More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3712 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
666 aa  1217    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  94.29 
 
 
665 aa  866    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  98.05 
 
 
666 aa  1192    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3780  NADH dehydrogenase (quinone)  73.61 
 
 
670 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0116247  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  41.52 
 
 
669 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2601  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  40.71 
 
 
660 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  44.37 
 
 
668 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  38.47 
 
 
669 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  41.69 
 
 
661 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  41.72 
 
 
667 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  40.16 
 
 
666 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.05 
 
 
669 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.28 
 
 
659 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.29 
 
 
659 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  41.57 
 
 
662 aa  365  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.19 
 
 
666 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  37.12 
 
 
665 aa  347  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.06 
 
 
666 aa  342  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  39.69 
 
 
577 aa  335  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  44.28 
 
 
654 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  38.73 
 
 
663 aa  335  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3796  NADH dehydrogenase (quinone)  47.41 
 
 
654 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273036  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  39.21 
 
 
682 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  31.8 
 
 
723 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3713  NADH dehydrogenase (quinone)  48.1 
 
 
654 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.117424  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  52.67 
 
 
654 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  35.17 
 
 
673 aa  316  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  36.47 
 
 
671 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  41.67 
 
 
748 aa  312  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  37.19 
 
 
683 aa  306  7e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.66 
 
 
688 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  34.38 
 
 
672 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  31.59 
 
 
662 aa  302  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  40.27 
 
 
672 aa  301  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  39.82 
 
 
672 aa  301  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  40.05 
 
 
672 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  40.05 
 
 
672 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  40.05 
 
 
672 aa  300  5e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  39.82 
 
 
672 aa  300  8e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  39.65 
 
 
687 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  38.14 
 
 
646 aa  295  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  39.87 
 
 
672 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  36.08 
 
 
669 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  37.5 
 
 
674 aa  283  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  37.87 
 
 
672 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  36.52 
 
 
669 aa  280  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  31.64 
 
 
655 aa  278  2e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  37.57 
 
 
669 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  43.14 
 
 
737 aa  277  4e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  30.56 
 
 
655 aa  276  7e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  31.94 
 
 
644 aa  276  7e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  37.58 
 
 
674 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  41.51 
 
 
679 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.69 
 
 
661 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  35.02 
 
 
674 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  41.35 
 
 
673 aa  273  8.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  32.13 
 
 
644 aa  272  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3276  NADH dehydrogenase (quinone)  35.17 
 
 
671 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  33.71 
 
 
649 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  35.86 
 
 
637 aa  270  8.999999999999999e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0166  hydrogenase 4 subunit B  41.26 
 
 
681 aa  267  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970512  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  36.54 
 
 
669 aa  264  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1807  hydrogenase 4 subunit B  38.43 
 
 
660 aa  263  8.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370569  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2149  hydrogenase 4 subunit B  38.43 
 
 
660 aa  263  8.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.33721  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  36.82 
 
 
668 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  26.91 
 
 
650 aa  261  2e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  31.51 
 
 
617 aa  259  9e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  32.29 
 
 
643 aa  259  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  35.77 
 
 
668 aa  258  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  35.77 
 
 
668 aa  258  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4469  NADH dehydrogenase (quinone)  38.75 
 
 
664 aa  250  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  39.82 
 
 
671 aa  249  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  33.58 
 
 
674 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  30.8 
 
 
633 aa  238  3e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.69 
 
 
646 aa  229  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000307213  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4703  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  40.93 
 
 
662 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  40.6 
 
 
640 aa  217  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2985  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.72 
 
 
674 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0690807  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  35.55 
 
 
1264 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  37.06 
 
 
1245 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  35.07 
 
 
512 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  31.99 
 
 
500 aa  188  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0184  NADH dehydrogenase (quinone)  33.78 
 
 
487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  29.93 
 
 
633 aa  184  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  29.93 
 
 
633 aa  184  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2712  hydrogenase 4 subunit F  38.64 
 
 
553 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1281  hydrogenase 4 subunit F  37.4 
 
 
538 aa  177  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834276  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2188  hydrogenase 4 subunit F  34.82 
 
 
495 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3054  formate hydrogenlyase subunit 3  35.71 
 
 
608 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.920212  normal  0.22505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  36.97 
 
 
1253 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  36.26 
 
 
521 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  36.26 
 
 
526 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.84 
 
 
953 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  35.98 
 
 
526 aa  174  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  35.98 
 
 
526 aa  174  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00980  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  30.6 
 
 
533 aa  174  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.558351  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  35.69 
 
 
526 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  35.69 
 
 
526 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  35.69 
 
 
526 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3003  formate hydrogenlyase subunit 3  35.46 
 
 
608 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>