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000498381  normal  0.186315 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3716  NADH dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0275464  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3658  NADH dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 		 476 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0372  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.49 
 
 		 477 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3784  NADH dehydrogenase (quinone)  34.33 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.688785  normal  0.510826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2621  NADH dehydrogenase (quinone)  36.01 
 
 		 478 aa  207  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.773397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4706  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.83 
 
 		 572 aa  203  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2459  NADH dehydrogenase (quinone)  27.85 
 
 		 480 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38611  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1994  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.09 
 
 		 440 aa  186  7e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1572  hydrogenase membrane subunit  27.68 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1124  hydrogenase membrane subunit  31.59 
 
 		 494 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.113605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1450  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit N-like protein  30.62 
 
 		 499 aa  179  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1428  hydrogenase 4 subunit F  33.59 
 
 		 431 aa  176  7e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.289915  normal  0.541686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1819  hydrogenase membrane subunit  30.43 
 
 		 489 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00530932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1318  hydrogenase membrane subunit  30.32 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  30.03 
 
 		 1265 aa  171  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  28.76 
 
 		 476 aa  169  9e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  30.73 
 
 		 671 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0184  NADH dehydrogenase (quinone)  31.28 
 
 		 487 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  33.61 
 
 		 673 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  28.69 
 
 		 1265 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  30.42 
 
 		 672 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  30.67 
 
 		 748 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0776  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.36 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.986701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  30.08 
 
 		 672 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  30.08 
 
 		 672 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  30.08 
 
 		 672 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  30.16 
 
 		 672 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  30.42 
 
 		 672 aa  156  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  32.95 
 
 		 662 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  29.3 
 
 		 1253 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  28.69 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  30.64 
 
 		 669 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  31.22 
 
 		 674 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  31.18 
 
 		 737 aa  153  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.51 
 
 		 499 aa  153  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  28.78 
 
 		 1245 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  31.38 
 
 		 674 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  31.07 
 
 		 674 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>