More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1880 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 1245 aa  2446    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  49.05 
 
 		 1264 aa  990    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  41.76 
 
 		 1265 aa  782    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  50.28 
 
 		 1253 aa  989    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  39.28 
 
 		 1265 aa  737    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  36.41 
 
 		 500 aa  241  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  34.56 
 
 		 672 aa  204  8e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  34.81 
 
 		 671 aa  198  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  32.62 
 
 		 672 aa  189  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  35.96 
 
 		 748 aa  190  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  32.39 
 
 		 672 aa  189  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  32.39 
 
 		 672 aa  189  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  31.57 
 
 		 672 aa  188  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  34.55 
 
 		 673 aa  188  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  32.15 
 
 		 672 aa  187  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.72 
 
 		 472 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.97 
 
 		 605 aa  186  3e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  32.64 
 
 		 476 aa  186  3e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  34.99 
 
 		 497 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1601  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.58 
 
 		 499 aa  185  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.33 
 
 		 661 aa  184  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  31.91 
 
 		 672 aa  184  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  36.04 
 
 		 737 aa  183  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  35.18 
 
 		 667 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  30.89 
 
 		 662 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.17 
 
 		 499 aa  182  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1741  NADH dehydrogenase subunit M  29.66 
 
 		 604 aa  181  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.56797  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 		 531 aa  178  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  32.89 
 
 		 683 aa  178  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  31.78 
 
 		 644 aa  177  9e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  34.2 
 
 		 498 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  32.27 
 
 		 673 aa  176  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  32.26 
 
 		 501 aa  175  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  36.59 
 
 		 666 aa  175  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  30.3 
 
 		 617 aa  174  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  32.87 
 
 		 585 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  35.76 
 
 		 662 aa  174  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  36.96 
 
 		 666 aa  174  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  30.56 
 
 		 609 aa  173  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  32.61 
 
 		 669 aa  172  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.25 
 
 		 669 aa  172  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  29.83 
 
 		 644 aa  171  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.64 
 
 		 501 aa  171  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  33.49 
 
 		 669 aa  170  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  37.57 
 
 		 665 aa  170  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  33.42 
 
 		 470 aa  170  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  33.97 
 
 		 668 aa  168  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0890  NADH dehydrogenase subunit M  26.92 
 
 		 613 aa  168  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.514114  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  31.98 
 
 		 649 aa  168  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.42 
 
 		 492 aa  167  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3628  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.93 
 
 		 487 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 577 aa  166  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  30.54 
 
 		 473 aa  166  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  34.6 
 
 		 679 aa  165  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.74 
 
 		 500 aa  165  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1634  NADH dehydrogenase (quinone)  33.83 
 
 		 490 aa  165  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181583  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  31.71 
 
 		 655 aa  165  5.0000000000000005e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  31.35 
 
 		 512 aa  165  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2288  NADH dehydrogenase (quinone)  31.07 
 
 		 488 aa  165  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 		 480 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  34.88 
 
 		 687 aa  165  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  30.87 
 
 		 506 aa  165  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.81 
 
 		 492 aa  164  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.51 
 
 		 542 aa  164  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.02 
 
 		 513 aa  164  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.14 
 
 		 507 aa  164  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  30.75 
 
 		 499 aa  163  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  31.7 
 
 		 674 aa  162  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.25 
 
 		 966 aa  162  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.59 
 
 		 495 aa  162  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3626  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.39 
 
 		 586 aa  162  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  34.88 
 
 		 669 aa  162  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2210  NADH dehydrogenase (quinone)  31.97 
 
 		 1047 aa  162  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129844 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0744  NADH dehydrogenase (quinone)  32.73 
 
 		 504 aa  161  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  33.53 
 
 		 526 aa  161  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  33.53 
 
 		 526 aa  161  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.647759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  33.53 
 
 		 526 aa  161  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  33.53 
 
 		 526 aa  161  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  33.53 
 
 		 526 aa  161  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  33.72 
 
 		 521 aa  161  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  33.72 
 
 		 526 aa  160  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  34.91 
 
 		 640 aa  160  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1217  NADH dehydrogenase subunit M  28.27 
 
 		 614 aa  160  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  29.47 
 
 		 655 aa  159  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3285  NADH dehydrogenase (quinone)  30.05 
 
 		 496 aa  160  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0676667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3954  NADH dehydrogenase (quinone)  29.78 
 
 		 497 aa  159  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  30.6 
 
 		 501 aa  159  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  30.4 
 
 		 486 aa  159  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2188  hydrogenase 4 subunit F  31.65 
 
 		 495 aa  159  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.54 
 
 		 943 aa  159  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  32.95 
 
 		 723 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  30.91 
 
 		 481 aa  158  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  31.81 
 
 		 748 aa  157  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2223  NADH dehydrogenase (quinone)  32.45 
 
 		 496 aa  157  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5152  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.59 
 
 		 651 aa  157  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.78 
 
 		 566 aa  157  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479761  normal  0.594337 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  31.25 
 
 		 650 aa  157  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  31.98 
 
 		 671 aa  157  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01550  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  34.38 
 
 		 505 aa  156  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.48 
 
 		 492 aa  157  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>