More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0132 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  100 
 
 
650 aa  1280    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  43.64 
 
 
655 aa  574  1.0000000000000001e-162  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  41.92 
 
 
655 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  47.58 
 
 
646 aa  555  1e-157  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000307213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  37.69 
 
 
673 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  34.05 
 
 
671 aa  343  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  35.3 
 
 
672 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  33.16 
 
 
672 aa  327  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  33.16 
 
 
672 aa  327  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  33.16 
 
 
672 aa  327  6e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  32.99 
 
 
672 aa  326  7e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  33.16 
 
 
672 aa  326  8.000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  32.66 
 
 
672 aa  325  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
683 aa  313  7.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  32.15 
 
 
673 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  32.53 
 
 
679 aa  296  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  30.4 
 
 
748 aa  290  8e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  35.24 
 
 
662 aa  289  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.33 
 
 
661 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.35 
 
 
668 aa  266  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  40.05 
 
 
688 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  32.97 
 
 
737 aa  265  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  31.39 
 
 
667 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  31.76 
 
 
669 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  31.74 
 
 
687 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  29.76 
 
 
669 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  29.98 
 
 
674 aa  256  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  30.03 
 
 
674 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  27.82 
 
 
637 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  37.03 
 
 
654 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  29.03 
 
 
649 aa  252  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  29.75 
 
 
654 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  26.85 
 
 
662 aa  251  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2601  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.96 
 
 
660 aa  250  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  32.06 
 
 
644 aa  249  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  30.24 
 
 
661 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  31.5 
 
 
644 aa  248  4e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  31.4 
 
 
666 aa  244  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  29.69 
 
 
672 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  28.33 
 
 
669 aa  241  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  32.56 
 
 
617 aa  240  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  28.76 
 
 
669 aa  240  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3054  formate hydrogenlyase subunit 3  29.7 
 
 
608 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.920212  normal  0.22505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.24 
 
 
669 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  28.76 
 
 
668 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  28.35 
 
 
643 aa  238  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  29.05 
 
 
668 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  29.05 
 
 
668 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 
577 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  27.72 
 
 
669 aa  234  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0166  hydrogenase 4 subunit B  30.28 
 
 
681 aa  233  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970512  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.9 
 
 
659 aa  233  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  28.89 
 
 
674 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  29.69 
 
 
672 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 
723 aa  231  5e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3796  NADH dehydrogenase (quinone)  37.69 
 
 
654 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3713  NADH dehydrogenase (quinone)  37.79 
 
 
654 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.117424  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  28.28 
 
 
669 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3003  formate hydrogenlyase subunit 3  29.7 
 
 
608 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2972  formate hydrogenlyase subunit 3  29.7 
 
 
608 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.67 
 
 
659 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3038  formate hydrogenlyase subunit 3  29.7 
 
 
608 aa  227  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419635 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3161  formate hydrogenlyase subunit 3  29.7 
 
 
608 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.253093 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0966  NADH dehydrogenase (quinone)  30.16 
 
 
608 aa  226  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02573  NADH dehydrogenase subunit N  30.16 
 
 
608 aa  226  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.621394  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2985  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.78 
 
 
674 aa  226  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0690807  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3974  formate hydrogenlyase subunit 3  29.96 
 
 
608 aa  226  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  33.52 
 
 
663 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3011  formate hydrogenlyase subunit 3  29.96 
 
 
608 aa  226  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2859  formate hydrogenlyase subunit 3  30.16 
 
 
608 aa  226  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2848  formate hydrogenlyase subunit 3  29.96 
 
 
608 aa  225  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.264273 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0989  formate hydrogenlyase subunit 3  30.16 
 
 
608 aa  225  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.180245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  33.42 
 
 
666 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  30.4 
 
 
646 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  32.57 
 
 
633 aa  223  6e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  30.98 
 
 
674 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3196  formate hydrogenlyase subunit 3  31.14 
 
 
608 aa  222  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.79 
 
 
666 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.45 
 
 
666 aa  220  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  35.16 
 
 
665 aa  217  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  33.82 
 
 
666 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  33.42 
 
 
665 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2149  hydrogenase 4 subunit B  30.9 
 
 
660 aa  205  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.33721  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4703  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.06 
 
 
662 aa  205  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1807  hydrogenase 4 subunit B  30.9 
 
 
660 aa  205  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370569  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4469  NADH dehydrogenase (quinone)  27.75 
 
 
664 aa  203  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  27 
 
 
640 aa  201  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  29.52 
 
 
671 aa  201  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3276  NADH dehydrogenase (quinone)  30.51 
 
 
671 aa  195  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  28.27 
 
 
682 aa  184  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  27.64 
 
 
633 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  27.64 
 
 
633 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  32.51 
 
 
512 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.97 
 
 
495 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0184  NADH dehydrogenase (quinone)  32.55 
 
 
487 aa  169  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  32.97 
 
 
531 aa  169  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  29.07 
 
 
620 aa  166  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.34 
 
 
522 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3780  NADH dehydrogenase (quinone)  35.63 
 
 
670 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0116247  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  29.78 
 
 
620 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>