More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1396 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0166  hydrogenase 4 subunit B  61.46 
 
 		 681 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  57.63 
 
 		 687 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  100 
 
 		 671 aa  1270    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  56.82 
 
 		 669 aa  648    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  55.95 
 
 		 672 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  58.17 
 
 		 672 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  41.76 
 
 		 674 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  41.37 
 
 		 669 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  42.19 
 
 		 748 aa  395  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  40.52 
 
 		 674 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  41.86 
 
 		 674 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  41.31 
 
 		 669 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  37.84 
 
 		 673 aa  359  7e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  40.63 
 
 		 669 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  40.12 
 
 		 668 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  41.04 
 
 		 668 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  41.04 
 
 		 668 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1807  hydrogenase 4 subunit B  43.28 
 
 		 660 aa  350  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2149  hydrogenase 4 subunit B  43.28 
 
 		 660 aa  350  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.33721  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  40.16 
 
 		 683 aa  343  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  32.89 
 
 		 662 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.51 
 
 		 661 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  38.88 
 
 		 649 aa  331  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  38.15 
 
 		 671 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  35.49 
 
 		 644 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  37.14 
 
 		 669 aa  310  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  36.98 
 
 		 673 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  34.74 
 
 		 644 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  35.66 
 
 		 672 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  35.11 
 
 		 672 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  37.29 
 
 		 679 aa  302  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  35.81 
 
 		 672 aa  302  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  35.11 
 
 		 672 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  35.65 
 
 		 672 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  37.19 
 
 		 669 aa  301  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  33.44 
 
 		 633 aa  301  4e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.95 
 
 		 688 aa  300  8e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  35.38 
 
 		 672 aa  300  8e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  36.73 
 
 		 617 aa  297  4e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  35.16 
 
 		 672 aa  296  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.4 
 
 		 669 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  40.39 
 
 		 668 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  40.13 
 
 		 654 aa  283  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  36.08 
 
 		 637 aa  281  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 		 662 aa  279  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4703  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.73 
 
 		 662 aa  279  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.98 
 
 		 659 aa  277  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.69 
 
 		 659 aa  274  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2601  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.87 
 
 		 660 aa  270  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  35.47 
 
 		 661 aa  270  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  36.04 
 
 		 737 aa  269  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  35.99 
 
 		 667 aa  265  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  37.18 
 
 		 666 aa  261  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  45.29 
 
 		 654 aa  260  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  35.32 
 
 		 646 aa  259  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  35.97 
 
 		 577 aa  259  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4469  NADH dehydrogenase (quinone)  37.56 
 
 		 664 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.16 
 
 		 666 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.28 
 
 		 666 aa  251  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  37.72 
 
 		 640 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  32.9 
 
 		 655 aa  246  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  33.76 
 
 		 655 aa  244  5e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  45.02 
 
 		 666 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2985  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.6 
 
 		 674 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0690807  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  36.75 
 
 		 643 aa  238  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  35.4 
 
 		 663 aa  236  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  44.86 
 
 		 666 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  37.42 
 
 		 665 aa  236  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  33.68 
 
 		 674 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3796  NADH dehydrogenase (quinone)  39 
 
 		 654 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3713  NADH dehydrogenase (quinone)  45.8 
 
 		 654 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.117424  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  32.46 
 
 		 723 aa  232  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  45.45 
 
 		 665 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  35.19 
 
 		 682 aa  229  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  28.99 
 
 		 650 aa  226  8e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.3 
 
 		 646 aa  224  3e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2859  formate hydrogenlyase subunit 3  31.09 
 
 		 608 aa  198  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02573  NADH dehydrogenase subunit N  31.09 
 
 		 608 aa  198  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.621394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3974  formate hydrogenlyase subunit 3  31.09 
 
 		 608 aa  198  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0966  NADH dehydrogenase (quinone)  31.09 
 
 		 608 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0989  formate hydrogenlyase subunit 3  31.09 
 
 		 608 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.180245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3011  formate hydrogenlyase subunit 3  31.09 
 
 		 608 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2848  formate hydrogenlyase subunit 3  31.09 
 
 		 608 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3054  formate hydrogenlyase subunit 3  30.65 
 
 		 608 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.920212  normal  0.22505 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3196  formate hydrogenlyase subunit 3  31.07 
 
 		 608 aa  190  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3038  formate hydrogenlyase subunit 3  30.12 
 
 		 608 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419635 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3161  formate hydrogenlyase subunit 3  30.72 
 
 		 608 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3003  formate hydrogenlyase subunit 3  30.12 
 
 		 608 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2972  formate hydrogenlyase subunit 3  30.34 
 
 		 608 aa  187  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  34.99 
 
 		 1264 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3780  NADH dehydrogenase (quinone)  44.69 
 
 		 670 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0116247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  29.96 
 
 		 633 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  29.96 
 
 		 633 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  29.89 
 
 		 500 aa  179  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.78 
 
 		 513 aa  177  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3276  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 671 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.96 
 
 		 959 aa  175  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.03 
 
 		 522 aa  173  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.12 
 
 		 523 aa  170  7e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  29.8 
 
 		 748 aa  170  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>