More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3194 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 1264 aa  2467    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  61.29 
 
 		 1253 aa  1374    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  43.69 
 
 		 1265 aa  902    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  44 
 
 		 1265 aa  895    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  48.26 
 
 		 1245 aa  959    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  34.68 
 
 		 500 aa  246  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2210  NADH dehydrogenase (quinone)  27.55 
 
 		 1047 aa  231  8e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  37 
 
 		 674 aa  219  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  38.24 
 
 		 671 aa  214  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  35.47 
 
 		 748 aa  214  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  34.68 
 
 		 673 aa  211  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.12 
 
 		 661 aa  201  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  31.55 
 
 		 499 aa  201  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  37.29 
 
 		 679 aa  199  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  34.47 
 
 		 673 aa  199  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  32.7 
 
 		 669 aa  198  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  35.42 
 
 		 748 aa  197  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  31.17 
 
 		 687 aa  197  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  32.51 
 
 		 672 aa  196  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  32.74 
 
 		 672 aa  196  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  32.51 
 
 		 672 aa  196  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 501 aa  195  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  39.55 
 
 		 666 aa  195  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.52 
 
 		 472 aa  195  6e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  32.36 
 
 		 672 aa  194  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  33.06 
 
 		 669 aa  195  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 		 672 aa  194  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1280  NADH dehydrogenase (quinone)  35.43 
 
 		 499 aa  193  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  31.09 
 
 		 476 aa  191  5e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  32.06 
 
 		 672 aa  192  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  39.22 
 
 		 666 aa  191  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  34.27 
 
 		 792 aa  191  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  30.49 
 
 		 480 aa  191  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.72 
 
 		 501 aa  191  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  34.35 
 
 		 609 aa  190  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1634  NADH dehydrogenase (quinone)  34.77 
 
 		 490 aa  189  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181583  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  33.07 
 
 		 662 aa  189  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  34.67 
 
 		 531 aa  189  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  38.87 
 
 		 665 aa  189  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.16 
 
 		 605 aa  188  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  31.47 
 
 		 617 aa  188  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.22 
 
 		 669 aa  188  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  31.62 
 
 		 644 aa  187  8e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.51 
 
 		 523 aa  187  9e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  32.14 
 
 		 672 aa  187  9e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.69 
 
 		 522 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.49 
 
 		 790 aa  185  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.01 
 
 		 801 aa  184  8.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  31.83 
 
 		 506 aa  184  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  32.29 
 
 		 649 aa  184  9.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  34.23 
 
 		 497 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  31.15 
 
 		 644 aa  184  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  34.39 
 
 		 498 aa  184  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  34.02 
 
 		 683 aa  183  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  31.15 
 
 		 473 aa  183  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  33.52 
 
 		 643 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.01 
 
 		 492 aa  181  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  32.64 
 
 		 737 aa  180  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  29.71 
 
 		 662 aa  181  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0790  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.31 
 
 		 500 aa  180  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3532  NADH dehydrogenase (quinone)  30.84 
 
 		 480 aa  181  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  29.18 
 
 		 486 aa  180  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.18 
 
 		 513 aa  180  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.25 
 
 		 507 aa  179  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  33.6 
 
 		 470 aa  179  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0845  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.72 
 
 		 698 aa  178  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2966  NADH dehydrogenase (quinone)  32.16 
 
 		 501 aa  178  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278298 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.15 
 
 		 525 aa  178  6e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0751  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.83 
 
 		 542 aa  177  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0890  NADH dehydrogenase subunit M  29.41 
 
 		 613 aa  177  9e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.514114  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1601  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31 
 
 		 499 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.83 
 
 		 959 aa  176  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.86 
 
 		 659 aa  176  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  31.47 
 
 		 505 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.01 
 
 		 492 aa  175  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.39 
 
 		 769 aa  175  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  34.11 
 
 		 577 aa  174  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  32.8 
 
 		 585 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  32 
 
 		 493 aa  174  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.12 
 
 		 1024 aa  174  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  32.6 
 
 		 674 aa  174  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  33.98 
 
 		 501 aa  174  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.01 
 
 		 975 aa  174  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.94 
 
 		 943 aa  173  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  34.75 
 
 		 667 aa  173  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  35.19 
 
 		 668 aa  172  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.32 
 
 		 659 aa  172  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  38.62 
 
 		 654 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  32.44 
 
 		 674 aa  172  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2529  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.14 
 
 		 766 aa  172  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.997639  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  32.76 
 
 		 655 aa  172  5e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1606  NADH dehydrogenase subunit M  30 
 
 		 626 aa  172  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.84 
 
 		 969 aa  171  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  35.69 
 
 		 661 aa  171  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3667  NADH dehydrogenase (quinone)  32.02 
 
 		 496 aa  171  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0284  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  30.28 
 
 		 517 aa  171  8e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  35.04 
 
 		 672 aa  171  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.26 
 
 		 566 aa  171  9e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479761  normal  0.594337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  33.76 
 
 		 793 aa  170  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  32.22 
 
 		 669 aa  171  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>