More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3196 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02573  NADH dehydrogenase subunit N  74.34 
 
 		 608 aa  868    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.621394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0966  NADH dehydrogenase (quinone)  74.18 
 
 		 608 aa  868    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3196  formate hydrogenlyase subunit 3  100 
 
 		 608 aa  1190    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3038  formate hydrogenlyase subunit 3  76.64 
 
 		 608 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419635 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2848  formate hydrogenlyase subunit 3  74.18 
 
 		 608 aa  869    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3054  formate hydrogenlyase subunit 3  76.48 
 
 		 608 aa  884    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.920212  normal  0.22505 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3161  formate hydrogenlyase subunit 3  76.32 
 
 		 608 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2972  formate hydrogenlyase subunit 3  76.81 
 
 		 608 aa  866    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0989  formate hydrogenlyase subunit 3  74.34 
 
 		 608 aa  869    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.180245 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2859  formate hydrogenlyase subunit 3  74.34 
 
 		 608 aa  868    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3003  formate hydrogenlyase subunit 3  76.64 
 
 		 608 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3011  formate hydrogenlyase subunit 3  74.18 
 
 		 608 aa  867    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3974  formate hydrogenlyase subunit 3  74.01 
 
 		 608 aa  867    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2432  NADH dehydrogenase (quinone)  46.23 
 
 		 622 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  36.12 
 
 		 671 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  38.28 
 
 		 673 aa  334  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  38.7 
 
 		 672 aa  325  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  38.51 
 
 		 672 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  38.51 
 
 		 672 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  38.51 
 
 		 672 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  37.8 
 
 		 672 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  37.92 
 
 		 672 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  37.91 
 
 		 673 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  40.27 
 
 		 679 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  36.75 
 
 		 672 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.65 
 
 		 661 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  32.58 
 
 		 655 aa  247  4e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  34.67 
 
 		 668 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  31.83 
 
 		 655 aa  245  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  31.14 
 
 		 650 aa  241  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  32.14 
 
 		 644 aa  239  1e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  35.65 
 
 		 669 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  31.42 
 
 		 617 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  33.82 
 
 		 683 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.55 
 
 		 646 aa  233  9e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  37.68 
 
 		 654 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  31.04 
 
 		 669 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  34.58 
 
 		 667 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  34.98 
 
 		 649 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  34.76 
 
 		 662 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  30.44 
 
 		 644 aa  228  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.56 
 
 		 669 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.36 
 
 		 666 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.82 
 
 		 666 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  30.09 
 
 		 662 aa  219  8.999999999999998e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  37.24 
 
 		 654 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  35.18 
 
 		 661 aa  212  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  31.69 
 
 		 674 aa  209  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  32.41 
 
 		 669 aa  208  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  31.83 
 
 		 674 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  32.84 
 
 		 669 aa  207  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2601  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.47 
 
 		 660 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  30.36 
 
 		 674 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.73 
 
 		 659 aa  204  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  31.95 
 
 		 669 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.74 
 
 		 688 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  32.03 
 
 		 672 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  30.87 
 
 		 748 aa  200  7e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.12 
 
 		 659 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  35.62 
 
 		 666 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  33.4 
 
 		 672 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  30.16 
 
 		 669 aa  197  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3713  NADH dehydrogenase (quinone)  36.99 
 
 		 654 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.117424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3796  NADH dehydrogenase (quinone)  38.03 
 
 		 654 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273036  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  35.15 
 
 		 577 aa  193  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0166  hydrogenase 4 subunit B  30.06 
 
 		 681 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  33.18 
 
 		 737 aa  192  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  33.02 
 
 		 663 aa  190  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  30.99 
 
 		 687 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  31.11 
 
 		 723 aa  188  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3276  NADH dehydrogenase (quinone)  36.66 
 
 		 671 aa  186  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  30.09 
 
 		 668 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  32.96 
 
 		 646 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  30.78 
 
 		 668 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  30.78 
 
 		 668 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  27.08 
 
 		 633 aa  182  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  30.36 
 
 		 674 aa  177  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.29 
 
 		 522 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  33.07 
 
 		 637 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  30.2 
 
 		 671 aa  172  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  32.58 
 
 		 665 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  28.49 
 
 		 643 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  33.5 
 
 		 682 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4703  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.27 
 
 		 662 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2985  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.37 
 
 		 674 aa  153  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0690807  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1807  hydrogenase 4 subunit B  33.81 
 
 		 660 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2149  hydrogenase 4 subunit B  33.81 
 
 		 660 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.33721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  30.63 
 
 		 633 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  30.63 
 
 		 633 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  30.55 
 
 		 585 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  34.59 
 
 		 640 aa  144  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.05 
 
 		 523 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4469  NADH dehydrogenase (quinone)  35.77 
 
 		 664 aa  142  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.35 
 
 		 525 aa  141  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  28.33 
 
 		 512 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.31 
 
 		 605 aa  139  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  36.86 
 
 		 666 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  28.84 
 
 		 748 aa  136  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  26.3 
 
 		 500 aa  136  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  27.75 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>