More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0955 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0955  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  100 
 
 		 523 aa  1025    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00424687  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  64.11 
 
 		 522 aa  666    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  59.35 
 
 		 525 aa  599  1e-170  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  33.02 
 
 		 585 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.59 
 
 		 513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.66 
 
 		 492 aa  204  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  33.47 
 
 		 673 aa  204  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.88 
 
 		 492 aa  203  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  28.54 
 
 		 748 aa  196  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.81 
 
 		 499 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  32.6 
 
 		 609 aa  194  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  32.76 
 
 		 501 aa  193  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  30.93 
 
 		 500 aa  194  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.14 
 
 		 472 aa  193  6e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.43 
 
 		 492 aa  190  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  31.38 
 
 		 501 aa  189  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  32.03 
 
 		 498 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.59 
 
 		 501 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  31.15 
 
 		 498 aa  187  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  33.65 
 
 		 662 aa  187  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  33.26 
 
 		 505 aa  186  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  32.95 
 
 		 476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  32.55 
 
 		 671 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 473 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0875  hydrogenase subunit F  35.61 
 
 		 482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00115046 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1781  hydrogenase subunit F  34.72 
 
 		 482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1042  hydrogenase subunit F  34.72 
 
 		 482 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.42 
 
 		 605 aa  184  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  31.92 
 
 		 1264 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2863  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.54 
 
 		 498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.845476  normal  0.745609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  31.75 
 
 		 470 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  31.08 
 
 		 683 aa  177  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 		 498 aa  177  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  32.61 
 
 		 504 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0937  hydrogenase subunit F  33.5 
 
 		 482 aa  176  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.91 
 
 		 507 aa  176  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.69 
 
 		 669 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  35.31 
 
 		 577 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1606  NADH dehydrogenase subunit M  30.82 
 
 		 626 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  31.21 
 
 		 687 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  31.58 
 
 		 672 aa  174  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.36 
 
 		 500 aa  174  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1217  NADH dehydrogenase subunit M  29.64 
 
 		 614 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  32.21 
 
 		 1265 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1353  hydrogenase subunit F  35.14 
 
 		 481 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.178859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  31.35 
 
 		 672 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  32.93 
 
 		 1265 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  32.9 
 
 		 674 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  31.35 
 
 		 672 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  31.55 
 
 		 672 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 		 669 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  31.09 
 
 		 1253 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0218073 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  31.12 
 
 		 672 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  31.12 
 
 		 672 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.83 
 
 		 666 aa  170  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3531  NADH dehydrogenase (quinone)  35.02 
 
 		 610 aa  170  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.64 
 
 		 661 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  30.1 
 
 		 500 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  29.25 
 
 		 500 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.04 
 
 		 801 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.94 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  32.33 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  32.46 
 
 		 673 aa  169  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  31.98 
 
 		 654 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.1 
 
 		 790 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1673  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.22 
 
 		 604 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.44 
 
 		 666 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.79 
 
 		 501 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  31.13 
 
 		 667 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  31.7 
 
 		 649 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  30.19 
 
 		 644 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  30.8 
 
 		 504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2925  NADH dehydrogenase (quinone)  32 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0483803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  31.06 
 
 		 617 aa  164  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.28 
 
 		 668 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  29.72 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  32.76 
 
 		 511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  29.36 
 
 		 505 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1741  NADH dehydrogenase subunit M  28.34 
 
 		 604 aa  164  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.56797  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  32.59 
 
 		 672 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12060  NADH dehydrogenase I subunit L  29.6 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000252399  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  28.85 
 
 		 644 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1772  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  28.15 
 
 		 499 aa  161  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0314  hydrogenase 4 subunit D  29.2 
 
 		 505 aa  161  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167658  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.77 
 
 		 538 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  31.04 
 
 		 737 aa  160  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0286  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit N  29.9 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000250262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.16 
 
 		 538 aa  160  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2223  NADH dehydrogenase (quinone)  30.14 
 
 		 496 aa  159  8e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.02 
 
 		 799 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2712  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.96 
 
 		 574 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2286  NADH dehydrogenase (quinone)  30.84 
 
 		 437 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0890  NADH dehydrogenase subunit M  29.52 
 
 		 613 aa  158  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.514114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  36.21 
 
 		 669 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14770  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.03 
 
 		 510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  29.98 
 
 		 655 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0403  sodium/proton antiporter protein  28.63 
 
 		 499 aa  157  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  29.29 
 
 		 674 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  31.32 
 
 		 679 aa  156  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  37.65 
 
 		 663 aa  156  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>